BGIOSGA014172
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA014172 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA014172, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0015K02.19 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA014172-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA014172-PA |
| Length |
6038 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:32829717..32835754 |
| Sequence Coding Region |
32835575..32835754,32834927..32834965,32834724..32834777,32834570..32834633,32833845..32833903 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:32829717..32835754 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:32829717..32835754 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGCGTCCGAGAGGCAGGAAGCGTGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGAGGAGGACTCCAGCAAGCCGGAGGCTGCAGAGGCGAAGAAGCCGGCCGCGCGGGGGCGGGGGAAGCGTGCCAAGGCGTCGCCCAAGCCCAAGCCGGAGACGGAGTACTTCCCCGAGAAGCGGAATCTGGAGGATCTTTGGCTATCAGCATTTCCGGTTGGGACCGAGTGGGAAAACATTGATAAGATAAAGGAGTTCAACTGGAACTTTGAAAATTTGGAGAAAGCACTAGAAGAAGGAGGGGAGCTTTATGGGAAAACAGTTTACTTGTTTGGAAGCACGGAGCCTCAACTATTGGAGGTTAATGGTGAATCGAAGATAGTGCTTATTCCTATAGTTGTTGCTGTTGACTGCCCTTTTCCTCCCTCAGACAAAATTGGCATAAATTCTGTCCAAAGGGAAAATGAAGAGATAGTGCCAATGAAGGCCATGAAGATGGCCTGGGTGCCTTATGTTCCGCTGGAGGATCGGCTTAGTAGGATTGACAGTTTGAAAACAAAAATATTTACTCTTGGCTGCACCCAGCGGAGGTCTGCGCTGAGGCACCTCAAAACTGAGAGAGTCAAATTGTTTGACTACTGCATGCCATATTATATGCCACTGAACCCTCCCGAAGACGAAGATGATACAGTTGTCAACATCATATATCCCCTAGAACCCCCGATAGTATGTGACTTCGACTGGGAGATGGATGATTACGAGGACTTTGCTGATGAGAAAGTTAAAGATGAGGTGCTACCAGAGGATGAGAAAGAAAAATTTAAGGAATTCATAAAGGAGAGGGTTAGAGAAAGGAAAAGAGAGCTAAAACAGGCTAAGGAAGCAAGAAAGAAAGCTATTGATGATATGGACCCTAAGGTCAAAGAGGCATTTGAAAATATCAAATTTTACAAATTTTATCCTGTAAAAACTCCAGACACCCCTGATGTAAGCAACGTAAAGGCAAAGTACATCAATAGATATTACAGGCATGCACATCATCTGATGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MARPRGRKRAAAAAAVAEEDSSKPEAAEAKKPAARGRGKRAKASPKPKPETEYFPEKRNLEDLWLSAFPVGTEWENIDKIKEFNWNFENLEKALEEGGELYGKTVYLFGSTEPQLLEVNGESKIVLIPIVVAVDCPFPPSDKIGINSVQRENEEIVPMKAMKMAWVPYVPLEDRLSRIDSLKTKIFTLGCTQRRSALRHLKTERVKLFDYCMPYYMPLNPPEDEDDTVVNIIYPLEPPIVCDFDWEMDDYEDFADEKVKDEVLPEDEKEKFKEFIKERVRERKRELKQAKEARKKAIDDMDPKVKEAFENIKFYKFYPVKTPDTPDVSNVKAKYINRYYRHAHHLM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..180#790..828#978..1031#1122..1185#1852..1910#2558..2682#2834..2893#3084..3142#3835..3908#5357..5395#5473..5535#5639..5686#5771..5899#5991..6038#ATGGCGCGTCCGAGAGGCAGGAAGCGTGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGAGGAGGACTCCAGCAAGCCGGAGGCTGCAGAGGCGAAGAAGCCGGCCGCGCGGGGGCGGGGGAAGCGTGCCAAGGCGTCGCCCAAGCCCAAGCCGGAGACGGAGTACTTCCCCGAGAAGCGGAATCTGGTGAGGAGGAGGCTTCCCCGATTACCTGTCTCGGATGCGTGCTTCGCTTCGCTTCGTTATGCCCCGATTAGGTTGGGGGGTTTGATTGGTCTGGATTCGTTTTGGCGTTGTGGACCGCGTGGTGTATTTGGTTGCTGCTTCTGCGGCGAGATTCGTAGTGGTCGGATTAGTCCAAATGATGGTAATGGTGGTTGATGTTGAAATACGAATGGTTAATATGTGACTGGATTTGGCTGGACTATAGGGGCTCCCCATTTCATTAGGAATAGTTTTTGTGTTGAATGTTATGTTGTAGAGTTTGAGCCACATCTGCGTGGGACTGAATTGTACAGTTTATGTTCTTCTAAGTCAGTGTTAGGAATAGTTTTTTTATTGTGAAGTGCTTTGCTATATGAAACGATTACTTGAATTTGTTATCGTGAAGTTTGAGCTATTATTGGAACGATGAAAACTCACATGGGTTTATTTAAGCAGTTCTAGGGCAATTAATTGTTTGGAAATGTGTTTGATGGATATAAAAGGAACGTTTGAGCATAATCAGTTTGTCTTTGCAAACAGGCAAAATGATTACTTATAGTTTTATGGCTAATATTGTGTTACTGTGTTCAGGAGGATCTTTGGCTATCAGCATTTCCGGTTGGGACCGAGGTTTGTTACTTTCTATGGGCCTATCTATTTCTTTCTTTTTTATTTATGGCTGAGTCAATTAGTGATGCATGTTTTGACATACATTCAACTGTGTACTATGGATATTTGCTCCGCTAACTATTATCCATATCCGGGCCTCTCATCTGCAGTGGGAAAACATTGATAAGATAAAGGAGTTCAACTGGAACTTTGAAAATTTGGAGGTACGATGGGCACATAGTATTCCAATACTACTCTTTTTTTATTATCACACTTGCTTTCAGCATGACATAAGGTTTCCTGTTGGTGAGCAGAAAGCACTAGAAGAAGGAGGGGAGCTTTATGGGAAAACAGTTTACTTGTTTGGAAGCACGGAGCGTAAGTTTTCATACTCGTGCTAGTTTTAAAATTAAATCTCCAGTTCGTGATACATATATTCTCCTACTGGCTTGCTAGCATTTAGTAACTGAACTAAACTGATTATATTAGCTTGTTTTTTTGTGTACTTTATGACATATAACTTGAAGGCCTGTTTTGAATGGTTTAATTTCACAGAAATAGTTATTCCCACAAGAACCATGTTATTTTTCTTTTTTGACGTTCCTGACAGACCTAAATATCAAATCTATCAGTTTGTTTGTTCCCCTGAAATTCACTAATTATGACTGCAGTAGCACCCTGAGAAAATTATATATTTCTCTGAACTTAGATGCACATTGTTGTAGATATACACTTGCATGTTTTTGTCATTACTGAAAGATTCTCTGGACATTTCCAACAATGAAATTGTCCCCTTTAGGACCATACTTCTATTTATTTCTTATGCTGTTTTTCCATGTCAATGTTCGAGTCGCTACTGCCTTTCCTAAGTTGATTGGTATCAGCATTTATTTGTTTTACCATGTGCACTTTAGATATGTTGGGTGTTGTCGTGGAAAAATGTTTTCTTGTCTCTGATATTTTCATTTGTTCTTGGGATGTGCCAGATTGTTTAAAAATCATCGATACAGTTTATCTGATTAAATTGTTTTTGCTGACATGCAGCTCAACTATTGGAGGTTAATGGTGAATCGAAGATAGTGCTTATTCCTATAGTTGTTGCTGTAAGTTCGCTTCCATTCTCTTGATATGGAAATTTGCATGAGGAAACAGTCCACTTTAGCAAATACTCTTAAATCTGAACATTTATCTCATGCTTATGCCAACTTGACATCTTATCCCGTTTATGCACCATCGCTAACAAGTTGATTTTACTAAGGTGACTATGTTTGTACTTCCTACCTCTGTCATTTTTGAAAGATGCCAGTACAAACATAGTCACCTTAGTTTCATAAAAGCCAATGGGAGTAATTTCCTTGGCGCTGTTTGGAAGAGCTAGCTGCAGCTAGCCAGCCAGCAGCTACAGGTGCTGCAGCCTGCCAGCAGTAAGCGGCTGCTTCCTGCAGCAGCCAAATACGCTGTGCCGCAGGGCTGGGCAGGGCAGCACAGCATAGCCTAGAACACTGCAGTAATGGCCTACCCAATGCCCCCCTTTTTTATATCACACTATTTTACTCTGGAATTTGTTTGTTTGCTCTTTAACCCTAACCTCTTTAAAATTGAGTATACAGTGCAATTTGGAAAACATTGTTTGGATACTTTATGGTTACAACGTCATTGGCAGTTGACTTGTTTATATATTACCGATTTTACTATTTACTTGCCTCATGTTGAATCTCATTTAGCACTTGCTACCTTTTCTGTGCTGCAGGTTGACTGCCCTTTTCCTCCCTCAGACAAAATTGGCATAAATTCTGTCCAAAGGGAAAATGAAGAGATAGTGCCAATGAAGGCCATGAAGATGGCCTGGGTGCCTTATGTTCCGCTGGAGGATCGGTACTCCCATACTATTAATTCTGAACAATATTTCTTACCATTTCTTTTGAGAACCTGTATCCTTACCTTGCTCCCTCATTAATGGCTTCTGTTTTTACCAATCATCATATGCAGCTTTGTGTTTTACTCATTCTTTTTTGTTGGTCTACAGGCTTAGTAGGATTGACAGTTTGAAAACAAAAATATTTACTCTTGGCTGCACCCAGCGGAGGTTAGTAATTCATGCTTTTTCCCTCCTTACTCGCGATTAATGCTTTATGGCATTTCTGGTTCTATTTTATTTTTGTTTGTTTGTTGGAACGTTATCATCCAGAAGCATGCAACATAAATTAACTGTTAACATCTTTCCCTAGATTTTTTTCTGACTAATTCTAGAGTATCCTCATTTGTATGTTTTGCAGGTCTGCGCTGAGGCACCTCAAAACTGAGAGAGTCAAATTGTTTGACTACTGCATGCCATGTAAGCTGACTTGGGATTATTTCTGTTGGCCTGTTTTGTGTGTACAAATATCTGTTTTCATAGGATTCTTTGAGTGCCTGTTAACTTGAGTGTGGTTCCTTGGCTTGGTCCAGTCCAATTGCAAAATATCCTGCAAGACATCGATGATGTCTTAGTTAAATGGTTGCAATGTCAGTATGCCATGGGATAAGAAGCTTTTTACTAGTCATTCTTTAATTCATTTCCATTCTGTTTCTGTATGACAATTTGTTAATTTCATTGGAATGGGTGAACGCTAGATATATTTACCTGCTATTGCTGCCATGCCTTTTGACTTTGATGAGCTTTTTAGCTGGCTTATTTGCCTGCGTTGGATGGTTAGTACTTAATTTTAATATAATAATTTGATGCCATTTACATATCCTGTGTTAACTTAGGAAGGCACTTCTTTCCAGCTATGTAACACTGTCTGTAGTGAGCCAGTTTTCAGTGTTGTTTGTGCCTTTAATGTTAGCAATTGTGGCACAAACATAGGCACACTGTGTAAGTCTTGTTATAAAGTGTGTGAGCATGGCGCAAGGTCAACAATCATGCTCAACTGGTTGATCAGATCATTTTATTTACATTGTTACACTTATATGATGCAGAGTGTTTTATGAAAATGGCTGAGAGTGATGTAGTCTGCAAATGAATCTCGTTTAATGTTGTTGCAGATTATATGCCACTGAACCCTCCCGAAGACGAAGATGATACAGTTGTCAACATCATATATCCCCTAGAACCCCCGGTAATCTTCTCTTAGTGTTTTTTGTTATTCCAGTATTGCCTAATAAATTTTCCTCAACATAAGCTATTAGTTTATTTTATGGAGGTATCTTATTAGTGCAAACCTAAAATATTATGTGTAATGGGCAAAACTAAAATAAATTTCTTGGATTGTGATCTTAATTAGGCCTATATTTGGGATTCATTAAGTCAGCTAGTCATTTTAGGGAAGAGCCCAGATGCAGCTGTATCTTCTCCACTGCTATAAACTGCATTGTTAACCTGGGCACCTGGCCTATGTGAGAAGATAAAATTTATCGTGTTTCACTGTTTCCTGCAGCTAAGAATTGATCTTCTCTTATTTGTATGCATCTCTAGGCTGCTTGCATCCATGTCATGATTGCCAGTTATGAATTCGTGTTCTTTTGCTTCATTTGCCTTAGCTTGTGAGGTCAAAACCAACCCACATGCTGCTGGTTCCCCTTGCCTACTTCTATGAAATCGTGACTTTTGCTGCTGTCATTTCTCGCGCTAGCACTCCTGCAATGTTGTATTGTTGTCACCTTCACTATTTTCAGTTGGATGCTTCTGAAGTTTGGTGTCTTGTGTCTGTTGAGTCAGGAGATGTGTACTTCTTTATGCTTCATTAATCTGAAAAAATATTTCCTATTTTGGTTTATTTATGTGTGCTTCTAGTTGCCTCTGCATGCGGACTATTTTCATCTTTAATTGCTTCTGTGTGCTGATTGTTTTCCTCTACGATTGCTGCTCCAGGATGATTATTTCCTAACTGCTGCCACATGCTTATAAATTCCCTCTTAATTGCTGTTGCATAGACGTACTGATTGTTTCCCTCTAAATCGAATAATTGCTGCTTGCTGGGCTGGCGTTATGGCATTGCTTAGTCTGTCAGCATAATTGCATAGGTGTACATGTGGTGTTTTCATGCCACCTACACTCAAGTTTGACCGGTAGGCAGTTGTGCAATCATGTCAGTCTTGATCTTTCAGGCTGGTCACTTACAGGTTGTTTTGGTTTGAGGAATCACCACATGAAAACCATCTTGGACAGGACGATCCATCATAGGATCATCCCACAAAATCTGAGGAATGGCTCCATTCCTCATCCAATAGCTTAGCATTTGCTTTTGAGGAATGAGGTGATGGACAAACCCATTTCATTCCTCGAACCAAACAGGATCACTATTGAGTCACTGGATGGAAGCTTAGTTGCAGTGTTTATTTCCTGCTATTGATACAAACATTTCATTGTTCTGAAGCGATAATGTAGCCTGAGTCACTTGGTTCTTAGCTGATATAAACACTGAAGTTATTATGTTCACGTAGATGCCTCCAATGTTGATATTTATTAGATTTACTTGTATTGCTTATGTTCACCTAGATGCCTCCAATGTTGATAACGTAGCAGTCATCAAATTATTTTGTATTCACATTGTACTGCTTATTGCAGATAGTATGTGACTTCGACTGGGAGATGGATGATTACGAGGTTTGTACTAATTTGGTTGTTTTGCTTGATGCTTCCTATGAAAGGCACCTGCATTGAGTCATTCTGTTGCAATGCAGGACTTTGCTGATGAGAAAGTTAAAGATGAGGTGCTACCAGAGGATGAGAAAGAAAAATTTAAGGTGCATCTTAATTTTTTGCTTAAGCTGTCAGAAGAATAGTCAGTCTATAATAATTACCTCACTGAGTACTCCTTCCTAACTGCTGACACATTTCTTTTAACAGGAATTCATAAAGGAGAGGGTTAGAGAAAGGAAAAGAGAGCTAAAACAGGTCATAGTCAAACGAAATGTTAATTGCCTTCACCAGATACTTTAATGCATTCAAGTACTAACTGTTTCTCCAAATCTTATGCAGGCTAAGGAAGCAAGAAAGAAAGCTATTGATGATATGGACCCTAAGGTCAAAGAGGCATTTGAAAATATCAAATTTTACAAATTTTATCCTGTAAAAACTCCAGACACCCCTGATGTAAGCAACGTAAAGGTATGTGACATTGCAGCTCAGGTGTATCTTGGAACAGTTGATTATGCATATAGTTGTCTTGGCTTTAACTCCTGTATCTACTGTATTGCAGGCAAAGTACATCAATAGATATTACAGGCATGCACATCATCTGATGTAA</dnaseqindica> 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