BGIOSGA016889
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA016889 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016889, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0010H02.6 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA016889-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA016889-PA |
| Length |
5414 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:26432802..26438215 |
| Sequence Coding Region |
26432802..26432874,26433009..26433073,26433469..26433558,26433647..26433733,26433832..26433891 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:26432802..26438215 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:26432802..26438215 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGATCACCGCCCAGACCCCCGACATCCTCGGCGAGCGCCAGTCCGGCCAGGACGTCCGCACGCAAAACGTGGTGGCGTGCCAGGCGGTTGCCAACATCGTTAAGTCCTCGCTTGGGCCCGTGGGGCTCGACAAGATGCTTGTGGATGATATTGGTGATGTTACCATAACAAATGATGGAGCAACCATTTTGAGGATGTTGGAAGTCGAGCATCCAGCAGCAAAGGTTCTTGTTGAGTTGGCTGAGCTTCAAGACAGAGAGGTGGGAGATGGAACGACATCTGTTGTGATAATAGCCGCAGAATTGCTAAAGCGGGGCAATGATCTTGTGAGAAACAAAATCCATCCGACATCTATTATCAGTGGCTACAGGCTTGCTATGCGTGAAGCTTGCAAATATGTTGAAGAAAAGTTGGCTGTCAAGGTTGATAAACTTGGAAAGGATTCTCTTATAAACTGTGCGAAGACAAGCATGTCCTCGAAGCTGATTAATAGTGACAGTGATTTCTTCGCAAATCTGGTTGTCGATGCAGTCCAAGCTGTGAAGACCACAAACGCTAAGGGAGAAGTGAAGTATCCTATCAAGAGCATTAATATTTTGAAAGCCCATGGTAAAAGTGCCAAGGACAGTTACCTGCTGAATGGGTATGCACTAAACACAGGCCGTGCAGCTCAAGGAATGCCTACTAGAGTAACCCCGGCAAGAATTGCATGTCTTGATTTTAACCTTCAGAAGACAAAAATGCAATTGGGTGTTCAAGTCCTTGTAACTGATCCAAGGGAACTTGAGAAAATTCGTCAGAGAGAATCTGACATAACAAAGGAGCGAATTGAGAAAATTCTGAAGGCTGGTGCTAATGTTGTACTGACCACTAAGGGAATTGATGATATGTCACTGAAGTACTTCGTTGAGGCTGGTGCAATTGCTGTAAGGCGTGTGCGTAAGGAGGATTTGCGCCATGTTGCCAAGGCTACTGGTGCAACTATGGTATCTACATTTGCTGATATGGAAGGTGAAGAGACATTCGATTCATCGTTCCTTGGACATGCTGATGAAGTTGTTGAGGAAAGAATTGGTGATGATGATGTAATTTTGGTGAAAGGAACAAAGAACACCAGCGCTGTCTCAATTATACTTAGAGGCGCAAATGACTTCATGCTAGATGAGATTGACAGATCATTGCATGATGCATTGTGCATTGTGAAGAGAACGCTGGAATCCAATATGGTTGTTGCTGGTGGTGGTGCAGTTGAAGCTGCATTGTCTGTATACTTGGAGAATCTTGCTACAACCCTTGGGTCCAGGGAACAGTTGGCCATTGCTGAATTCGCGGAATCTTTGTTAATCATTCCAAAGGTTCTTTCTGTCAATGCTGCAAAAGATGCAACTGAGCTTGTAGCAAAGCTTAGGGCATATCATCATACTGCTCAAACAAAGGCTGATAAGCAACACTTTTCAAGCATGGGTCTTGACCTTTCAAAAGGTATCATTCGCAACAACCTTGAATATGGTGTCATTGAGCCAGCAATGAGTAAAGTAAAGATTATTCAGTTTGCCACTGAGGCGGCCATTACTATCCTGAGGATTGATGACATGATCAAACTTACGAAGGAAGAGAGCGGGAACGAAGAGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAITAQTPDILGERQSGQDVRTQNVVACQAVANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITNDGATILRMLEVEHPAAKVLVELAELQDREVGDGTTSVVIIAAELLKRGNDLVRNKIHPTSIISGYRLAMREACKYVEEKLAVKVDKLGKDSLINCAKTSMSSKLINSDSDFFANLVVDAVQAVKTTNAKGEVKYPIKSINILKAHGKSAKDSYLLNGYALNTGRAAQGMPTRVTPARIACLDFNLQKTKMQLGVQVLVTDPRELEKIRQRESDITKERIEKILKAGANVVLTTKGIDDMSLKYFVEAGAIAVRRVRKEDLRHVAKATGATMVSTFADMEGEETFDSSFLGHADEVVEERIGDDDVILVKGTKNTSAVSIILRGANDFMLDEIDRSLHDALCIVKRTLESNMVVAGGGAVEAALSVYLENLATTLGSREQLAIAEFAESLLIIPKVLSVNAAKDATELVAKLRAYHHTAQTKADKQHFSSMGLDLSKGIIRNNLEYGVIEPAMSKVKIIQFATEAAITILRIDDMIKLTKEESGNEE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..73#208..272#668..757#846..932#1031..1090#1200..1250#1331..1426#1709..1774#2207..2424#2652..2748#3164..3250#3451..3585#3680..3784#4276..4404#4484..4587#5156..5246#5331..5414#ATGGCGATCACCGCCCAGACCCCCGACATCCTCGGCGAGCGCCAGTCCGGCCAGGACGTCCGCACGCAAAACGGTAACTCGTCTCTCCCCCTCCTGCAAGCCCTTCCCCGCCGCCAGATTCCGTGGAGTCGCGGCGGGTTTTTGTAAGATCTAGTGGCACGACTCGCCGTCCGGACGCGGGGATTTGATTTCCTTCTCTGATTGCAGTGGTGGCGTGCCAGGCGGTTGCCAACATCGTTAAGTCCTCGCTTGGGCCCGTGGGGCTCGACAAGGTTTGTACCTTGCGATTTGATCTACTTGGTTGCGCATAAATTGTTACTGTGTGTGAAGGATGCGAACTTGTAGGTTTCAAAATTGTGTGATCCGCTACTTAGAATGACGTATTTTCTCCTTTATGAGCTGCTCATTGTGATCCAGATGTAGTTCAGTCGCTTACTGATTCAACAGTGTAATATGTGTGCGGCTAATGTTGTTATGTGCTCGAAATAACTATCAGTATCACTAAACTTTTTATGAAATCATGAAATTACAACAGTATGTGCATCAGTATCACTAAACCTAATCAGGATTAATGAAGTTAGACTTAGATCAGTTCTGCACCACACCAATCCCTGATAATTCCAAAAGGTTGGCTGGAATGAGCTAATTGAGCATATCCTTCTTGTAGATGCTTGTGGATGATATTGGTGATGTTACCATAACAAATGATGGAGCAACCATTTTGAGGATGTTGGAAGTCGAGCATCCAGCAGCAAAGGTGATGTCAGGCAGCTTAAAGGTGCCATCTCCTTTTTCCCCTGGTTGTTGTTTTGTGCTTAGTTGTTTTTTGGTCCTGTTATTGTTAGGTTCTTGTTGAGTTGGCTGAGCTTCAAGACAGAGAGGTGGGAGATGGAACGACATCTGTTGTGATAATAGCCGCAGAATTGCTAAAGGTAATGAAATGGAGCTTTCGTGTCAGTCTTTTCTTCCCTATGTATTTGCCTACCATTCTAAATATGCATTTATGACACTCTTTTTTTCTTTTTACCAGCGGGGCAATGATCTTGTGAGAAACAAAATCCATCCGACATCTATTATCAGTGGCTACAGGGTGAGTTTTGCACTTCATAATTCAGCTGCAGTACAATTTCAGATTTAAAATGAATGTTCCAGCTGCAAACCCACATTGCTTAACATGTTTTACCATCATTTACTACCAGCTTGCTATGCGTGAAGCTTGCAAATATGTTGAAGAAAAGTTGGCTGTCAAGGTAAGAGAATACTATCTGCTTAATGAATAGCAGCAGATTACTTCTTGACACCTGACACTAGTATCTATCAACATTTTCAGGTTGATAAACTTGGAAAGGATTCTCTTATAAACTGTGCGAAGACAAGCATGTCCTCGAAGCTGATTAATAGTGACAGTGATTTCTTCGCAAATCTGGTAAGTTCCTATTGCCATATATATACATTTGTATTTTCAGCTGTAAGTTTGATTTTAGTGATACTTGTTAAATTTAAATAAATATTTAGTTGATACTCTATATCTGTATATATAGGCAGTCCAATTTATTTCTTTCCAATGTCGTAGCATGCTATAATGCTTCACTGTTAAGTCTCTATCTGACAGTTAGGCATCTCCGTAGCCAAATGCTAGTGCTTTAATTCACTCTGTAAGCTTTCCTTCAAACTGTGCTGTATAATTAACATGGCTGTTGTTTAATAGGTTGTCGATGCAGTCCAAGCTGTGAAGACCACAAACGCTAAGGGAGAAGTGAAGTATCCTATCAAGGTGAGTTACATGCTTGTGATTCTTGTTATACATCAAAGCAAAACTTTGTTGTGTGCAATTGCAATACACTGAATGAGATATATTGAATTGTGCACTTGTGCTTCACTGATTGTTCTCTTTCTGTAGCCTCTATTATTGTTTGGAAATTGTAGGGTATTACACTTGTTTGTGAGCTTTGCTATATGTGACCTTTGTTCTTTTCTCCTGGTTATGTATAACATATTGGACACCTTGAGAGCTAATAAAGTTTAACTTCTACCTTAATTATATGCTGTTATGTCATTGACTTTCTTGTTAACCAATAACCATTCATGTATGGACATGGCATTCAAGTTATTTCTCTAAAAGTACTTCGCAATAACCATTTTTTGATTTTTATATTAACAAAATCGACAGAAATTTGCTGGTAACTATAGCTCATCTGATCTGCAGAGCATTAATATTTTGAAAGCCCATGGTAAAAGTGCCAAGGACAGTTACCTGCTGAATGGGTATGCACTAAACACAGGCCGTGCAGCTCAAGGAATGCCTACTAGAGTAACCCCGGCAAGAATTGCATGTCTTGATTTTAACCTTCAGAAGACAAAAATGCAATTGGGTGTTCAAGTCCTTGTAACTGATCCAAGGGAACTTGAGAAAATTCGTCAGAGGTATGTGCATTTACTTTTTCCAACGCATTCTGATTCATTTGTTTTGTATACTTAATGAGTCAACAATTGGGGTGTTCTCTTTTATCTGATTTGCACATTTTATTTTTTTATATTTTTATTGTGTTTTTTTATTTCTATTGTTTTGTGGAATGTGGTTGGATCCGCACATAATTCTATTATAATTTATGGTCTCCAATTGTAAACCATAATCTTACTTTTCATGGCAGAGAATCTGACATAACAAAGGAGCGAATTGAGAAAATTCTGAAGGCTGGTGCTAATGTTGTACTGACCACTAAGGGAATTGATGATATGTCACTGAAGGTATGTTTTATTCAAGTAGAAACATTCTTTTATTACCTAAATATAATCTATTGACTTCGGTTGGACTGGTAAGAGCTCTGTTATTGATTGAATACTAGTACATGGACGGTATTGTGTTGATGTTGATTGAGCGTGGGTGTTTGTGGGGTATTCATTATCAATTTCCTCAGGAAACTTCTTTCATCATTGAATCTTTTTGGTCGTCCAAACTGAGCTTCTGTTTCATAATTTTAGTTAGACTTCTTTTTACTCTGAAGAGAGCTGTTTCATTATTGAATTGGTTTTGATTATTTTGAAAGAGCTACTTGGTTCATGTGGTGTTTGTGTGTTAATCTTTGTATATGTATGATGTTGATGATTCCTGGCTACTGTCTTTAAATCTGCTTTATGACTGTTCAATGGAATATCATTTCAGTACTTCGTTGAGGCTGGTGCAATTGCTGTAAGGCGTGTGCGTAAGGAGGATTTGCGCCATGTTGCCAAGGCTACTGGTGCAACTATGGTATGCCTCACCTTTTGTTTATCGAGTTGTAACAACATTGGAATACATAATTGTGCAGATGACTAATAGAATTAATAAATGATGAAGCAACTTCCCTTGCGATACCACTGTAATTTTAGTCTTAAGTTTGTTGCTTCTAGTCCTAATATTAATGCTACACAAACTGTTTGGTGCTGTCCTAATTTGGTAGTAAATTGCAGGTATCTACATTTGCTGATATGGAAGGTGAAGAGACATTCGATTCATCGTTCCTTGGACATGCTGATGAAGTTGTTGAGGAAAGAATTGGTGATGATGATGTAATTTTGGTGAAAGGAACAAAGAACACCAGCGCTGTATGTACTTTTCAATTCCAATGCAAATCTTATATTTTGTATAACAAAACCAGCAAGAGTTTAGGGGAATCACGCCTGCATTTCTTTTATGCAGGTCTCAATTATACTTAGAGGCGCAAATGACTTCATGCTAGATGAGATTGACAGATCATTGCATGATGCATTGTGCATTGTGAAGAGAACGCTGGAATCCAATATGGTATAACCTTTTGCTTCTGTTCCTTAACATGTTGGTTCCCTGCAGTTGAATATATAAAGTTCACTGTTATATTAAGATTTTTGGGAGAGTAAGAAAAAAATGTCTTTTTTTTTCATTTGAGCACTACTGTTGTCCTGTTACCACGTGAGACCTTTGATTAGACACTAACATGTTGATTAGTTGTATTTAGTGCCCCATCATTATTCTTTTGTCAATTGCTTATGCTGTACAATGCCAAATGACCATGTTTGCCATTACATTTCTTCAGAGGATAGCTTCCATGCTTTTGCAAACCAAATCAACCAAAGCAGTTAAAATTTTCACAACTGAGCCACTTGGTGCAATTCTATCTGTTTTGTCACTTGTTTCAGTCATTTATGCCTGCATTCCATCCACAGAACAATGTTGGCAGTGTATACTTCATATTAGCCGTGAATGTAGTTCTGGCATTGTAACTTTGGTGGCGCTTTAAACATGTATGTATCATGCAGGTTGTTGCTGGTGGTGGTGCAGTTGAAGCTGCATTGTCTGTATACTTGGAGAATCTTGCTACAACCCTTGGGTCCAGGGAACAGTTGGCCATTGCTGAATTCGCGGAATCTTTGTTAATCATTCCAAAGGTTTGATCACTTGTGTTCTATGTGTTTACATACTGGATGACATAAAATATTAATGTGAAGTGTGACCTTGTGATGTCAGGTTCTTTCTGTCAATGCTGCAAAAGATGCAACTGAGCTTGTAGCAAAGCTTAGGGCATATCATCATACTGCTCAAACAAAGGCTGATAAGCAACACTTTTCAAGGTAATTACAGAACATGTCTTCGTTGTTATCTGAATAAGATGTGGTTCTTTTATCTTGTACATATAGTATGTTCTAGATCTTTGAAAAGCTCTCCAAATTCTTTTTTGATGAACTTTTGGGACAATTCTAGAGATATTATGTTATAGAGTAAATTTCACAAAGCTACAAATACTTGAGCAAATTATCGCAAAACTACAGATTTAGGTGATGTATCACAAAACTA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