BGIOSGA016808
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA016808 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016808, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0074L08.13 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA016808-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA016808-PA |
| Length |
4122 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:25240326..25244447 |
| Sequence Coding Region |
25240326..25240514,25240602..25240801,25240905..25241016,25243454..25243570,25243689..25244000 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:25240326..25244447 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:25240326..25244447 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTGATCGCTTCTTCCCCAACAATATGCCGGGCTATGCCGACGAAGGCGCGCCGCCGCCACCGGCGGCAGCGGCGGCGGCGGCGATCCCCTCCACCTACTCCTCCTCTCTCCACCACCTCCTCTCCCTCCCCTACCCCGACCTCGCCGATCGCTTCCTCCACGCGGCGCTTCACCTGAAGCAGAAGGTGGTGCACGAGACGTGGGATAAGAGGCGGCGCGCCGCCGCGGCAGCGGGGGAGGCAGTGGGCGACTTCACCCTCTACACCGGCGCGCTCGGCACGGCGCTCCTGCTCTTCAGGGCCTACCTGGTCACCGGCGACCGCGCGGACCTCGCCACGTGCGCGGAGATCGTGGCCGCCTGCGACGCCGCATCCATGGGGGCCGAGATCGCCACGTTCATCTGTGGGCGAGCTGGAGTCTGCGCCCTCGGTGCGGTGGTGGCCAAACACGCCGGAGATGAAGCTGGCGTTGCTCATTACCTGAGCGCGTTTAAGGAGATCAAAATTCATAGTAAATCACCTGATGAGCTTCTATATGGAAGAGCTGGATACCTATGGGCATGCACCTTCCTAAACAAGCACCTTGGAGATAATACTATACCGCCAACCACTACAGACACTGTCATGAGAGATATTATCAGAGATGGTAGAACACTGTCCACGATAGGCTGCCCATTGATGTATGAATGGTATGGTGAGAAGTATTGGGGTGCTGCTCATGGACTTTCTGGGATCATGCATGTTTTGCTGGACATGGACTTGACTAAAGATGACACGGAATGCGTAAAGGGAACCTTGCGCTACATGATTCAGAACCGGTTCCCTAGTGGTAATTACCCTGTTACTGAGGAGGATAAGCATGATCGATTTGTGCACTGGTGCCATGGGGCTCCTGGCATTTCCCTCACCTTAGCAAAGGCTTCACAGGTGTTCCCAGAAGAACGATTCCTTGAGGCAATTGCAGAGGCGGCAGAGGTTGTTTGGAATAGAGGGCTGCTCAAAAGAGTTGGAATATGCCATGGAGTAAGTGGGAACGCCTATACATTTCTAGCACTTTTCCGCCTAACGAAAAAGAAGGAACACCTCTACCGTGCTAAAGCTTTCGCTTGCTTTCTCCTTGACCGAGCTAAACAACTGATTGCGGATGGCATCATGCACAGTGGTGATGAGCCGTATTCCTTGTTTGAAGGACAAGTTGGAATGGCTTACCTGTTTCTGGACATGATTAACCCCCTTGATTCTAGGTTTCCAGGTTATGAACTTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MADRFFPNNMPGYADEGAPPPPAAAAAAAIPSTYSSSLHHLLSLPYPDLADRFLHAALHLKQKVVHETWDKRRRAAAAAGEAVGDFTLYTGALGTALLLFRAYLVTGDRADLATCAEIVAACDAASMGAEIATFICGRAGVCALGAVVAKHAGDEAGVAHYLSAFKEIKIHSKSPDELLYGRAGYLWACTFLNKHLGDNTIPPTTTDTVMRDIIRDGRTLSTIGCPLMYEWYGEKYWGAAHGLSGIMHVLLDMDLTKDDTECVKGTLRYMIQNRFPSGNYPVTEEDKHDRFVHWCHGAPGISLTLAKASQVFPEERFLEAIAEAAEVVWNRGLLKRVGICHGVSGNAYTFLALFRLTKKKEHLYRAKAFACFLLDRAKQLIADGIMHSGDEPYSLFEGQVGMAYLFLDMINPLDSRFPGYEL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..189#277..476#580..691#3129..3245#3364..3675#3784..4122#ATGGCTGATCGCTTCTTCCCCAACAATATGCCGGGCTATGCCGACGAAGGCGCGCCGCCGCCACCGGCGGCAGCGGCGGCGGCGGCGATCCCCTCCACCTACTCCTCCTCTCTCCACCACCTCCTCTCCCTCCCCTACCCCGACCTCGCCGATCGCTTCCTCCACGCGGCGCTTCACCTGAAGCAGAAGGTTAACTCGTCCACCACCGTATCGCTAGTTCGTCACCTCATGCGCTGATTGAGTGATTGATATTCTGGTGTGCTCCTCGTCGATCAGGTGGTGCACGAGACGTGGGATAAGAGGCGGCGCGCCGCCGCGGCAGCGGGGGAGGCAGTGGGCGACTTCACCCTCTACACCGGCGCGCTCGGCACGGCGCTCCTGCTCTTCAGGGCCTACCTGGTCACCGGCGACCGCGCGGACCTCGCCACGTGCGCGGAGATCGTGGCCGCCTGCGACGCCGCATCCATGGGGGCCGAGTAATCTGCGCGTTCCTCAGCCGCTTCGTCGGGCGCAGCAGCGTTTTGATTTGGTTTGGTTTGGTAAGGTGGTGACTCGGTGGGGTTTGGGGGATTTGTGCAGGATCGCCACGTTCATCTGTGGGCGAGCTGGAGTCTGCGCCCTCGGTGCGGTGGTGGCCAAACACGCCGGAGATGAAGCTGGCGTTGCTCATTACCTGAGCGCGTTTAAGGAGGTGATTAAGCGTAAAATGCTGCTGCTGATGATGCCTATAACGTGATTGTGATGATTAGCCTTCTGAACTCGATAAATTTGTAGTTTGACTTGGATGATGCTATAGGTGCAGGTTCATCTCAGTTAAAACTGGAATGGCAATAGAAATGAGCATTGGCTATTTTGGCTTATTATAAACTAGCTGGGTAGCCCGCGCAATTACGCGGCTAGCAGAAAAAAATAATATTTTTTTAAGTATAATCTTACTTAAAATTTATTAAAGAGCTATCTCAATGTTAAGACTTTAAAAGACCAAACCTTATCATCCTCGTGTTTCTAATTACATAGTTTTTAAAATCACACCAGTTGCTACCTCTTATGTCATCTCCTTCTTTATTTGCTTGCTCAATCTATCACTATTTCTATTTATTATTCTTGGAGCCTTTAAAAATTGGATTTTATAGTTTTTAGAGTTTATTGTCACGTTGGGTTTCGTTTTTATAATTTCTAGATGTCCCATCAAACGTTGCCATTATACTCCCGTCCACTATCTCTTCTCTTTATTGTCATTGAGATTTTAAAAATCGAACATAATTATAGTTTGGGTTCATTTTTACTTTCTAGAAGTCCCGCCAAACCGTCAGCGGTTTTGCCATTATGCTCCTCTACGGCTCGCCCGCTGCCTCCCTTCTTTATTGTCATTAAGATTTTAAAATCGAACATGATTATCATTGTTTTTTTTTTACTTTTTAGAAGTTCCGAACCTTTAAAAATTGGACTTGTAGTTTTATTTTTTATAATTTTTAGAAGTCCCATCAAACGATGCCACTATGCCCCTCTGCAGCTCTCGTCCGCCGCCTACTCTTTATTTTCATTGTGATTCTAAAAATCGAACATAACTATTATTGCAATTTATTTTTTATTTTCTAGAAGTTCCGTCAACCGTCGGAGGCTCTGCAACTATACTCTTATACACCCCGCCCACTGCTTCTCCTTTTTATTGTCATTAAGATTTTAAAAATCGAAAATAATTATCAATGTGGTTTTTTTTTTCTTTTTACTTTCTAGAAGTCTAGGCAACCGCTTTACTTGTTTGCTTCACATCCTACCTGACATCCCTCCTTTTAATCGTCATTAGGATTCTATTTGGTGTTTCATTAACAATTTTTATATACCATATCAACCACCACCAACTCTACTTATTTATAGGCCTGTTACTTAATTTATCTCGTTGTGTGTTTTAGATGGTCTTTTCTTTCAATAGTCTTTATTTTTATCACAAATTTTAGTTATTTATAAATTTTATTCCTAATTGAAATCTTTTTTTTCTAATTTCAGAATTTATTTTTTCTAAAAAAATTAGTTAATACCATATTGTGTTCTTTTAATGTTTTTATTTCTTATTTTCAACTTTAGTTGTTTCAAAATTGTATTTCTAATTGAACTCTCTTTTAATTTTTCTAATTTTGGATATTATTATATTTTTATTCGAAATTTTAATTAATCTCGTATTGGGTCCTTATATGGATTCTTCTTTCAATATTGCTTATTTTTAATTCCGAATTTCAGCTAATTTTAAATTGTATTCCTACTTGAACTCTTCTTTATTTTCTTTTTCCTTAATTTCGGATTTATTTTTCTTTTTATTCTGAATTTTAATTAATCTCATATTGGGTTCTTATATGGACTGTTTTTTTAATATTCCTTATTTTTAATTCCGAATTTCAGCTATTTTTAAATTGTATTCCTACTTGGACTCATGTTTCCTTTTCTAATTTTGGCTTTTAATTTATTTTTATTTCGAATTTTGATTAATCTCGTATTGGGTTCTTATATGGAAACTTCTTTCAATATTGCTAATTTTTAATTCCGAATTTCAGCTATTTTTAAATTGTATTTCTACTTGGACTCTTCTTTCCTTTTTCTAATTTTGGATTTGATTTTATTTTTATTTTGAATTTTGATAAATCTCGTATTGGGTTCTTATATGAAAACTTCTTTCAATATTGCTTATTTTTAATTCCGAATTTCAGCTATTTTTAGATTGTATTTCTACTTGGACTCTCCTTTTCTTTTTTTTTTCTTTTTCTCCGATTAATGTGAGAATTTCTAGCCCTCACAGCGAACGTGGTGCCTCCTTTCAAAGCTTTTTTAATAATATAATAGATAGATTAATTATCAGGACTTGGCTTGAGCTCCTAAGAAATGAAATTGCTGTTTCTAAATAAGAAGCCACATATCAAACAACACTGAACCATAGAAATTTTACTGCTGTTTTATTACAGTATGCAATAACAATTTTACGTTTGATCGGTTGCACTGTTTTATAGAAAAAAAATGTTAGTCCCAAGTATGTCTCTTTACTCACTTGAAAGTTCATCCATCTAAACAAAGCAATATGTTATCTATGGTAGTATGGCCCATGTTCATGTGACATAACATGTATTATCCTGGTATAGATCAAAATTCATAGTAAATCACCTGATGAGCTTCTATATGGAAGAGCTGGATACCTATGGGCATGCACCTTCCTAAACAAGCACCTTGGAGATAATACTATACCGCCAACCACTACAGTAAGTACACAGTTCAATCTTTAGTGCCTTCATTTGTCATTCTTCCATTCATACTTGTTGGATGATCGCTGGGCACATGCGATGGATGATCATCATCATTCTATTGAACTATTTGTAGGACACTGTCATGAGAGATATTATCAGAGATGGTAGAACACTGTCCACGATAGGCTGCCCATTGATGTATGAATGGTATGGTGAGAAGTATTGGGGTGCTGCTCATGGACTTTCTGGGATCATGCATGTTTTGCTGGACATGGACTTGACTAAAGATGACACGGAATGCGTAAAGGGAACCTTGCGCTACATGATTCAGAACCGGTTCCCTAGTGGTAATTACCCTGTTACTGAGGAGGATAAGCATGATCGATTTGTGCACTGGTGCCATGGGGCTCCTGGCATTTCCCTCACCTTAGCAAAGGCTTCACAGGTTTGTTTTCTATTCTCAGATCATCTCATCTCAACCACCTGCTTTGGCTGCATGTTTCGTTCTGGCAATCTGTTACATTCTGCATATACTATGTCATATCCTTACCAGGTGTTCCCAGAAGAACGATTCCTTGAGGCAATTGCAGAGGCGGCAGAGGTTGTTTGGAATAGAGGGCTGCTCAAAAGAGTTGGAATATGCCATGGAGTAAGTGGGAACGCCTATACATTTCTAGCACTTTTCCGCCTAACGAAAAAGAAGGAACACCTCTACCGTGCTAAAGCTTTCGCTTGCTTTCTCCTTGACCGAGCTAAACAACTGATTGCGGATGGCATCATGCACAGTGGTGATGAGCCGTATTCCTTGTTTGAAGGACAAGTTGGAATGGCTTACCTGTTTCTGGACATGATTAACCCCCTTGATTCTAGGTTTCCAGGTTATGAACTTTGA</dnaseqindica> |
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