BGIOSGA016362

From RiceWiki
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

BGIOSGA016362

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016362, complete gene.

LocusTag

OJ000126_13.4

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA016362-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA016362-PA

Length

7167

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:18225932..18233098

Sequence Coding Region

18225932..18226265,18226355..18226414,18226988..18227041,18227155..18227327,18227469..18227655
,18227788..18227933,18228006..18228160,18228578..18228659,18228763..18228878
,18229714..18229809,18230267..18230390,18231516..18231784,18232243..18232454
,18232887..18233098

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:18225932..18233098 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:18225932..18233098 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGGTGCGCGCGAGCCTCGCCTGCTTCCCCTCCGACGCGGCACTCCAGGAGTCCTCGGGCATCCCGTGGGGCGTCGCCGTGACGCCCTTCTCCGCCGCCGACGAGCGCGGCGCGGCGCCCGCCACCGGCGCCGAGGGCCACCTCCTCCCGCGCTGCGACTCCTGCTACGCCTACTTTAGCACCCTCTGCCCGCTCCACCGCTGGTCGTGGTCCTGTGCCATCTGCTCCGCCGACAACGACCTCACCCCCGACGCCTCCGCGCGGTACGCCCGCGACGGCGGCCAGGACCCGCCCGAGATGCGCTCCGCCTTCGTGGACCTCCTCCTCCCTGGGGAAGAGGGAGAGGCGGCGACGACGACGCCAGTGTACGTGGCGGCAATCGACTTGTCCTCTTCGGAGGAGTTCTTGGAGCTAGTCAAAAGTGCTCTCCTAGCAGCTCTTGAAGCTATCCCTCCAGGATCATTATTTGGGCTTTTGACATTTAGCAGCAAGATAGGTTTATATGATGTTCAAGGTCCGATACCGATTGTGAAGAATGCTTTCATCCCTCCTGATTCTGATGGTACCTTACTTGTCGACCTTGAAGATGTCATGCCGCTTCGTTCCTTTTTGGCTCCTGTCGACGGTTGCAAAGATCGCATTGCTGAAGCACTTGAAACAATTAAACCAACATCTTCCTGGGAAATAACAGCAACTGCCTCAGAAGTCCAGGATCACGCGTTGCATCATGCCCGCGGTTTTGGGTTAGCAATGGATGCTGTTGTCAACTACCTATGTACAGAGTACGGAAGTTTGTTTGAACTTGCAAGGATATTCACATTTTTGTCTGGTCCACCGAATTACGGGCCTGGCCAAATAGAAACAAGAAGTGACGTGGACCATAATGCTGCTAAAATGCTGGGATCCGATCATACATTCATTTCCGAGCAGACAAATTTCTACACAAATCTGGCTGCTAGTGCTGTTCAAGCAGGTGTATGTGTGGACCTTTTTGCAATTACAAATGAATACACAGATCTTTCTTCCTTGAAAGTTCTTAGTGTTGAGAGCGGTGTCTCATTGTACATGTATTCAAGTACAGATGAATCAACACTTCCGCAAGATATATACAAAATGCTAAGCCGTCCTTATGCTTTCGGATGTGTGCTGCGTTTGAGAACATCTTCAGAGTTCAAGATTGCTGATTCTTATGGCCATTTCTTTCCGGATCCTCAATACATGCATGTTCAGCACATAAATTGTTGTGACTCATTTGCTACCTACGTCTATGACTTTGAGTTTCAAAAGGATTCTCAGTTTTCCAGGAAGTCAAGCCCTCCTATACTTCAAATTGCATTCAAGTACACAACGATTGTGCAACAGGGTGATACTTCTGATGATGTCTCAAATTCTGTCAGCAGATCAAAGTTCACCTTGCAAAGGCGGCTAAGAGTGCGGACTATCCAGTACAACATAACTGCTAATATCTGGGACCTGTATGATTTTGTTGATCCAGATGTTGTATTGACTATACTAGTACACCAGGTTATTTTGGCTTCGTTAAGTGATGTGCTAGAGGCAAGGATATGGCTCCGTGATTGGTTGGTGAATTTCATTGCCCAGTACAACAAGGCATACAAGGTCGTTAGATCTGGTGGAACTGGAATGTCTGATATTGATGTTGATTTCATACACTGCTCACAACTGCAACCTCTGTCAAGACTTGTATTTGCTTTTCTATTAAGTCCACTGCTTCAGCTTCACGGTCAAGGTATTCATCCAGATTATCGGACATATTTGCAATGCCTCTTCAGTGCACTGGAGGCATCATCGCTTCGCCAAGCTATATGTCCTACATTGATTTCATACTCTTCTCCTGATGTAGAAGCAGAAGTGCATCAGTCACTAAGTCGAAGTGTATTCAACAGTGAGAGCCCGATATTCCTTCTTGATGCCTACACTGATCTTCTGGTGTATTACTCACCTACAGTCAGTAGCACAATCCCCTTCCCTCCTCCACGTGACTGTCTGTTGAGATCCAAGATTGATAGATTGAAGCAAGAAAGGAATATAACCCCCAAGCTTGTCTTTATCCATGGTGCACACGATGATACTACAGCATTCGAGAGATACCTGATTGAGGATCAAAGTGTCGATGGTTCTTTGGTAGCTAGCGCCACAGGTTTTAGATCGTTCCTTGAGGGCATCCGAAGCAGGATAGCTGAGTACAGCAGATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAVRASLACFPSDAALQESSGIPWGVAVTPFSAADERGAAPATGAEGHLLPRCDSCYAYFSTLCPLHRWSWSCAICSADNDLTPDASARYARDGGQDPPEMRSAFVDLLLPGEEGEAATTTPVYVAAIDLSSSEEFLELVKSALLAALEAIPPGSLFGLLTFSSKIGLYDVQGPIPIVKNAFIPPDSDGTLLVDLEDVMPLRSFLAPVDGCKDRIAEALETIKPTSSWEITATASEVQDHALHHARGFGLAMDAVVNYLCTEYGSLFELARIFTFLSGPPNYGPGQIETRSDVDHNAAKMLGSDHTFISEQTNFYTNLAASAVQAGVCVDLFAITNEYTDLSSLKVLSVESGVSLYMYSSTDESTLPQDIYKMLSRPYAFGCVLRLRTSSEFKIADSYGHFFPDPQYMHVQHINCCDSFATYVYDFEFQKDSQFSRKSSPPILQIAFKYTTIVQQGDTSDDVSNSVSRSKFTLQRRLRVRTIQYNITANIWDLYDFVDPDVVLTILVHQVILASLSDVLEARIWLRDWLVNFIAQYNKAYKVVRSGGTGMSDIDVDFIHCSQLQPLSRLVFAFLLSPLLQLHGQGIHPDYRTYLQCLFSALEASSLRQAICPTLISYSSPDVEAEVHQSLSRSVFNSESPIFLLDAYTDLLVYYSPTVSSTIPFPPPRDCLLRSKIDRLKQERNITPKLVFIHGAHDDTTAFERYLIEDQSVDGSLVASATGFRSFLEGIRSRIAEYSR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..334#424..483#1057..1110#1224..1396#1538..1724#1857..2002#2075..2229#2647..2728#2832..2947#3783..3878#4336..4459#5585..5853#6312..6523#6956..7167#ATGGCGGTGCGCGCGAGCCTCGCCTGCTTCCCCTCCGACGCGGCACTCCAGGAGTCCTCGGGCATCCCGTGGGGCGTCGCCGTGACGCCCTTCTCCGCCGCCGACGAGCGCGGCGCGGCGCCCGCCACCGGCGCCGAGGGCCACCTCCTCCCGCGCTGCGACTCCTGCTACGCCTACTTTAGCACCCTCTGCCCGCTCCACCGCTGGTCGTGGTCCTGTGCCATCTGCTCCGCCGACAACGACCTCACCCCCGACGCCTCCGCGCGGTACGCCCGCGACGGCGGCCAGGACCCGCCCGAGATGCGCTCCGCCTTCGTGGACCTCCTCCTCCCTGGTATGGATCATAGTTGTCGATGTTCTCATGTAATGCAATGTGGTTGCCGTGTGATGATGAGGAGCTGATGTTTTTTTTCCTCTCGGCAGGGGAAGAGGGAGAGGCGGCGACGACGACGCCAGTGTACGTGGCGGCAATCGACTTGTCCTGTAAGATCTCAAAATTCCTTCGTCTCGAAACGTTTTAGAGGTGGTTGGCTATAAAATGCATGAAGCTTGCTTAATAGTCACTACTCACTAGTCAGCATGTGAGCCCCTTTTTTTTTGGGGTGCCATAGGAACGTGAATTTGAACTGAACATAATAACTTGCTATGCTCATGCCATGGATTTAGTCTAGTAATTGATCAACATGAGCAATGGTTCCTGTTTGTAACACGTGTGGATGTGTGTTTGCAAGCATGCTTGAATTGTAGAAAAAAAAGGAAATTAGCGTTGCAACATTTTGTTGATTACTGTGAACAGTTCTGTCAAGTTCTGGATCCATTTAGTTGATCGAGTTGGTTTTTGCATATGCATTATACCTTGATGGATGGCATCCAAATTCATTTGATCATTCCATCTTAATCCTATTGCTGTGATAAGTTAAATTGGACTCACTGTATCTATTGAAAGAGTATTGAGATTTACATGAAAATAACATTGATTTCTTTCAGCTGCAATCTTTCTAGACTTCCCGACTCATTTTCTGTAGATCTTATTTGTTTAATCATATTGTATTTTAGCTTCGGAGGAGTTCTTGGAGCTAGTCAAAAGTGCTCTCCTAGCAGCTCTTGAAGGTGAGATCCAGCCACAAGTTTTTAGGAGCTAGTACTAATCTATTGTGGACATCATAAAGTTCATGAGCTTCCTGTGCAACTATGTGTGCACTGATCCTTGTGATCCCATGCAGCTATCCCTCCAGGATCATTATTTGGGCTTTTGACATTTAGCAGCAAGATAGGTTTATATGATGTTCAAGGTCCGATACCGATTGTGAAGAATGCTTTCATCCCTCCTGATTCTGATGGTACCTTACTTGTCGACCTTGAAGATGTCATGCCGCTTCGTTCCTTTTTGGCTCCTGTATGTATACCATGCTGTTGATTGTAGTTTTGCCCTTATTCGCAATTCCTTTAATCTATGATTTTGTCTTTTACTGTGCTTTCTGCCCCTTCCTAGAATATTCATATCTGTCGTATGCTTATGTCAGTTATGTCTTAACAGGTCGACGGTTGCAAAGATCGCATTGCTGAAGCACTTGAAACAATTAAACCAACATCTTCCTGGGAAATAACAGCAACTGCCTCAGAAGTCCAGGATCACGCGTTGCATCATGCCCGCGGTTTTGGGTTAGCAATGGATGCTGTTGTCAACTACCTATGTACAGAGTACGGAAGTTTGTTTGAACTTGGTATGTGATATCTTGATTACGCTATCATTCTATTGTTTCATTTGTGGCTTATCTTCTTTTTGAAGGCTGTACTATGTTTGGTGGCGATTGACCTTGCCTTCTACTATAATGTTCTGTCCTGATTTTAAACAGCAAGGATATTCACATTTTTGTCTGGTCCACCGAATTACGGGCCTGGCCAAATAGAAACAAGAAGTGACGTGGACCATAATGCTGCTAAAATGCTGGGATCCGATCATACATTCATTTCCGAGCAGACAAATTTCTACACAAATCTGGTAAGTCTCTGTAATTTTTGCTCAATAAATTACAAGAATATTCTAGAATATATCCTAATTGGCATATCACAGGCTGCTAGTGCTGTTCAAGCAGGTGTATGTGTGGACCTTTTTGCAATTACAAATGAATACACAGATCTTTCTTCCTTGAAAGTTCTTAGTGTTGAGAGCGGTGTCTCATTGTACATGTATTCAAGTACAGATGAATCAACACTTCCGCAAGATATGTAAGTTTGCTCATCATCTGAGTTGTGTATCTCAATGTAATCATCAGTTCAACTTTATTGCTTCAAGATCATAGGTCCTTCAAATTTTCCACAGCCCAAGGTTTTGATTTATGTATGCTTGTACTCTTCTTCTCTCTCTGTTTGCAGAACAGTTAAATTGATAGAATTCTGATGTTCAGTGTATCCTGACAGTTGATCCTAATATTCCTCTCTGTTCAAGTTCTGGATCATATCTGACTTGTCTAATCCTTAATAGCCCAATGAATATTTAAATGATGGTTTTGCAGTACCCTGAATGTCACATACTATAACTATATGTATGTATGCGCAGAATGGCCTAAGTACAATGTACTGTTTATATGCGTAGATTATTATATATTACAAAGCAGCAATTGAGTTTTATCCTTCATTTTGCAGATACAAAATGCTAAGCCGTCCTTATGCTTTCGGATGTGTGCTGCGTTTGAGAACATCTTCAGAGTTCAAGATTGCTGATTCTGTAAGTATTATGAGGGATGTGCAACCCCTTATTCAGTTATTTGAGGTCTTTTTTAGATGTTCTTGTGGCTGATATTGTTTATTTTTGTTTTTTTTTTCAACAGTATGGCCATTTCTTTCCGGATCCTCAATACATGCATGTTCAGCACATAAATTGTTGTGACTCATTTGCTACCTACGTCTATGACTTTGAGTTTCAAAAGGATTCTCAGTTTTCCAGGTAAAAGGCATTCTGTTTCCCGACCATTTCCTGAATATGTGCTTTGCATGTGTTAGTATGTTATGGTTTTTGTCTGGAAGTAACTGGGCACTTTCCTTTGCTGTGGCAGATGGAAAGTTCCATTTGCAGCATTGATTTTTATTACTCCCTCTATCCCATAATATAACAAGCTAGTACTGGATGGGACACATCCTAGGACATGAATCTGGACAAGCTTGTCCAGATTCGTAGTCCTAGGATGTGTCCTATCTAATATTAGGTTACTATATTATGTGACGGAGGTAGTACTTCCTCCGTTTCATATTATAAGACTTTCTAACATTGCCCACATTCATATGGATGTTAATGAATCTAGACACATTAATATCCATATATCTAGATTCATTAACATCCATATGAATGTGGGCAATGCTAGAAAGTCTTATAATATGAAACGGAGGGAGTAGTAATTTTGTGGTCAACACCATAAATACTTGTTATAGATTTTTGTAACAGCATTCTCTATTTGTTGTGGCAATATTGTGGTCAATATCATATGATATGACGCATGAGTGAGGAGTTGCTTACTAGTTAGCATTTGAAAACAAAATATTCTGGCATAAAGACGCCAATGGATCTAAACCCAATCTATTCTGATTCTTGCTGTATTGTGTATTCAGCTTATATTTGGTTACCCATTAGTTTACTATAGGCTAAGGTATCGTGTTTAATTGTTAGGGCCATTTGTTTCCTTAATGTGGAATCACCGAATCAGTACAAGCCTTCAGCCAAACAGTTAAATTATCATTCTAAATGTATCTTCACCATCCTTACAGTATCATCTTTGTACCTGCAGGAAGTCAAGCCCTCCTATACTTCAAATTGCATTCAAGTACACAACGATTGTGCAACAGGGTGATACTTCTGATGATGTCTCAAATTCTGTCAGCAGGTAACTGCCTACAGCTTTTTTTTTCGGGAGTACGCAAAAGGCTTGTGTATCATTGTATTAAGGAGAAGAATTAAGAGTTTTACAACCATTGGCAAGCTGGGAACAGCCTGCTCCAACCAAATTACGGTATTAGCCGATCTGGCCCGGTTTTTCCCCACTAACCAATTACGTTACAACCACTGAAATCTCACGAAATATCTGGTGACCATAGATACAATAGACCATTTGTAAAATGTTACTATTCTTGCCATTTGCAAATGTCCATACTGCGTTTGCAGTAAATTTTTCAGTGATCTTTCTTTAGTATAAGTTTGTTTTTCTTGCTTGGCAAGTTTTCTTTTACTTGTTAGTGTGCAGATGTGATGTGCGAGCTACAATTTTATAGATAAACTCCCAAGTATACTGTACACATTGTACCTGGATGATAACATATTTTTAACTTAAATACATTGTTCAGATCAAAGTTCACCTTGCAAAGGCGGCTAAGAGTGCGGACTATCCAGTACAACATAACTGCTAATATCTGGGACCTGTATGATTTTGTTGATCCAGATGTTGTATTGACTATACTAGTACACCAGGTACAACCTTTTCTTTTCACATATTATTTTTAATGCAAGTTCAATGCATAAGATGTTTGTTGTAACGTGCAAGTACACATGCTCTTAGTGGAGCAAGGATACTCTGCTTGCATAAGCACTTTAGTTCAGAACATGCCAGTTACCCTGTTGCAAATATTCAACCCAGTAGCTAGCAGCGTCATCTGTATCAATGCAAGCAAGTTTTTACCACATCTTTATGTAGTATAACTGCATGCATTGTCTAGACTCTAGAACAATGTTGTGGTATCATCTGGGTGCTATGATCAAATGATGATATTACCATCATTTTGATTGTATCAACCATCTGTTGCTACTTGCTACAGGTTATATAACAACTTATGATTAGCTTAATTGCATTGCTACAAGAAAAGTCTGAAGATCAATGTCTCTGCATTTATATTGAACTTGATTTTACAGTAATGTAGCCAAATGTCTGCAAATATATATGTTCATTTAAAGCTTCTAAGCTTAGGTATGATTAGGCTACACCAGTCAGGGCTGGTTTGTCTTGTTCCATTTTTTTTTAAAATGTTCAGCCTGGGGTGTCTTGTCTCAGTCTGTAGCTTGGCACATGGCTGATGCTCTGGCAGTCTGGTACTTTCTGTTTTGGCGTAGCTTCATCCAATCCCAGTAAGTTTTGAATTACTAGTTTCCAAAGTGCACTGTGAGGTTGTGTCATGTCTGTGTGCAAAAAGTGAGCTAAATTTGACTCACAGCATAATGAATTGCAGTCTAGCTTAACACTAATGCTTGAAATCAGCTTGTTTACCGAATGCAGTTATAAAGGCGACATACTATCTGATTTCATTAGCATCCTTAACCTAGATCTTCCCTTTCTGACAAATTAGGGGGAACTAGACATTAAGAAGAGCGACACCTAAATCTGATTTGAATAAATAGGACATGGACTTGGCCACTTGGGTAATGTTTGTACACTCAGACCTCCCAGCTAACTAACTTAGCTCAGCTCCTTAAGCTTAAGCTTGATGACTAAACAAACAGGAGGAAAGGTTGTTCATCAAACCTATTTTGTATCGATACATAACATTCTACAATGCAAGTTGGTGCTACCAAGGAAAGATTATTTGAGGATTGAATTTCCAGGTTATTTTGGCTTCGTTAAGTGATGTGCTAGAGGCAAGGATATGGCTCCGTGATTGGTTGGTGAATTTCATTGCCCAGTACAACAAGGCATACAAGGTCGTTAGATCTGGTGGAACTGGAATGTCTGATATTGATGTTGATTTCATACACTGCTCACAACTGCAACCTCTGTCAAGACTTGTATTTGCTTTTCTATTAAGTCCACTGCTTCAGCTTCACGGTCAAGGTATTCATCCAGATTATCGGACATATTTGCAATGCCTCTTCAGGTAATATATATTTTTCCACCATGGAATTACTGGAATGATGTAGAAAAAATCAATAGGATTTCATGATCTTCTTGTGCTGTGATTTTTCTTCTCTCAAATTCCTGTCCACTCCCGTAATACTGAGTTATATTTGAATATAGATAGCTTGGATCTATGTCACGGCATATTTCATAGTAAACATGGGTGCTTATCATGTAGGCAAAGTATTTATGTTTCCGCATATGACAGCATAGTACATGACATTCGAACCAAGTCTTGGGTGACGATAAAATTGTATATAGATAATTCCATTCTACCATATACTGCTGATCACAATTATTTCATTGAAACATTTAAAATTCAAATGTTTGATTTGTTACCATTGTTTCCTATCTGAGTCATTGCCATAGCTTTGGCCTATTATCTAAAAATTTTGTAGTACTCTAAATAGACTTACTTTATTATCTCTTTATTTACAGTGCACTGGAGGCATCATCGCTTCGCCAAGCTATATGTCCTACATTGATTTCATACTCTTCTCCTGATGTAGAAGCAGAAGTGCATCAGTCACTAAGTCGAAGTGTATTCAACAGTGAGAGCCCGATATTCCTTCTTGATGCCTACACTGATCTTCTGGTGTATTACTCACCTACAGTCAGTAGCACAATCCCCTTCCCTCCTCCACGTGACTGTGAGTCTTCCAATCCCACATAAGTTATTTTTAAGGCAGTTGCAGTCTTGTTTTCACTCACTGAATTTTTTTCACTCCGCACTGATGTTTTAGACTTGGCCTCATAATATTACTGTCAATTAATTAAATTGTCTTATCACCTTACTAAAATATGTTTGTTTCCTAAACCACTCACGTTTGGTCCAAGTCCCCCAAAGGATTATCACAGTGGCCAATGAATAGACACAGTGACATCAGATTTGATGAAGTATAGGATGATGGATGATTACTCTCATTTAGTGTTGGAAACACAGAACATCCATTAAAGGATGGTATTTACTCTCTTTAGTTTTTTTTTTTAATTTTTAAACAAAAGAATGGATAGGTTACTATTAATGATCAGTGATATTTATCTATATCATGCATGCACTAAAACTGAGATGGTATTTATAGGTCTGTTGAGATCCAAGATTGATAGATTGAAGCAAGAAAGGAATATAACCCCCAAGCTTGTCTTTATCCATGGTGCACACGATGATACTACAGCATTCGAGAGATACCTGATTGAGGATCAAAGTGTCGATGGTTCTTTGGTAGCTAGCGCCACAGGTTTTAGATCGTTCCTTGAGGGCATCCGAAGCAGGATAGCTGAGTACAGCAGATAG</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA016362