BGIOSGA016952

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA016952

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016952, complete gene.

LocusTag

OsI_17044

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA016952-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA016952-PA

Length

17340

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:27642225..27659564

Sequence Coding Region

27642225..27642308,27642388..27642513,27642569..27642718,27643249..27643293,27643364..27643627
,27644594..27644638,27645145..27645180,27646798..27648675,27648774..27648943
,27649034..27649100,27649191..27649309,27650101..27650162,27651426..27651554
,27652145..27652371,27652507..27652584,27652775..27652912,27653356..27653615
,27653724..27653835,27654318..27654403,27657008..27657272,27657566..27657604
,27657675..27657777,27658408..27658475,27659229..27659326,27659417..27659564

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:27642225..27659564 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:27642225..27659564 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGGAGCCAAGTCTTGAGGTGAATAATCCTGTGGCTGAGCTGAATGCCATCAAATTCAGCCTCATGACCAGTTCAGATATGGAAAAGTTAAGTAGTGCGACTATTATTGAAATGTGTGATGTGACTAACGCCAAGTTGGGATTACCAAATGGTGCACCACAGTGTGCAACCTGTGGATCGCGAAGCATACGTGACTGTGATGGTAAAAAGAAACTAACTGGTAAACTGTTAGGTCATTTTGGTGTTATTAAGCTAGCAGCAACCGTGCACAATTCATATTTTATCGAGGAAGTTGTCCAGTTGCTAAATCAGATATGTCCTGGCTGTCTCACTCTGAAGCAAAATGGGGACACAAAGAAGGCTGATGGGACAACAATTCAAGGAACTTGCAAGTATTGCTCAAAGGATGGATCAAAACTTTACCCTAGTATAATCTTTAAGATGCTAACAAGTCCAAGAGTAACACTATCCAGGAGTAAACTTCACCGTAACACTAGCGTGATGGACAAAATGTCAATTATTGCAGAAGTTGCTGGCGGGGTGGCACATAAGTCCAAGAACAAGGCTCCCCATGAAACCCTTCCCCAAGATTTCTGGGATTTCATACCTGATGATAACCAGCCACCTATATTCAATGTGACTAAGAAAATATTGTCGCCATATCAAGTCTTTCACATGCTAAAAAAGCTTGATCCTGAACTTATCAATCAGGATGACCGGACAAAAGCTTATAAGAGGATGGTTGATTTATACTCAAAAAAATCAGATGATGAATCTTCTGCATCTACAGATACATATGGAATCAAATGGTTAAAAGATATCATCCTCAGCAAAAGATCCGACAATGCATTTAGGAGTATAATGGTCGGGGACCCAAAAATTAATTTAAATGAAATCGGTATTCCTATGGGTTTAGCTTTGAACTTGGTTGTTTCTGAGCAAGTTAGTTCTTACAATTTCGAAACCATAAATTTGAAGTGCAACTTGCACCTTCTTACCAAGGAAGTACTGCTTGTCCGCCGAAATGGGAATCTTATTTTTGTTCGGAAGGCAAACCAGTTAGAAATTGGTGATATTGCTTATAGACTATTGCAGGATGGTGATCTTGTTTTGGTAAATAGGCCACCTTCAGTTCATCAACATTCTCTGATTGCCCTATCTGCAAAACTTCTGTCAACTCAGTCAGCTGTGTCAATTAATCCACTATGTTGTGATCCTTTCAAGGGAGACTTTGATGGGGACTGTTTGCATGGATATATTCCTCAATGTCTGCAATCAAGAATTGAGCTTGAAGAACTAGTTAGTTTAAGTGGCCAACTCTTGAATCAACAAGATGGGCGAAGTTTGGTGTCATTAACACATGACTCTCTAGCTGCTGCACATCAGTTAACAAATGCAGATGTTTTCTTGGAGAAAGCTGAATTTCAACAGCTTCAGATGTTATCCTCTTCCATCTCATTGACACCAATGCCATCAGTTTTTAAATCTACAAACTCTCAAGGTCCTCTTTGGACTGGTAAGCAACTGTTTGGAATGCTGCTACCTTATGGTATGAATATCAGTTTTGATCAGAAGTTACACATAAAAGACAGTGAAGTGCTTACCTGCTCATCAGGATCTTTTTGGTTACAGAATAACACATCCAGCCTTTTCTCTGTCATGTTCAAAGAGTATGGTTGTAAGGCTCTTGAGTTCCTTTCTTCCACCCAGGATGTACTATGTGAATTCTTAACCATGTGGGGTTTAAGTGTCTCCCTTTCAGATCTCTATCTGTTCTCAGACCATTACTCAAGGAGAAAACTGAGTGAGGAAGTTCATCTGGCATTGGATGAAGCGGAAGAGGCTTTTCAAATCAAGCAAATATTGCTAAATTCAGTATCTATACCAAATCTGAAGTATTATGATGGAGGTGATGATAGATCAAACACTGATGAACAATCTGGTTTTACTCAAGTCAGTCTGCCAATCATCAGATCTTCAATGACATCATTTAAGAGTGTCTTCAATGATCTGTTGAAGATGGTGCAGCAGTATGTGAGTAAAGATAATTCAATGATGACAATGATTAACTCTGGAAGTAAAGGTAGTGTTCTGAAGTTTGTTCAACAGACTGCATGTGTTGGTCTTCAACTACCAGCAAGTAAATTTCCCTTTAGAATTCCCTCACAACTATCATGTGTTTCCTGGAATAGACATAAATCTCTCAATTGTGAAATCACTGACGGCACCAGTGAATGTGTGGGAGGCCAAGACATGTATGCTGTTATTAGAAATTCTTTTCTTGATGGACTAAATCCGTTAGAATGTCTACTGCATGCCATATCTGGCAGGGCAAATTTCTTTAGCGAAAATGCTGACGTTCCTGGGACTTTGACAAGGAAACTAATGTATCACTTGAGAGATACATACGTTGCTTATGATGGGACTGTTAGAAGTTCTTATGGGCAGCAAATAGTGCGGTTTTCTTATGATACTGCTGATGGCATGTACAGTGATCATGATCTTGAAGGTGAACCTGGGGCCCCTGTTGGCTCTTGGGCTGCTTGTTCCATTTCAGAAGCTGCCTATGGAGCTTTGGATCACCCAGTTAACAGTTTAGAGGATTCCCCTCTTATGAACTTGCAGGAAGTTTTGAAGTGCCACAAGGGCACAAATTCTCTGGATCATACTGGTTTGCTTTTCCTGTCAAAGCATCTAAGGAAATATAGATATGGTTTTGAGTATGCATCACTAGAAGTTAAGGATCATCTAGAACGAGTGGACTTTTCTGATATGGTTGACACGGTCATTATTTTATATGGCGGCTCAGATATGCAGAAAACAAAAGGAAATCCTTGGATCACTCATTTTCATTTAAGCCAGGAAACAATGAAGATAAAAAGGTTAGGACTGGAATTTATTGTAAGAGAGATTATTGACCAATACAACACCTTAAGAAAACAGTTGAACAATGCGATCCCTTCAGTTTCTATTTCGAACAGTGAAACTCTTCACTTGAAGATGGAAAATAAATCTGGGAAGCTAGGGAAAAACCTGGGCACGGGCAATGAGTGTGTCAAGAATCAGACCTGTTGCGTCTCTATGGTAGTACAGGTGGAAATTAACTCCATGTCGCAATTGGACGTTATCAAGGAACGGGTGATTCCAAGCATCCTGGCCACACTGTTGAAAGGATTTTTGGAATTTAAGAATGTTAAGGTGCAATGTCAAGAGGATAATGAACTTGTTCTGAAAGTCGGTATGTCTGAGCATTGCAAGAGTGGGAAGTTCTGGGCTACCCTACAAAATGCTTGCATCCCAATAATGGAGTTGATTGATTGGGAGCGGAGCCGACCAGAGAGAGTATATGATAATTTCTGCTCATATGGCATAGACTCAGCATGGAAATTCTTTGTCGAATCTTTAAGATCCACAACAGATGCTATTGGAAGGAATATCCATCGACAGCACTTACTGGTTGTGGCAGACTGCCTATCTAGGCCTGCACACAGTTTTATAAATGCTGCAAAGCGAGATTCAGTGGACAATCTTTCTGGTACTCTAGATGCAATTGCCTGGGGCAAAGAACCTTGTACAGGGTCGTCAGGTCCTTTCAAGATTCTATATTCTGGGAAGTCACATGAGACAAAACAAAATGAGCACATATATGACTTTCTACATAACCCTGAAGTTCAGGCTCTTGAAAAGAATGTAATGGATACCTACAGAAAAAGGACTGAAAAAACTTCCAAGCGGAGATCAGCACTCAATTCTGAAGGCAATGCTACCATCAATGGTGGTGCCATATCTTTTAATCAGAAGTTTCTTAATTCTAAAGTTGGTATATGGGAGAACATCATTGACATGCGCACTTCCTTGCAAAACATGCTTCGGGAGTACACATTAAATGAAGTTGTCACAGAACAAGATAAATCATGCTTAATAGAGGCCTTGAAATTTCATCCCAGAGGGTATGACAAGATTGGTGTGGGAATAAGAGAAATCAAGATCGGAGTGAATCCTGGTCACCCGAGCTCAAGGTGCTTCATTGTACTAAGGAATGATGATACTACTGCAGACTTCTCTTACAACAACCGGTTCCCCTGCCGCTACCTCCACAGCGAACTCCCCGAGGCGCCTCCCGAGCGACTGCGACCAAGCCATAGACCCAGCGCGGCCGCTTGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAACTGCGTGGTGTCCAGTACCCGCGAGAAGCCCTGCAAGTTCTTCCTCTCCGGTGATTGCAGGTACGGCGACGAATGCCGCTGCTACCTCCACGCCGGCTCCATCAACGACGGGTTCTCGCTGCTCACCCCGCTCCGCGGACACCAGAAGGAGCCATTGCTATTTGTTGGAATTCCTGATGCTGTGAAGATCTGGGATACAGGAGCTGAGATGAGCCTAAGTGAGCCAACTGGCGAGTACATGCACTGGCGGTTGGCAATGGGATGCTCTTCGCTGCAATGCAACTATACAAGTCTGGGCTGCTATGGAAAGTTGGAAACTGGAAGCCTGGCAGTAACATATACACATAACGAAGATCATGGTGCACTTGCTCTTGCTGGTATGCAAGATGCACAATTAAACCCTATTCTGCTATGGTCAACGAATTACAACATAGTCCACCTCTATGAGCTCCCATCGTTTGCTGAGAGAGGTAAAATATCCTTTGAAGCGGAAGTTGGAGCAGTGAAAAATGGTCCTGGTGGATTAATATTTACTAGCGATGAAATTGGCAAACTAAAGTTGTGGAAATGGACAGCTGAACGAACTTCTGGAGTCTCAAACTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEEPSLEVNNPVAELNAIKFSLMTSSDMEKLSSATIIEMCDVTNAKLGLPNGAPQCATCGSRSIRDCDGKKKLTGKLLGHFGVIKLAATVHNSYFIEEVVQLLNQICPGCLTLKQNGDTKKADGTTIQGTCKYCSKDGSKLYPSIIFKMLTSPRVTLSRSKLHRNTSVMDKMSIIAEVAGGVAHKSKNKAPHETLPQDFWDFIPDDNQPPIFNVTKKILSPYQVFHMLKKLDPELINQDDRTKAYKRMVDLYSKKSDDESSASTDTYGIKWLKDIILSKRSDNAFRSIMVGDPKINLNEIGIPMGLALNLVVSEQVSSYNFETINLKCNLHLLTKEVLLVRRNGNLIFVRKANQLEIGDIAYRLLQDGDLVLVNRPPSVHQHSLIALSAKLLSTQSAVSINPLCCDPFKGDFDGDCLHGYIPQCLQSRIELEELVSLSGQLLNQQDGRSLVSLTHDSLAAAHQLTNADVFLEKAEFQQLQMLSSSISLTPMPSVFKSTNSQGPLWTGKQLFGMLLPYGMNISFDQKLHIKDSEVLTCSSGSFWLQNNTSSLFSVMFKEYGCKALEFLSSTQDVLCEFLTMWGLSVSLSDLYLFSDHYSRRKLSEEVHLALDEAEEAFQIKQILLNSVSIPNLKYYDGGDDRSNTDEQSGFTQVSLPIIRSSMTSFKSVFNDLLKMVQQYVSKDNSMMTMINSGSKGSVLKFVQQTACVGLQLPASKFPFRIPSQLSCVSWNRHKSLNCEITDGTSECVGGQDMYAVIRNSFLDGLNPLECLLHAISGRANFFSENADVPGTLTRKLMYHLRDTYVAYDGTVRSSYGQQIVRFSYDTADGMYSDHDLEGEPGAPVGSWAACSISEAAYGALDHPVNSLEDSPLMNLQEVLKCHKGTNSLDHTGLLFLSKHLRKYRYGFEYASLEVKDHLERVDFSDMVDTVIILYGGSDMQKTKGNPWITHFHLSQETMKIKRLGLEFIVREIIDQYNTLRKQLNNAIPSVSISNSETLHLKMENKSGKLGKNLGTGNECVKNQTCCVSMVVQVEINSMSQLDVIKERVIPSILATLLKGFLEFKNVKVQCQEDNELVLKVGMSEHCKSGKFWATLQNACIPIMELIDWERSRPERVYDNFCSYGIDSAWKFFVESLRSTTDAIGRNIHRQHLLVVADCLSRPAHSFINAAKRDSVDNLSGTLDAIAWGKEPCTGSSGPFKILYSGKSHETKQNEHIYDFLHNPEVQALEKNVMDTYRKRTEKTSKRRSALNSEGNATINGGAISFNQKFLNSKVGIWENIIDMRTSLQNMLREYTLNEVVTEQDKSCLIEALKFHPRGYDKIGVGIREIKIGVNPGHPSSRCFIVLRNDDTTADFSYNNRFPCRYLHSELPEAPPERLRPSHRPSAAACGGGGGGGGNCVVSSTREKPCKFFLSGDCRYGDECRCYLHAGSINDGFSLLTPLRGHQKEPLLFVGIPDAVKIWDTGAEMSLSEPTGEYMHWRLAMGCSSLQCNYTSLGCYGKLETGSLAVTYTHNEDHGALALAGMQDAQLNPILLWSTNYNIVHLYELPSFAERGKISFEAEVGAVKNGPGGLIFTSDEIGKLKLWKWTAERTSGVSN</aaseq>

Gene Sequence

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