BGIOSGA016230

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA016230

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016230, complete gene.

LocusTag

OSJNBA0083D01.21

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA016230-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA016230-PA

Length

9304

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:15983831..15993134

Sequence Coding Region

15983831..15984223,15984976..15985077,15985270..15985336,15985914..15986092,15986176..15986436
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,15990667..15990907,15991660..15991781,15991979..15992059,15992131..15992205
,15992449..15992591,15992703..15992853,15992952..15993134

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:15983831..15993134 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGACCACGCCGGCGGCGGCGGCGGCGGGGGGCGCGGCGATCCTCGACACGCTCGGGGACTTCACCTCGCGGGAGAACTGGGACAAGTTCTTCGCGCTCCGCGGCACCGGCGACAGCTTCGAGTGGTACGCGGAGTGGGACGACCTCCGCGCCCCGCTCCTCTCCCTCCTCCATGGCCGCGACGGCGGCGCGGAGGGCGGAGGCAGGGCCCCGGAGATCCTGGTGCCCGGGTGCGGGAGCTCGGTGCTCTCGGAGAGGCTCTACGACGCCGGGTTCCGCCGCGTCACCAACGTCGACTTCTCCCGCGTCCTCGTCGCCGACATGCTCCGCCGCCACGCTCGCGCGCGGCCGGAGATGCGCTGGCGCGTCATGGACATGACCGACATGCAGTTCACAGATGGATCATTTGATGTCATACTTGATAAGGGTGGACTGGATGCTCTTATGGAGCCAGAGGCTGGCACAAAACTAGGGATGAAATATCTAAATGAGGCAAAGAGAGTTTTGAAATCAGGAGGGAAATTTGTTTGCCTTACCCTTGCAGAATCCCATGTCCTAGCTCTGATTTTGTCTGAGTTCAGGTTTGGATGGGATATGAGCATTCAAGCTATAGGTAATGAATCCTCTAAGTCTGCCTTCCAGACTTTCATGGTGGTCATGGTAAAAGGAAAGATGGGTGTAGTGCACCCAATACAATCTCTATTAGACCAATCTGGTAAATTCTGTAACATGAAACAGGCAAATGATGTGATTCATTCTCTTGAGAAGGAAAACACCATCCGGGAGTCATACAGTTCTGGTGTTGATGTTACTTTGTCATTACGCGATCTTCAGTTAGGAGCTGTAGGAGATCTGAAGGTGATTATCCCAGGACGACGAAGGATGTTCATTCTTGGTGATCAGGGAAATTCACTTTATTGCTATAAGGCTGTTCTATTGGATGCCAGAAAGCGAACTGAAACCTTTGTATATCATTGTGGAGTTTTTATTGTGCCTAAGGTTCGAGCACATGAATGGCTTTTTGCTTCAGAAGAAGGACAGTGGCATGTTGTTGAAAGTGCAAAGGCTGCTCGTCTAATTATGGTATTCTTGGATAGCAGACATGCAAATGCTGACATGGATGTTATCAAGAATGATTTATCTCCCCTTGTTAAGGATCTGGAACCTGGAAATCCTGAAGAGGAAGCTCGTATACCGTTCATGATGGCTGGTGATGGTGTGAAGCAACGAGAGATTCTGCAAGAGGTAACTTCAGAAATAACTGGTCCTATGGTTGTGGAAGATGTTGTTTATGAAAATAGTGATGAAGACCAAAGTTCTATGACTGAAAAGATGTTCCGGCGCCTTATATTTAAAAGAAATTCTGGCTTAGTGCAATCTGAAGCATTGCTTGTCAAAGATTCCACCAGTGACAAGGCAGATGAAAACAACAAAAAATCACCTTCAGCATCCAAAAAAAGGAGGAACCAGAAAAAAGGTCCCTCAGGATCCAAGACCGTTCTGAGGATTGATCATAGCTACCTTGGTAGTTCTTATCACAGCAGTATCATATCTGGCCTTTCTTTAATTGCATCTGCTCTGGATTCTGCTGCAGTAGCTGGAACAAAAGTTAGCACAACCATCATAGGGCTTGGAGCAGGAACTTTACCAATGTTTCTTCGTGGATGTCTCCCTTTCCTAGATATTAAGGTTGTGGAGTTAGATCCCTTGGTAGAGGAGGTGGCAAAGAAATATTTTGGCTTTTCAACAGATGAGCAATTGCAGGTGCATTTGGGAGATGGAATCAAATTCATAGATGATATTGCTGTTGCAAACAGTGGGGCTACCACCCAGCAGCTCATGTCTACTGGCAATGAGAACAATGCAGTTAAAATTCTTATTGTTGATGTTGATTCATCTGACGTGAGCTCTGGGTTGTCTTGCCCTCATGCAAACTTTGTTGAGGATTCTTTTCTTCTGGCGGTGAAAAAGTTCCTTGATGAAGGTGGTCTGTTTATCATCAATTTAGTCTCGCGATCATCCGCAGTCAGGGAAATGGTTGTTTCACGACTGAAAGCAGCCTTTGAGCACCTATATTCACTACATCTCGAAGAAGATTTAAATGAAGTTTTATTTGCAACCCCAAGTGAAAGATGCCTGGATAACAGCAATATGGATGAGGCTGTGGCCAAACTGAAGGCCATGCTGAAATTCCCAGTGAATGTAGAATCAGATATGAAGAAGTTGCAGAAGCTGCAGTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MATTPAAAAAGGAAILDTLGDFTSRENWDKFFALRGTGDSFEWYAEWDDLRAPLLSLLHGRDGGAEGGGRAPEILVPGCGSSVLSERLYDAGFRRVTNVDFSRVLVADMLRRHARARPEMRWRVMDMTDMQFTDGSFDVILDKGGLDALMEPEAGTKLGMKYLNEAKRVLKSGGKFVCLTLAESHVLALILSEFRFGWDMSIQAIGNESSKSAFQTFMVVMVKGKMGVVHPIQSLLDQSGKFCNMKQANDVIHSLEKENTIRESYSSGVDVTLSLRDLQLGAVGDLKVIIPGRRRMFILGDQGNSLYCYKAVLLDARKRTETFVYHCGVFIVPKVRAHEWLFASEEGQWHVVESAKAARLIMVFLDSRHANADMDVIKNDLSPLVKDLEPGNPEEEARIPFMMAGDGVKQREILQEVTSEITGPMVVEDVVYENSDEDQSSMTEKMFRRLIFKRNSGLVQSEALLVKDSTSDKADENNKKSPSASKKRRNQKKGPSGSKTVLRIDHSYLGSSYHSSIISGLSLIASALDSAAVAGTKVSTTIIGLGAGTLPMFLRGCLPFLDIKVVELDPLVEEVAKKYFGFSTDEQLQVHLGDGIKFIDDIAVANSGATTQQLMSTGNENNAVKILIVDVDSSDVSSGLSCPHANFVEDSFLLAVKKFLDEGGLFIINLVSRSSAVREMVVSRLKAAFEHLYSLHLEEDLNEVLFATPSERCLDNSNMDEAVAKLKAMLKFPVNVESDMKKLQKLQ</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..393#1146..1247#1440..1506#2084..2262#2346..2606#3885..3968#4078..4125#4217..4281#5457..5505#6837..7077#7830..7951#8149..8229#8301..8375#8619..8761#8873..9023#9122..9304#ATGGCGACCACGCCGGCGGCGGCGGCGGCGGGGGGCGCGGCGATCCTCGACACGCTCGGGGACTTCACCTCGCGGGAGAACTGGGACAAGTTCTTCGCGCTCCGCGGCACCGGCGACAGCTTCGAGTGGTACGCGGAGTGGGACGACCTCCGCGCCCCGCTCCTCTCCCTCCTCCATGGCCGCGACGGCGGCGCGGAGGGCGGAGGCAGGGCCCCGGAGATCCTGGTGCCCGGGTGCGGGAGCTCGGTGCTCTCGGAGAGGCTCTACGACGCCGGGTTCCGCCGCGTCACCAACGTCGACTTCTCCCGCGTCCTCGTCGCCGACATGCTCCGCCGCCACGCTCGCGCGCGGCCGGAGATGCGCTGGCGCGTCATGGACATGACCGACATGCAGGTACGGTCACGACCCGCCGTGCGCTTCATCCGCTTCGGTGTATGGTTGGTTGGCTGCTTTGGAGCTAGGATTTTCGTAGTGCTGTTGCTGTGTGTGTGGGGGCGAATCAATACGGAATTGCGGCTCTGCTTGGAATTAATTTTGTAGTAGACCACGAAATTAGGCACTATCCACCGAATTGAGGATAAATCGGCAACCACCATTTTGGTACTCGTCTTTAGTGGAATGGTTAACTGAATTTAGTATCTGATGGCTAGAATGGAGGCTCTTGCTAATGCCATGCTCTTGGAGGTTGATGAGTAGGCAGTGCTGAGAATTCAAGCATATTTGGTTGATTGTGAATGCTTCTGAACATATTGTCATGCAAATCATCTAAATGAATGAATGCATGTGGTGTGTTATTTTCACCCTTGGGCAGCTTGCACCAGATGCTCATGATTTTAGTTTGTCGCGTGCGTGACATGATGGATCAAGCAAATTACAGAAGGGGGCAACTCATTTGGTTGAAACCCTGAATGAGCCTAGTGGAATAATTGTGGGGCTTTTATGTTTTATGCTTCTTAAAATGGTAGTGAACTGTTACATTCTCAATGTTTTCTGTACACAATACACTTTTAAAGAGTTCTTTTCATTTTTCCTTGCCATTTTTTAAGGATTAGAGGGTTCTTCTGACTGAGTGTTTTTTTTTTCTGTTTGTCCATCAACTGTAACTCGATATCTTATTGAACCTACCTGATACATCAAATTGCCAGTTCACAGATGGATCATTTGATGTCATACTTGATAAGGGTGGACTGGATGCTCTTATGGAGCCAGAGGCTGGCACAAAACTAGGGATGAAATATCTAAATGAGGTACTAAGTGTAATGTGTTTCCAATTTAAATACTGATGTTTGATGTTGTAATAGAAATACCATTTTGAATTTTAAATGGTGCATGCTAGTGTTGCATTCTTGATTTTTTTTATATATCTAATGGAATTTATGGAAATGTTTTGTTCTTTACGTTATGTCTGACTTAGTAAGCGCCTCTTGCTTGTCTTACAGGCAAAGAGAGTTTTGAAATCAGGAGGGAAATTTGTTTGCCTTACCCTTGCAGAATCCCATGTCCTAGGTGAGCTTCTGTCAGTTATTGAGAGAACTGATTACCTGACCATTGAAGTCTTTTCCTGTTACGTAGTTACACTTAGGACCTCTAATATGTCTTACAGTTTTGAAGGATTCTAGTGAATATACTTTCAAATTTTCAGCTATACTTCTTTTGTTTTGCTCTTAGTTGACCGAAGATATCGAGTATTGATTTTTCACGTTTCCACAGAAACTTTGATCATTGCTTTTATAACTGCATCAATATTCTTCTTATACATCTTAGTGACTTTGACTATTCTTAATAAATATACTTCCAATGTTTCCAGGGAAGCTTTAATAACTATATTAGCGTGAAACTATAAGTTAAAAAAACTTTATGATTATGAATGTGTTTTTAACAATAGAAATAATGGTGTTTTCTTCTCTCCTTTCTTGGAAATCAATATGTACTTTTTGCAGATAATCTGCATACTTCAATAGATATTGTGGTCATGAATCAAAATTTCAAAACTGTTCCACAAATGATATAAATAACCAATTTAATATCTCAGAGGTTATTTTCGTAATTGACTAACAGTGTTTTGCTCCTTTCTCTCCTGCAGCTCTGATTTTGTCTGAGTTCAGGTTTGGATGGGATATGAGCATTCAAGCTATAGGTAATGAATCCTCTAAGTCTGCCTTCCAGACTTTCATGGTGGTCATGGTAAAAGGAAAGATGGGTGTAGTGCACCCAATACAATCTCTATTAGACCAATCTGGTAAATTCTGTAACATGAAACAGGTACTGCTATATTCTTCTGATGGAAAACAAATAATTAATTCCTGTCGGTACTCTTACTCTTATATTTTATATTGGTGCTACAGGCAAATGATGTGATTCATTCTCTTGAGAAGGAAAACACCATCCGGGAGTCATACAGTTCTGGTGTTGATGTTACTTTGTCATTACGCGATCTTCAGTTAGGAGCTGTAGGAGATCTGAAGGTGATTATCCCAGGACGACGAAGGATGTTCATTCTTGGTGATCAGGGAAATTCACTTTATTGCTATAAGGCTGTTCTATTGGATGCCAGAAAGCGAACTGAAACCTTTGTATATCATTGTGGAGTTTTTATTGTGCCTAAGGTCAGCTATATACTGTCAATATGCAGCTTTGATTTTTGTTGCAGTACTTACTGTTATTTAATTTTACTGAATCCCCTACTGATCATTTTCTTGATCTACTATGTCGTAGAAGAAACAAGCATATGATAAAATACATTATGATCAGAAAATATACTTGAAAATCAAGTTACACTAGATCGAATAGAAAACTGTGTTGATCAATGTTATTTAGGGTCCACATGCATCCATGTTTTTCACTTCCTATACCAATTTCAATGCATATATCAAATACTACATCATTTTCAAAATATATGACGCCGTTGACTTTTCTCATAACATTTGTTTTATTAAAAAAGTTAGTATAAATATGTAATACTATAAGTTAAGATTATAGTCTCTTTGATGATAAAACAGGTCACAACAAAATAAATGATACTTATATAATTTTTTGAATAAGACGAATGGTCAAACGTCATGCGAAAAGTCAACGACATCATACATTTTGGGATGGAAGGAGTATTGTGTTAGTTTTTTAAGCACATGCCTGTTGCCCGCTGAAATGTGATTCTGTATTGCATACTTGGTGAGGGATGCATCCAGTTTATTCAAATTGCATGAAACACAAATCTTGAGGCCACCCAATCTATTTCCTTCTTGGCATGATTTATCTTTTTATGTGGTTTTGACCTGCCGTACCTTACATTGAAGTATTACGAGAGAGATAGTAAACCTTCATGCAAATATGTTAACTGTGCATGTTGCAATGGAAAGATTATGTGGTGCAACAGAAGTTTAGGATTTGGGACAAGTAACATCACTGCAAGATAATAATTAACTTACTAGTACACAATATGGTAAATAGTATTAAAAGAGGTGTACGCTGCATATTATAGGGAAATTGTAATGGAAGAAATAAATTATACATAGCTGAATAGTATGGAGATGTGCGCATAGTGGGGATATAGCTGAGAGTGGGGATAGGGTAATCACTCCTGTAGTCCTGCTCCCATCCCCATTTATAGTGGTAGGTATGGGACGCACTTCAAATTTGTAAATTTGAGTCTTGTATAGGCTTAAAGTCTTTCTCTATCTCTATTCTCACCGTTTTGTTCCTCTGCTTTATGTCTATTGTGGTTCTGCATCAAAAGGTTTGCTATGTGGGTACTAGCTAGGCTTCTTTTGACAACCAGAGTTGCTGAGTAGCCCTCTAGTATTTGTGTTCTCTTCCATTAAGCTATATGAAAGCCAAAACAGTTACTCTGGCACTCATGATTGCTAATGAACATAATTTGCTTTCAGGTTCGAGCACATGAATGGCTTTTTGCTTCAGAAGAAGGACAGTGGCATGTTGTTGAAAGTGCAAAGGCTGCTCGTCTAATTATGGTACAGCTGTGATGGATGCAAGCATAGTGTGATTATAATTTGATATTTGGGATCACTTTACAGCATTTTCATTGCTTATATTTGTGCCATGAACTTACCTTTACCTTAGGTATTCTTGGATAGCAGACATGCAAATGCTGACATGGATGTTATCAAGGTGATTATTTGCAAATTAGGATGTTGTGCGAATGCCACAGGCTAATACACACTATCCTAATGTTATTGTTTTGCTTCTTTTTTTTTTTCAGAATGATTTATCTCCCCTTGTTAAGGATCTGGAACCTGGAAATCCTGAAGAGGAAGCTCGTATACCGTAGGTGTCAATGCATTCTATTTGAAATTTTGTCAGCATTTTTTTCCTAGAAATTCGTGTTTCCATGTTAAGGAAATAAAAATGTCAATTTCTTTGGAAGTACAACTGTAGGAAAAGGATCCTAATGAAAATGAAAAATTATTAAGACAAACTTTACAGTTTGGTAGTTAGTAAAAGAGGGGTTTATCAGTGCCCACGATTATAGTAAGGCTTTGCAATTGGTCCAGCATGAAAACTCAATCTAGTTCTAATAGAAATTCGCTGATGCCAAATTAGTCTGGTGCACCTATCCTGTATGTAGTCCTATTTGAGACAGCATGATCATCACCATTATTATATCTCCTGGTGCTGTTTGTTTATTTCAATGCACATTCCCTGGTTATTATATACATTACATCCCCTTATTTGTTATGATATGTTTACCCTAGATCCATAGGTTAATTTGATGTAATAGCGTCACAAAATAATATCATGTTATTGCTTTTTTAGGACTGTAACCAAATCCATCTTTGTTTTGGGCATGGGTGTATCTT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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA016230