BGIOSGA016540
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA016540 |
|---|---|
| Description |
Os04g0459900 proteincDNA clone:J013041F13, full |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016540, complete gene. |
| LocusTag |
H0219H12.5 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA016540-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA016540-PA |
| Length |
5185 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:21123177..21128361 |
| Sequence Coding Region |
21123177..21123238,21123669..21123787,21123936..21124018,21124117..21124215,21124521..21124587 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:21123177..21128361 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:21123177..21128361 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTATCGAGTGCGCCGCCTCCTCCCCCTTCACCCGCGACGGCGAGGAAACGGCCCCGAGGTCAATGATGGAAACATATGGTGAAATGTCAAGTAAACCTGTATTGCTTGCGTCAAGGAGGAAGCTTGTTGCATTATCATCGTTTTGCTTTTGCTTACATTCTTCAAGGTACTTCTCAGCACTTGCTTTGGGTGATCCATCTGTTAAAATTGATGATGTCACTCCAAAGATTTTTCCATCTGGTCCACTGTTTCCAACTGAGAAACGGATCGCAGAGCTTTTTGAAACAAATACTTACTCTGTTGTCAACATTTTTGATGCAACTCTGCGCCCTCAGCTCAATGTAACTGGTGTTGTTGAGATTCCCGAAGGAAATGGTTCTGGCGTAGTTTGGGATGATTCCGGCCATATTGTTACAAACTACCATGTGGTTGGCAATGCCCTTTCAAAAAAACCAAAGCCTGGCGAAGTTGTTGCGCGTGTCAACATTCTTGCTGCTGATGGGATACAGAAAAATTTTGAAGGCAAATTGGTTGGTGCTGACCGTTCTAAAGATCTTGCTGTTCTCAAGGTGGATGCTCCTACAGATCTGTTGAAGCCAATTAACGTGGGACAATCTTCAGCTCTAAGAGTTGGTCAACAGTGTTTAGCAATTGGAAATCCATTTGGCTTTGACCATGCTCTAACTGTTGGTGTCATCAGTGGTTTAAATCGAGACATTTTCAGTCAAGCTGGAGTAACAATTGGAGGTGGAATTCAAACAGATGCAGCTATTAACCCTGGGAACAGTGGTGGTCCATTGCTGGATTCGAAGGGGCATATGATTGGTATTAATACAGCAATTTTCACACAGACAGGAACATCTGCTGGTGTTGGTTTTGCCATCCCGTCATCAACTGTTCTGAAAATAGCTCCTCAGTTAATTCAGTTTGGAAAAGTTCGCCGTGCTGGCTTGAATGTGGAGTTTGCTCCAGATCCAATCGCATATCAGCTTAATGTTCGCACTGGATCTCTAATATTGCAGGTTCCTGGGGGCAGTGCTGCAGCCAAAGCTGGTCTTGTTCCTACCAGTAGGGGTTTTGCTGGTAACATTGTTCTTGGTGATGTCATTGTTGCCGTGGACGGTAAACCTATCAAAGGCAAATCTGATCTATCGAGGGTTCTGGATGATTATGGCGTTGGAGACAAGGTGAGCTTGACAATCCAAAGAGGCGCTGAAACTCTGGAGGTAACCTTGCCTTTAGAAGAGGCAAGTATCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAIECAASSPFTRDGEETAPRSMMETYGEMSSKPVLLASRRKLVALSSFCFCLHSSRYFSALALGDPSVKIDDVTPKIFPSGPLFPTEKRIAELFETNTYSVVNIFDATLRPQLNVTGVVEIPEGNGSGVVWDDSGHIVTNYHVVGNALSKKPKPGEVVARVNILAADGIQKNFEGKLVGADRSKDLAVLKVDAPTDLLKPINVGQSSALRVGQQCLAIGNPFGFDHALTVGVISGLNRDIFSQAGVTIGGGIQTDAAINPGNSGGPLLDSKGHMIGINTAIFTQTGTSAGVGFAIPSSTVLKIAPQLIQFGKVRRAGLNVEFAPDPIAYQLNVRTGSLILQVPGGSAAAKAGLVPTSRGFAGNIVLGDVIVAVDGKPIKGKSDLSRVLDDYGVGDKVSLTIQRGAETLEVTLPLEEASI