BGIOSGA015213

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA015213

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015213, complete gene.

LocusTag

OsI_15615

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA015213-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA015213-PA

Length

10060

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:16232616..16242675

Sequence Coding Region

16242406..16242675,16241367..16241649,16241255..16241283,16241071..16241172,16239804..16239872
,16239645..16239704,16239056..16239169,16238358..16238406,16237868..16237974
,16237016..16237108,16235860..16235973,16235120..16235224,16234983..16235007
,16233820..16233941,16233583..16233729,16233133..16233185,16232922..16233021
,16232616..16232852

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:16232616..16242675 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGGAGCCAGCGGCTGCGGCGGCGGCGGCGGAGGCCCCAGCGACGGTGGGGCAGGCGGTGATCCCGCTCGTCAACAGGCTGCAGGACATCGTCGCGCGGCTGGACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGACTGGAGCTGCCGCAGGTGGCGGCGATCGGCGGGCAGAGCAGTGGGAAGTCGAGCGTGCTGGAGGCGCTCGTCGGCCGCGACTTCCTCCCCCGGGGCCCCGACATCTGCACGCGCCGCCCCCTCGTGCTCCAGCTCTTGGAAACGGATAAAGAAGCTGGGGGCAACAAAGGGGTTTCTGAGAAACAGATTCGTCTGAAAATATTTTCACCAAATGTCCTAGACATCACCTTGGTTGACCTCCCTGGAATAACAAGGGTGCCAGTAGGAGACCAGCCTAGTGATATTGAGTCAAGAATAAGGTCAATGATCATGCAATACATTAAGCATCCAAGTTGTATTATCTTGGCTGTCACTCCGGCTAATGCAGATTTAGCTAATTCGGATGCTCTCCAACTGGCAAAGCTTGCTGATCCTGATGGTTCTCGAACAATTGGTGTTATCACCAAGTTGGACATCATGGACAGGGGCACTGATGCTCGTAACTTTTTACTGGGAAATGTGATCCCCCTCAAGCTTGGTTATGTAGGTGTTGTAAATCGTAGCCAAGAGGATATCAACTTTAAGCGGAGCGTCAAAGATGCACTTGCTTTCGAGGAGAAGTTTTTCTCAACTTTACCTGCTTATCATGGTCTTACACATTGCTGTGGTGTTCCTCAACTGGCCAAGAAGCTAAATACGATTCTACTAAAGCACATTACATATATGCTTCCAGGCTTGAAATCTCGCATCAATTCTCAGTTGGTAGCAGTTGCAAAAGAGCATGCTGCATATGGTGATACTGCAGAATCAACGGCTGGTCAGGGGGTCAAACTGTTGAATATACTCAGAAAATATTGTGAAGCCTTTTCTTCCATGGTGGAAGGGAAAAATAAAGTGTCAACAGATGAACTATCTGGTGGAGCAAGAATCCACTACATTTTTCAGTCAATTTTTGTCAAGAGCTTGGAGGAAGTGGACCCCTGTAAGAGCATAACTGATGAAGATATCCGTACAGCCATACAGAATTCTGACGGTCCAAAGGGTCCTATGTTTCTGCCAGAGATGGATTACATAAATACTTCACATCCAAACTTTGTTGGAGGCAACAAGGTTGTTGAGCTTGCTAGGCAAGAAATTTTACCTCCCAAAGCACCAACCTCTGTAACGATTCCTAAGGATGGTACTGCTATTAGTCCTGAGATACAATTAACATCTGACAGAAGTCAAAAGTCACGTGCTATTTTTGCAAGAGATGCTACTAGAGGAGCCACCTCTGATCAGGGAGTGCAGCCTGATGCTGATACAGGAACAAGTGTGGCAGGCAGAAATCAGAGGGGTCACTCACTGGTTGCTGGGAGTTCATCAAGCAAGTCAGTTGCACGAGTTCACAGCCTAGATAACCTTATCTCTATCATCCAGTTAAGAGAGCCACCCATCACTTTGAAGCCATCAGAAAACCAGCCTGCACAGGATGCAACAGAGGTAGCCATTGTGAAACTATTGATCAAATCGTACTATGACATTGTCAGAAAGAGTATTGAAGATGCTGTTCCAAAGGCTATAATGCATTTTCTGGTGAACCACACAAAGCGTGAGCTGCATAATGTTTTAATCCGGAAATTGTACAGAGAAAACCTGCTGGATGAAATGCTGAGGGAAACTGATGAAGTAATTATCAGAAGGCAGCGTATACAAGAAACACTCCAAGTTCTTGAACAGGCTCATAGGACGCTCGAGGAATTTCCCCTTGAAGCTGAAAAGGTTGAGAAGGGATACAGCCCTGCTGAATATGCTACTGGCCTGCCAAAAATCCATGGTCTCAGCAATGGCGACCCCAGCATCATTTACGCATCCTCGCCTAACCACAATCGAAAGAAAGCATCTCACGAAGATCAACATGGGTCGGTAGCGTCATATAGTTCGACTTCCTATCCAGATGCTAATGGTGGGCTTCTTTCCACTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAEPAAAAAAAEAPATVGQAVIPLVNRLQDIVARLDGGGGGGGGGLELPQVAAIGGQSSGKSSVLEALVGRDFLPRGPDICTRRPLVLQLLETDKEAGGNKGVSEKQIRLKIFSPNVLDITLVDLPGITRVPVGDQPSDIESRIRSMIMQYIKHPSCIILAVTPANADLANSDALQLAKLADPDGSRTIGVITKLDIMDRGTDARNFLLGNVIPLKLGYVGVVNRSQEDINFKRSVKDALAFEEKFFSTLPAYHGLTHCCGVPQLAKKLNTILLKHITYMLPGLKSRINSQLVAVAKEHAAYGDTAESTAGQGVKLLNILRKYCEAFSSMVEGKNKVSTDELSGGARIHYIFQSIFVKSLEEVDPCKSITDEDIRTAIQNSDGPKGPMFLPEMDYINTSHPNFVGGNKVVELARQEILPPKAPTSVTIPKDGTAISPEIQLTSDRSQKSRAIFARDATRGATSDQGVQPDADTGTSVAGRNQRGHSLVAGSSSSKSVARVHSLDNLISIIQLREPPITLKPSENQPAQDATEVAIVKLLIKSYYDIVRKSIEDAVPKAIMHFLVNHTKRELHNVLIRKLYRENLLDEMLRETDEVIIRRQRIQETLQVLEQAHRTLEEFPLEAEKVEKGYSPAEYATGLPKIHGLSNGDPSIIYASSPNHNRKKASHEDQHGSVASYSSTSYPDANGGLLST</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..270#1027..1309#1393..1421#1504..1605#2804..2872#2972..3031#3507..3620#4270..4318#4702..4808#5568..5660#6703..6816#7452..7556#7669..7693#8735..8856#8947..9093#9491..9543#9655..9754#9824..10060#ATGGCGGAGCCAGCGGCTGCGGCGGCGGCGGCGGAGGCCCCAGCGACGGTGGGGCAGGCGGTGATCCCGCTCGTCAACAGGCTGCAGGACATCGTCGCGCGGCTGGACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGACTGGAGCTGCCGCAGGTGGCGGCGATCGGCGGGCAGAGCAGTGGGAAGTCGAGCGTGCTGGAGGCGCTCGTCGGCCGCGACTTCCTCCCCCGGGGCCCCGACATCTGCACGCGCCGCCCCCTCGTGCTCCAGCTCGTGCGCCACTCCGTCCCCGAGGAGTGGGGGGAGTCCTCCACGCACCCGCCCGCCGCTTCCACGACTTCGACCAGATCAAGCGCGAGATCCAGGTCAGCCCTGCAGCTTCGCTTGTTTGCTTGCGTATAGTGCTACTTTTGGCGCAATGCTTGAGACTTTGAGAGATCTTTAATCTGTGAAATGATGATTGCAAGGTGGATTAGCTTGCAATCCAGAAGAAAAAAAATGTAGGTTGTAGTTTGCAGTTTTAGAAAAAGGGTCTGTTCACTTTGTTGACTTGATACATTACCAGCATTAGTCCAGAAAAAAAGGATACTCCCTCCGTTTCAAAATGTTTGACACCGTTGACTTTTTAGCATATGTTTGACCGTTCGTCTTATTCAAAAAAAATTGTGAAATATGTATAACTATATGTGTACATGAAAGTATATTTAACAATGAATCAAATGATATGAAAATAATAAATAATTACTTAAATTTTTGAATAAGACGAATGGTCAAACACGTACTAAAAAGTCAACGGTGTCAAATATTTTGAAACGGAGGGAGTATTATGGTAAAAAAAGCATTTGGGCTAAATTTAGTGGATGGAGATCGTTTGGTACCTTTGCTTTGTTCACTGTATTGTACTGGGCAGTGGGCACTGATACTTTCGCGTACTTATAATAATCCTTCTTTTTTTTGGTTGGGGGGGGGTGGGTCTTGTTTTATGCTTTCGTGATTCTTACGAGATGAATTATGTTGACTGTTTTTCAGTTGGAAACGGATAAAGAAGCTGGGGGCAACAAAGGGGTTTCTGAGAAACAGATTCGTCTGAAAATATTTTCACCAAATGTCCTAGACATCACCTTGGTTGACCTCCCTGGAATAACAAGGGTGCCAGTAGGAGACCAGCCTAGTGATATTGAGTCAAGAATAAGGTCAATGATCATGCAATACATTAAGCATCCAAGTTGTATTATCTTGGCTGTCACTCCGGCTAATGCAGATTTAGCTAATTCGGATGCTCTCCAACTGGCAAAGCTTGCTGATCCTGATGGTACTTAAATAACTCTGGTTGTAGTTATAAGTTTCTTTACCGTGGAATGATTTATGAATGCAAATTTATTGTTGTTCTGGCAGGTTCTCGAACAATTGGTGTTATCACCAAGGTACTTTTGCAATATATAAACAATAGTGCATACCCTTTACTTACTTTGTGATCACTATGTTAACCTTGCTTCAATGGCCTAGTTGGACATCATGGACAGGGGCACTGATGCTCGTAACTTTTTACTGGGAAATGTGATCCCCCTCAAGCTTGGTTATGTAGGTGTTGTAAATCGTAGCCAAGAGGTACCTTCTAAGACAATACCATGAACCTTCATTAGATTGACTATCATCTTGAATTTCTTCTTCGAGTTCCATAGTCTCACATGATATGACAATGTTTTTTCTGCAATTTAGAAAATTATATGGTTTGCTCATGCATCTTCAATTGAAATGAATTTAGTTTCAAAGTTAATTTTTTAATATGTGGTGTTAATAGATTGAACTATTCATTTAAACTTGAATCTTGTCAGATAGCTAAGCCTTATATGCCTTGATAGTTTTGTATTGGTACCAAATGATGGCTTGATACATAGTTAAGTACAAGCAGTGTTCACCTAGACGCTAGACGCTAGACGGACGATGACCCATGGTCTAGAGTCTAGCCAGTCTAAACGCAAATCTAGACGGTCTAGACGATATACCGTACACTATATTATCGGCATACTCTTTTGGCACACATGTAAATATGCTTAACATTTTTCATAGAATATTAGAGAACTAGCGGTGCTATGATAGGTGTAGCCACTCGAGTAAAGTTGTGGGTTGGAGAGAGGTGGGAGCAAGGTCCTCTGTGACGACTAGTAGAGGAGAGACGACATGATTTTGTTGCAGTGACTGGCCTAGAGTAGAAGAGAACGGTATGGAAATGGGGTCAAAACCATAAACCATAAGGGCTTTGGTCTAGGCTCGAAGTTTCAGCTCTAGCAACACAAAAAATGCATTGGCCTATTGCCTAGACCATAGTCTAAATGACAGGTTTACGGTCTACACTCGTCTAAATGTTGTTTAATTGTGTGGTCTAGGCAGTCTAGAACCATCTTTGACCGACTAGACGGTCAAACAGTCTAATTCACAGTTTAGACTCTAAACTAGACGATAACCCATCGTCTAGCGTCTAGACACGGTCTAGACCGTCTAGACTATGGTCTAGGCAAACACGTGTACAAGATGTCATAACATTGAATTGAGCTTGACATACGAATGAACAAATTGTACACATGAAAATAACAATTACTCTTTTGAAACTTGATAGTTTTGTATTGGTACCAAATTTGGGCGCTTATCTTTTTATTAAGAAGTTCATGATGTCCTTTTCAGACAGTTGCAATTCTGGTTCAGGTTATGATCATGATCTTAAAACTGTTGATGCATTGCTAAGTTGAAATATTTGCACTCAAATGATATACATTTCTAATATCTAACATCTGGATGATTCTAACAGGATATCAACTTTAAGCGGAGCGTCAAAGATGCACTTGCTTTCGAGGAGAAGTTTTTCTCAACTTTACCTGTATGTTAGGGCCTTGATATTTTGTTCAAGCAGTACTACCCATTGTGAAATGACATATTTTGCTAAATTCTTGATTAATATTTTTTGTGCTATTAACAGGCTTATCATGGTCTTACACATTGCTGTGGTGTTCCTCAACTGGCCAAGAAGCTAAATACGGTATATCTGTTAATTATTGCTATCTAGTTTTTTTTTTCCTTTATTCATTTTCTCAGCCTCATTAGATTCCTCCTGTCAATATCATAAACAAACATTGGCAACATGGGCTTCATTGGAAATTGTTCGCTAAGACAAACTGACTCAGAATGAATTAGCAGTCATTTAGTGCAAGATTATGAGCCAACGTAAGATGCTTCATGATTAAATTAAAACCTCCAAAGAAGTATTGAGGAGGTCAGAAAATCACTTACACTAAAGGGGCATGCTTAATAATACTCTCAACACCCAGATGAGCATTGGTTTTAAAATAGTAAATGATGAATTTATTCTCTTATAAACCGAACTTATTGCAATGCTTTATCTTTTAATTGAAAATGCGAAAATTTGGTACTGTATTGTAACTTTATCTGCATGTGATTTGCTAATGCATCGTATATCTGCAATTGACTACGGCCGCTCTTGGCTCCTTTTGCAGATTCTACTAAAGCACATTACATATATGCTTCCAGGCTTGAAATCTCGCATCAATTCTCAGTTGGTAGCAGTTGCAAAAGAGCATGCTGCATATGGTGATACTGCAGAATCAACGGTAATAACATTCTCAGCTCATAATTGTAAAGTTGTAACATGTCCCTCATCAACTAACTACGAAAACTATACCTCTAGTCACAAAAGGGTGATGTTTATGACTTTTCAAAGTAAACAAAATGCCATTTCTATCACTAAATTTTATTGTTGTGTATTTTAAAAATATTGATTTTATAGAAGTATTTTTAATCATAACTTTACTCCTACCATTTTTATGTTATCCAAATTATACACTCTAGGTGGTATCTTTGGCTAAAATATCATTTTGGCTGCATCTGTTCATGAGTACTCCCTCCGTTTTATATTATAAGACTTTTTAGCATTGCCCACATTCATATAGATGTTAATGAATCTAAACACATACGTATGTCTAGATTCATTAACATATATATGAATATGTGCAATGCTAGAAAGTCTTATAATATGAAACGGAGGAAGTATCAAATTTTTTATGACTAGAGGGAGTGTGTATTTGCAGTTTATCATCCTTGCAAGAGAACTGCTTGTTGTGTGAATATCACATGCCTGGCTTCCAAGCTTCTTAGAAGCAGCTTTCTTATGTGTGTCCTATTTTATTTTGTAGTTTAAGTTTTAATGGCTTTTGAGCATTTCTACTTCTAGTGTTGATTTTTTCATCCCAATGCATGCAGGCTGGTCAGGGGGTCAAACTGTTGAATATACTCAGAAAATATTGTGAAGGTACAAAAAAAAAGGAGAGAATAAATTTACCATATTTACTGTAAGACTTGACTTACCAACTGTGCTTTGCTACCAGTTTATCTAGAATTACAGATGGCTCTTGTGCAGTTTTTCTTATATAGTCCTTTGCTGCTTCCTGCTTGTAGCAATAACTTGACAGCTCAACAATAAAAACGATAGCTAGAAAATTATCCTTGATTTGTGTAAATTTTCTAGGATAGTTGTGCAAACATTTAGATCACAAAATACTGAGATTTGAGAGTAATCGATTCTTTCATAAGATTGTTGCTCATGTGCATAGTTTTTCGTCCTCTTCAATCTGCCACTTTGATGATTCCCTAAGCTATATTCTTCTAATGTGATTATGTTTTCTCTGTTTCCAGCCTTTTCTTCCATGGTGGAAGGGAAAAATAAAGTGTCAACAGATGAACTATCTGGTGGAGCAAGAATCCACTACATTTTTCAGTCAATTT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External Link(s)

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