BGIOSGA015327
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA015327 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015327, complete gene. |
| LocusTag |
ZIS1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA015327-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA015327-PA |
| Length |
11210 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:13372630..13383839 |
| Sequence Coding Region |
13383576..13383839,13381184..13381442,13380262..13380640,13378775..13378993,13376032..13376167 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:13372630..13383839 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:13372630..13383839 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCTACTTCCATCCCTCTCCCTTTCTTCTTCTCTCATGGTGTTGTGCATGCTAGGACAGGCCATCCTCCAATCTGGCCGCCGGTTGGGCTCCTTTCTGCTGGTGCCCCGGCAAAAGTCTCCTTCCGACGACAAAGCAATGCGCATCGACATGCTGCACAAGTTGTGTCCACACAATCAATCACTCCTGCGAAGGAGGTGTCTAGCTTTGAGCCCTCTGTGTGGGGGGACTTCTTTATCAACTATGACACAAAGCCACTACAGAGATCGGAGGATTGGATGATGGAAAAGGCTGATAAACTAAAACAGGACGTCCGTATACTGTTTGAGACCCACAATGATACAGCCAAGAAAATGCACTTAGTAGATGCAGTTCAACGTCTTGGAATAGATCACCTTTTCCAAGATGAGATAAACAATGTAATAAGTGACATCAAAGAAAGTGAATTCACTAGCTCTAGCCTCCACGAGGTTGCTCTCCACTTTCGCTTACTTAGGGAGCATGGCATTTGGGTATCTCCAGATGTATTCGAAAAATTCAAAGGAGAGGATGGGAGGTTCATCAATACAATAGCTGATGAACCAAGGGCATTATTAAGTTTGTACAATGCAGCTCACCTCCTTGTCCATGATGAGCCAGAACTTGAAGAAGCTATGTCTTTTGCAAGGCACCACCTCGAATCAATGAGGGATGGAAGTAGGCTCAAGGCCCCTCTAGATAATCAAATCAACCGTGCCCTACACTTACCATTACCGAGAACCTACAAGAGAGTTGAAATGTTGCATTACATGCTGGAGTACGGACAGGAGGAAGAGTGTATTGTTGTTCTTTTAGATCTTGCAAAGCTGGAATTTAACCTTCTGCAGCATGTCCACTTGAAGGAGCTCAAAGCTTTTTCTCAGTGGTGGAAAGATCTTTATGGATATGTCGAGCTAAGTCATGTTAGAGATCGTGCAGTGGAGTCATATCTTTGGTCCTATGCGCTATTCTATGAAGAAAACTTAACACTCACACGGATGATCCTTGCCAAGATAATTGTATTCATTGTCCTTATGGATGACACATATGATGATCATGCCACCATCGAGGAATGCAGGAAGCTGAATGAAGCCATACAAAGATGGGATGAAAGTGCTATCTCATTACTACCAGAGTACATGAAAAAGTTCTACCGTGCACTGCTGAATTACTTCAGGGAGACTGAAGCTCAAGTAGAGGCCAGTGACAAATACCGGGTGACCTGCATGAAAAAAGAGTTCCAAAATCTATCCACGTATTACCTGCAAGAATTTGAATGGTTGCATCAAAATTACAAGCCAGCATTTAAGGAGCGGGTTGCTTTGTCAACCCTGTCCAGTACTGTTCCACTACTCTGTGTGACTGCTGCAGTTGGCCAGGGTGATGCAGTAACGAAGGAATCATTTGAATTGACAACAGTACGTTCAAGTGCCGTTATAGCTTGTGCAAAGATTATGCGTTTCATGAACGACATTGCTGCATTCAAGTCTGGAAGAAAGAACAAAGGAGATGCCGCAAACACAGTAGAGTGCTATATCAATGAGCACAAGGTTACAAGCGAAGTTGCCTTAGACAAGATCGAATCAATGATTGAAAGTGAATGGAGAACCCTGAATCAGGTTCGTTGTGATCATCAAAAGCAGTTCCATGTGGTGCAACGAGTTATGAATTTGGCCGTAGCAGTGCCATTCTTTTACGATAAGAAGAAAGATGCATATACATTTTCGAAGTATCATCAGGGAAATGTTGGGAATCTGTTTGTGAATCCTGTCACCCTTTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSTSIPLPFFFSHGVVHARTGHPPIWPPVGLLSAGAPAKVSFRRQSNAHRHAAQVVSTQSITPAKEVSSFEPSVWGDFFINYDTKPLQRSEDWMMEKADKLKQDVRILFETHNDTAKKMHLVDAVQRLGIDHLFQDEINNVISDIKESEFTSSSLHEVALHFRLLREHGIWVSPDVFEKFKGEDGRFINTIADEPRALLSLYNAAHLLVHDEPELEEAMSFARHHLESMRDGSRLKAPLDNQINRALHLPLPRTYKRVEMLHYMLEYGQEEECIVVLLDLAKLEFNLLQHVHLKELKAFSQWWKDLYGYVELSHVRDRAVESYLWSYALFYEENLTLTRMILAKIIVFIVLMDDTYDDHATIEECRKLNEAIQRWDESAISLLPEYMKKFYRALLNYFRETEAQVEASDKYRVTCMKKEFQNLSTYYLQEFEWLHQNYKPAFKERVALSTLSSTVPLLCVTAAVGQGDAVTKESFELTTVRSSAVIACAKIMRFMNDIAAFKSGRKNKGDAANTVECYINEHKVTSEVALDKIESMIESEWRTLNQVRCDHQKQFHVVQRVMNLAVAVPFFYDKKKDAYTFSKYHQGNVGNLFVNPVTL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..264#2398..2656#3200..3578#4847..5065#7673..7808#10126..10374#10917..11210#ATGTCTACTTCCATCCCTCTCCCTTTCTTCTTCTCTCATGGTGTTGTGCATGCTAGGACAGGCCATCCTCCAATCTGGCCGCCGGTTGGGCTCCTTTCTGCTGGTGCCCCGGCAAAAGTCTCCTTCCGACGACAAAGCAATGCGCATCGACATGCTGCACAAGTTGTGTCCACACAATCAATCACTCCTGCGAAGGAGGTGTCTAGCTTTGAGCCCTCTGTGTGGGGGGACTTCTTTATCAACTATGACACAAAGCCACTACAGGTATACATTTTTTTTTTCATTTTCATATTGTGTACATTTTGCTCTACAGCAAAACTGTACAACTGTTCTGTAGAAGAATATCATCTGGTTTTCTAGTCAACATAAACATATAACCTGATCTAACAAGCATATCAAAAGATTGCTGACAGGCCTGAAACAAATTTCACCACCATGTTATCACGTACAAAACCCTTAGGAATTAATATATCTGTTCTTGTTTACTTGTCACCTTAACCACCTTTTGAAGTTTGGAAATATTTATCGATCACTACACGGTTACGAAGGTGATAATTCTCATTTTGCATATGTTACCCATATGCATGTAGAAGAGATTACATATCCCACCAACATATGGGTATTTTGGTTGTTTCATTAAAAAAAGTTGATTACATGGGTATGTGTGCATGGTCAATAGTGAGCAATAAACAAAAATGGTGGGACTAATACCGGCACATGTTTAACGTCAAACACGCTCCGGCTGCCTAGGCCACGCAGGCAACTTGTTTACGAAGATCCGAATTTTCCCAGATAGGCATCAAAACCACACACAAAAAACTGGTTTTCACTGGCTGACACGTTAAGATGCTCGAGTGCATAAGATTTTTGCTCAAAAAACAAAAAAAAATCCAAAATAATAAAATTCTAGAAACCCTATCTTGATATCCAATACAAGCATCATCGCAATCAATATGAGATGACATAATTAAGGAATAAGGACGGAATGATGCGACATAAAGAGTGACTAGAGGTCGGGCAGATTGATGGGCGTATTTATTTTGGCTTCGCCTTTTCACACGTGGTCCTATTATGAGGCCAACTAGGATTGTTTTTATAGACAATTTTGGGTATTTTCTATGAAAAATACGATTTTATCGACCGGGTCTTTAAGACGGGCACCTAAAAGAATAATCCTATTTTTAGACGCGCCTCCTAGGAAGCTTGCCTATGAAAATTGACTCTCACAGTAGAGCCTTGATCGGAGAGCCTACGCTTTTTCATATGTAGGTCTTTACTTAGGCCGCCTATTAAAATATAGGGGTTGTTCATGAAAATAGTTCTTTGTAGCATGGGCAATTACTCCCTCCAATGTTTCTCATTTGGTATATTGACGTGCAGATTCCCAAAACAACTTCAACTAAGTCTTGACTTCTATAGTAAGAGTGGCATATTTTAGCTGTAAAATCAACGGCAATATTCACATGACAAATTATATAATTAATACTTCTATATCTAATTATGTACTTTGAAAAAGTGAAAAAAACACAAATATACATATTTTTTCAATAATTTACGTTTATATACCTGCACGAGATTTGCAAAAATATACCCGCTTCGAGGAACGGAAACGTGGGACCGCGATGGTCCCGCAGTTCTAAAACACGGGACCGATGTCCCACGGAACGGTCGCGCGGGACCGCGATGGTCCCAAAACGCGGGAGCGAACTGGCCAGCGATTTATTTACTGAGTCGGCACTGTTTGACAATGTTTCGGGTACTGTTTGCCACTTTACATCACTGTTTAGACCTGTTTATGGCCAGTTCCGCACATTGAACCTGCGGTACCGCCTTACAAAACTGTGTCAAACAGGGCTACACAGTGTCCATAGTGCTAAACAACGTTAAAAATCACTGGCTGCCTCGCTCCCGAATTTTGAACCTGCGGGACCGTCGAGGTCCCGCGCAACCGTTTTGTAGGATCGTCGGTCATGCGTTTTGGAGCGGTCACGCGTTTTAGAGCTGCGGGACCATCACAGGCCCGCGTTTCCGTCCCGATATTTTTGCAAATCGTCTGATGTAGATATATAAATGTAAGTTATTAAAAAAAATAAGTATATTAGCAAATTTTTTTTCTTTAAAAAGTTTGCAAGCACTCATTGTAGAACGGCACATATTTGGAACTTAAAAGGATAAAGGGGCGACATAGTTCACATTTTCCTAGCGGATCAATGGAGTTTTATCATATTTTTTTTATTACATTTGATTTAATGCTGATTTTGGCAAGAAAAAAATTGGTCAAATCCACAACAGACCAACAAGTTATCTAAAAGGAATATTTTATTTCACCTAACTATTTGTTCCTGTATTTCTTTCATTTGATTCTAACAAATCAAATTTTTGCATGCAAATAAACAGAGATCGGAGGATTGGATGATGGAAAAGGCTGATAAACTAAAACAGGACGTCCGTATACTGTTTGAGACCCACAATGATACAGCCAAGAAAATGCACTTAGTAGATGCAGTTCAACGTCTTGGAATAGATCACCTTTTCCAAGATGAGATAAACAATGTAATAAGTGACATCAAAGAAAGTGAATTCACTAGCTCTAGCCTCCACGAGGTTGCTCTCCACTTTCGCTTACTTAGGGAGCATGGCATTTGGGTATCTCCAGGTACTAATAAATACTATAGGAGATAACTTGCAGAGTAATTTTCACAAAATTGCAACTTGGTCAGAAATATCTCACTGCAACCATTACTATGTATTTTACAAACTACAATAATGCCAAACAAGTTTATTACAAAATACACCCTTCATTTCAATAAATTTGGTCAATCTTAAAGAAGTTTGACTAGGAAAAAAGTCAAATGACTTATAATATGAAACGGAGGGAGTAACAATTTATCCACTGTGTGCATGACAGATAGGCCCAATTTTCAATAGTGCGAGTATTTCTTATATTGGTGATGACTTGCATATACAAATTTTTGTATTTTTCTTTGGATCACAAAATTTTAAGTCATTGTATTGTAGGTATTCATTCATTTTCGTAATTATTTTTTGTGTCAAACAATTTTTCAATATAAGTCCAAATTAGAGTATATATATACATAAAAATTAGTCAAGAATATCCGATGTATTAAAAAATTGTATGAAAAGGGAATCTAGTATCTTTTGGAAGGAAAAATCCACATTTAATTTAGCTGCCTTGCAGATGTATTCGAAAAATTCAAAGGAGAGGATGGGAGGTTCATCAATACAATAGCTGATGAACCAAGGGCATTATTAAGTTTGTACAATGCAGCTCACCTCCTTGTCCATGATGAGCCAGAACTTGAAGAAGCTATGTCTTTTGCAAGGCACCACCTCGAATCAATGAGGGATGGAAGTAGGCTCAAGGCCCCTCTAGATAATCAAATCAACCGTGCCCTACACTTACCATTACCGAGAACCTACAAGAGAGTTGAAATGTTGCATTACATGCTGGAGTACGGACAGGAGGAAGAGTGTATTGTTGTTCTTTTAGATCTTGCAAAGCTGGAATTTAACCTTCTGCAGCATGTCCACTTGAAGGAGCTCAAAGCTTTTTCTCAGTAAGAGTCTTTCTTTGCTTTGTCTTTGTACATGTCTTGTGGATGTAGATACCAGGTTTATTCATTTCCTTTATCTAAAAAAAGAGTATTTATTTGATATTTATATATATAATAAGTAAATATATACCATGAAAGTAATTGATTGTGCCCTTTAGGACAGAAACAAACCACTGTAATAATCTCAAATCTGTGTATGTGCACGATACAACTACCAAAATATGTTTTTCGATCTTCGCTCTACAGTTAGTAAAGATAATTTAGAGAATATTTAGTTATTAGTGAATGGGCCGTGCGTTACAGTGGAGAATTTAGAAGTATTTGTTTTCTAGGAAAGCTTGATAAAAACCTATTGGAAATTATTTACTCGTCATACCTAAAAGGACTATAATTTGAGCTACGTAGAAGTTGATGTGTAATTTCAACTCATGAATAGTTATGACAAGTATGAGAGGGATTCGATGGCTTTTACTTTCTAGGTGAGATGTTGCTCAATACATCTTGAGCTCTAAAGCAATTATACTAAGTGGTTAATTCTGAATACACATGACATGTGGGTAGCTATGATCAAAGTAAAGGAGGAATCCAAAGGCTGTTGTATTTCAGATGAACTTAATCAATACATGTGGATATTTTAGCTCTGACTATATAGGATAGACAGATATAGATAAGTGCAAAATTCTGGAGAGACGTTGTGTTCCTTCGATGTACTGAATGGTAAATACATAAAATGTGTACCTCGTTTTAGACAAATTGACGCTTTGTTTGTGCAACCAATTTAATGTTAATTAATCACAAAATACATGTACAACTTTATGTTTTGTCCAGAAGTAGTCAATATATGTCATGTTAATGAGGTAGTTAGTGTATCCGAGTTTAGGTATCGCTTTATCTGTAGTTTCAAGTATTGAACAATAGAAAATTAAGGTTTATACTACTATATAATTTGTCCACTCTCAGATAAAAAAGAAGGACAGCTAGCCTTCAAGGAATATCCGAATATTTTATCAATCTTTGTCTCAGCATTTGCAGCAGCAATACACTAGAGGCTTTTATGCGGCTTTAAACATCCAATAACTAGTGACATATACTGAAATAACTAGCAATATGGCTCTTCATGTTGTTAGTGTTTTCGGTATGCCTGATATGCTATGTACATATTATTACTATCATAAATCAATTAATACTCATTGCTTCTAATGATCTAATATATATATCTTAAATATACTTCAAAACAAGCACCTAAAACAATCGATCATTTTAATTTTCAGGTGGTGGAAAGATCTTTATGGATATGTCGAGCTAAGTCATGTTAGAGATCGTGCAGTGGAGTC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|
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