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..62#493..611#760..842#941..1039#1345..1411#1545..1620#1751..1817#2607..2824#3428..3495#4047..4126#4666..4752#4828..4935#5057..5185#ATGGCTATCGAGTGCGCCGCCTCCTCCCCCTTCACCCGCGACGGCGAGGAAACGGCCCCGAGGTATGCCCGCCCCTTGCCCCTGCGCCAGAAATTTTGTTCTAACCGGGTGGTTTTCATCGGTACAATCTGGTGGTTCTGGATAACTGTATTGCGTAGTTAGTGTAGGATGGCCCAATTTGGGTACCTTTCGCTTGCTGAATCTCGGTTGCTTCTAGCGGGAGATTATTGATTATTCCAGTTGTGTTCCGTTTGATATCTAGTAGAGTAGTAGTTGATGAATTTTTAGGGGAAAATTCGATGTGCGAGAACATTCGTGTTAGTTAACTCACCATCAAGCAGCGTCCACATTTTCTCATGTTCTGTTAGTAGTATTTGTCTTTTGCACGGCGCTCACTCTGTGACTATGTGCACCTGCATTAGGTATTCATAGTTGGTTGACCGTTTTCCTATTCACTCTATCTGTTTATGTTTATCTGAAATTATATTCCAGGTCAATGATGGAAACATATGGTGAAATGTCAAGTAAACCTGTATTGCTTGCGTCAAGGAGGAAGCTTGTTGCATTATCATCGTTTTGCTTTTGCTTACATTCTTCAAGGTACTTCTCAGGTTCGGACTAAGTGGCATGATAATTTAGGTGTTAATAGAAATTAACTCGATCCTTGTCAGTTGTCACCTACCCAAATGATTGCTTTTGTAGTATTTAATTTACTCTATAAGTGTTCATGCTTTGTAACTTACAACTCCTTAAATACAGCACTTGCTTTGGGTGATCCATCTGTTAAAATTGATGATGTCACTCCAAAGATTTTTCCATCTGGTCCACTGTTTCCAACTGAGGTCAGTACTTAGTTGAACCCACTTTATCCTATTTTACTTCTTCCAAAAATATATTTACATTTCTTTGGATATTTCTTCTTTTATGGCTTGCATGGCAGAAACGGATCGCAGAGCTTTTTGAAACAAATACTTACTCTGTTGTCAACATTTTTGATGCAACTCTGCGCCCTCAGCTCAATGTAACTGGTGTTGTTGAGGTAAAACTAAAATGTGCTTTCGTGTTATAGGTTAGAGTAGAGTCAAGAGTATGTGTTAGTTGTTGCTCAAATTGACAAATGCATCACTAGTATTCTCCATAGAAGCACTAGGATAGGACAAGTCTGGCATTCTTTCTTTCTGAACTGGTGATTCGATCAAGCTAAAGTTAGACAAGGAATTGCTGATTTATTGTCTTGATGTCCTGTATATCTTTCGCAGATATCATGTGTAGAGTCTTATTGTTACTTTTAATAGAAATTTTAGAAGCCCTTGTTTGAAAGAAACTTCTTAATATTCATTATAGATTCCCGAAGGAAATGGTTCTGGCGTAGTTTGGGATGATTCCGGCCATATTGTTACAAACTACCATGGTATGGCAGTCAGTAAATTAAAAACCCATCATATGTGAGAGATCTAAATTCCTTCATACATAATTATGGTGCTTGACCCTTTCACCCTGTTGCACACTCATCTTATTCATTTTAATTGTTGGTGCAATGACAGTGGTTGGCAATGCCCTTTCAAAAAAACCAAAGCCTGGCGAAGTTGTTGCGCGTGTCAACATTCTTGCTGCTGATGGGTAAATTCTAATAAAACTGCATTTTACAGGATAGTTTCATGATTTAATGTATATACAATTGCAATGTTCCTTGTATATGCAAGCCAACTAATCGTTAATGCTCTGGTGCTCTCCTATATCTACCTGAAAGGATACAGAAAAATTTTGAAGGCAAATTGGTTGGTGCTGACCGTTCTAAAGATCTTGCTGTTCTCAAGGTGAGAAGTCTTTTGATTAGCTATAGAGAATTGTCATCTATCATCACTATGTTTACCATAGGTTTCTCTCATCTCATTTCGGTGTGCAACATTTTATATTAGTCATTCAATTCATTTCATCTCCCTGGTGGCCTGGCATGTACATGCCTCAAACTCTCATTAATATCCTTCTGTCGTTAGCCAAGGATTTAACTATCTGCTCATTTTTATCTCACATGGCATATGTCATGGACTAAGAAAATAAAAAGGGAGTAGAAAGTGGAAGTAACAGAAAAAGAAAAAAATGATACTTTTGGAGTTTTAGTTTCACAAGTAAAAATTCATCTCTTTAGCCAACTGCTTCAGTTTTTCCCTTTTTGTTGTTTTGTTTTGTTATGGTATAATAGTTTATTTGTGACAGTAACACAACATTTTCTTCTGTTGAGTTAGGGGTCCCATGCTATTTGATTGAAATGTTTTTTGAAGAGTTAAGTTACGAAACTGAGGGGGGGGGGGGGGAGGGGGGGAGGTTCCTTTCAGAGGTCAAGAATACATACTTTTGTTTGCCCCGTCCTTTCTTCTTTTACGGAAATAGTATATGTATGTTTTTAGATACCAAGATGTTTTTATTTACCTACTCATCTTATGCCTGCCTTGTCCCAATGGAATCTAGTTCAAGGACAACCAATGGAAGGGCTGTATTAGATAATTTTACGGTTTGTTAGTGCGTAAAGTCCTGTTGTGATTTTCACCTGAGCTCAAATGTTGTCAGACATAGTACCTCATATATGGATTATGGACATGCAATAGGTGGATGCTCCTACAGATCTGTTGAAGCCAATTAACGTGGGACAATCTTCAGCTCTAAGAGTTGGTCAACAGTGTTTAGCAATTGGAAATCCATTTGGCTTTGACCATGCTCTAACTGTTGGTGTCATCAGTGGTTTAAATCGAGACATTTTCAGTCAAGCTGGAGTAACAATTGGAGGTGGAATTCAAACAGATGCAGCTATTAACCCTGGGAACAGGTTTGTAGATATGTTTCTTTAATGATTTATCAACTGATTACCCTTTTCTGGTCTCAGAACCCAACCTGGAAACTACCATTAGTTGTACTGGTTTACATCTGTATATTACTTACTGACAAGCATAAACACTTTTGTCACTAGTTACTTGATGGCTATACTGTATTACTGTTTATGGTTTCTACTATGCACAAAATGATAGTACTTGCCTATAACAGTGCAAAACAGTTGACTCAGGACACAGAAGAGGAAGTATTTTACTTCTTACTTTCTTGAGTTTCTAGCATCGCATCTAAAGTCAGGACACATAGATTGGGGCTAAATTGCAGCTCTGGCAGTTGGCATAGTGGTAATATTTGTTGCTACCAGTTTACTATATTAGGGTAGAATTTGATCATATTTGTGGTCAAAATCAGCTTGACCATGTATGCCCTCGTCCTTGAAGTGATTTAGTATGCATTACCTGTACTCTGGGGCAATGAACATCTAGGGTTAAGGATCATGTTGTAAGTAGTGGTTTATACAATATGTGTTGGATATTTATGTTTCTGAAAATGTATTATAGAGGGTTTTACTAAGCATGTATACTGATGTATGTCCATGCAGTGGTGGTCCATTGCTGGATTCGAAGGGGCATATGATTGGTATTAATACAGCAATTTTCACACAGACAGGTTAGATTATCTCAACATGAAATGTATTAATCAAATAGCACTGAATTGTTTCATGCTGATTTGCGGAGGTAACATTAGTAGATGTTCATGCTTTCTCTACAGATGTCAAGCACTGCACTTAGCATTCAAAAGAGAATATGTCCAATTAGTAAAAGTTCATCCTCAATAAACTAAAATGATCATAACACATTGCAAAGCTTGCCTCGATCCCTGTACATCAGTTCATTTCCCAGAGTACTCTGGTTGATGGCACACTTTGAGTGACTTTCTATTTTGATGGCATGATTAGTGAGTGGTATCATCTATCATGTTTATATTCGGATTCACAGCATTCTTTGAAATTGTTATTTGCTTGCATCCTAATGGGCTGTAAGAATTGACATAATTGATTATAGTTGACTCAAAATCACCTCCTTGAAGCTGTGCATTAGACCATTTGTTTTTGTTGTTGATTTGGTAGAGCATAAATCAGATATTCAGATCCAACTATGTCCAATGTAACTTAAATTCCTATGTTAGTCTGAGATTCCATTATTTCTTCAATGTCGCAGGAACATCTGCTGGTGTTGGTTTTGCCATCCCGTCATCAACTGTTCTGAAAATAGCTCCTCAGTTAATTCAGTTTGGAAAAGTATGTTGCATGGATATCTTTCAATAACATCATCATCAACCTAATAACATACGTATTTTCTAATCATCCCCTTAGAATAATGTGTTATGTTTATGGAGATGCCATATGTAGGTATATGTTTCATGCATTAGATGGCATCTTATGGATTGTGATTCTTTATCAATAATCAATAACTGTGGTTGTCATGATTTTAGACCAACATGCTGTGAAACATGCTCAGAGTCAACTTTAGGTGTTAGCAGTAGGAGGAAACTTTCGGTTGATAAGTTTTTGTAAATACTATAGGGACCTTTTCCAAAGATAGTTAAATTAATTTTGGTCTGAGTTTGGCCCAAAACTTTGCCCTCCCCTCCTGAAAACTCTCTTGAAACTTTGTGAACACTATTGCTTGAATGTTTTTGTTGCAAAAATTTTGAGCACAGATAAATTTTAGATTGCTATTAAGAACCTTCTTTCTTTTCCATTGCCGACACATGTGCTTAGCAGTTAGCTTCTGTATTCTATTTTATTTTAAATTATGCTTACACTCCTCTCTTAAGGTTCGCCGTGCTGGCTTGAATGTGGAGTTTGCTCCAGATCCAATCGCATATCAGCTTAATGTTCGCACTGGATCTCTAATATTGCAGGTAGACTGAGTTGGTGTAACCCATATTTTCTGTTGGCCAAACTGGATTCTGTTCATAATATTTCTGTTTCTGCAGGTTCCTGGGGGCAGTGCTGCAGCCAA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