BGIOSGA017097
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA017097 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017097, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_17356 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA017097-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA017097-PA |
| Length |
6907 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:29909338..29916244 |
| Sequence Coding Region |
29909338..29909452,29909637..29909695,29909808..29910093,29910203..29910383,29910691..29910886 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:29909338..29916244 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:29909338..29916244 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGATGATGCTGCTGCTGCCGAGTTCCTCCTCCTCCTGCTGCTGTCGCTGCCCCGGCGGGCAGTTCCACGGAGCTCCACCCCGCGTGATGGCGCCTCGTCGTGGGGTCACCAGAGTATATATCGAGAAGAGATTGGGAGTAGGAGGGGGAAATGCATCAAGCCTGCAAGACATGCACAGGAAGGAGCTCCAGGCAAGGACAAGGGACCAGCTCCAGACATTGGAGTTATCTACGTCTTTGTACGACACGGCGTGGGTGGCCATGGTGCCACTGCTGGGTTCCCGTCAGCATCCGTGTTTCCCACAATGCGTGGAGTGGATATTACAAAACCAGCAGGATGATGGATCTTGGGGTACAAGAGGATTCGGCGTGGCGGTCACAAGAGATGTTCTGTCGTCTACGTTGGCGTGTGTTCTTGCACTCAAGAGATGGAATGTTGGGCAGGAGCACATCAGGAGAGGACTAGATTTTATTGGAAGGAATTTCTCCATTGCCATGGATGAGCAGATTGCTGCTCCTGTTGGTTTCAACATCACTTTTCCTGGTATGCTTAGCCTTGCCATGGGGATGGATTTAGAATTCCCTGTCAGACAGACAGATGTTGATAGACTTCTTCACCTCCGGGAGATAGAACTCGAAAGAGAGGCTGGAGACCATTCTTATGGAAGAAAGGCATATATGGCTTATGTCACAGAAGGATTAGGAAACCTGTTGGAGTGGGATGAGATTATGATGTTCCAGAGGAAGAATGGATCATTTTTCAACTGTCCTTCCACAACTGCTGCCACATTAGTCAACCACTATAACGATAAAGCCCTCCAGTACTTAAATTGTCTGCTAGTTTGCAGTTCATGGTTAGAAAGAGATGAGGAAATTATGCTGGACATAACAACATGTGCAATGGCTTTTCGCCTGTTAAGGATGAATGGGTATCATGTTTCCTCAGTCGAGTTATCTCCTGTTGCTGAAGCTTCCAGTTTCCGTGAATCACTTCAAGGATATTTAAATGATAAGAAATCTCTACTCGAATTATACAAGGCTTCAAAAATGAAGTATGCTCTTAAGTTTCCCTTCTACACCACACTGGACCGTCTAGATCACAAGAGGAACATTGAACGTTTTGATGCAAAGGATTCCCAGATGTTAAAGACGGAATACTTGCTTCCTCATGCCAATCAAGATATTCTAGCTTTGGCTGTTGAAGATTTCAGTAGTTCTCAATCTATATACCAGGATGAACTTAATTATCTTGAGTGTTGGGTGAAAGAGAACAGACTTCATGAGCTGAAGTTTGCACGGCAGAAATCTGCTTATTTCTATCTCTCTGCTGCTGGAACGGTTTTTGATCCAGAAATGTCTGATGCTCGCATTTGGTGGGATGAGCATCACAAAGAGGAGCTCTACTCTGAACAAGTAGAGATTGTATTTTTTGCCATATTCAATTCAGTTAATCAGCTTGGAGCAAAGGTTTCTGCTGTACAAGGCCGTGATGTGACCAAACACCTAATAGAAATAGATGATGGATCTTGGGGTACAAGAGGATTCGGCGTGGCGGTCACAAGAGATGTTCTGTCGTCTACGTTGGCGTGTGTTCTTGCACTCAAGAGATGGAATGTTGGGCAGGAGCACATCAGGAGAGGACTAGATTTTATTGGAAGGAATTTCTCCATTGCCATGGATGAGCAGATTGCTGCTCCTGTTGGTTTCAACATCACTTTTCCTGGTATGCTTAGCCTTGCCATGGGGATGGATTTAGAATTCCCTGTCAGACAGACAGATGTTGATAGACTTCTTCACCTCCGGGAGATAGAACTCGAAAGAGAGGCTGGAGACCATTCTTATGGAAGAAAGGCATATATGGCTTATGTCACAGAAGGATTAGGAAACCTGTTGGAGTGGGATGAGATTATGATGTTCCAGAGGAAGAATGGATCATTTTTCAACTGTCCTTCCACAACTGCTGCCACATTAGTCAACCACTATAACGATAAAGCCCTCCAGTACTTAAATTGTCTGCTAGTTTGCAGTTCATGGTTAGAAAGAGATGAGGAAATTATGCTGGACATAACAACATGTGCAATGGCTTTTCGCCTGTTAAGGATGAATGGGTATCATGTTTCCTCAGTCGAGCTATCTCCTGTTGCTGAAGCTTCCAGTTTCCACAATTCACTTCAAGGATATCTGAATGATACAAGATCTCTACTCGAATTATACAAGGCTTCAAAAGTCAGTATCGCAGAAAAGGAGATGAAGTATGCTCTTAAGTTTCCCTTCTACACCACACTGGACCGTCTAGATCACAAGAGGAACATTGAACGTTTTGATGCAAAGGATTCCCAGATGTTAAAGACGGAATACTTGCTTCCTCATGCCAATCAAGATATTCTAGCTTTGGCTGTTGAAGATTTCAGTAGTTCTCAATCTATATACCAGGATGAACTTAATTATCTTGAGTGTTGGGTGAAAGATGAAAAGCTCGATCAGCTGCCATTTGCACGCCAGAAGTTGACATATTGCTACCTTTCTGCTGCTGCTACCATATTCCCCCGCGAATTGTCTGAAGCCCGCATTGCATGGGCTAAAAATGGTGTACTGACAACTGTTGTTGATGACTTCTTTGATCTTGGGGGATCAAAAGAAGAACTAGAAAACCTCATTGCTTTAGTTGAGAAGTGGGATGGACATCAAGAGGAGTTCTACTCAGAACAAGTAAGAATAGTTTTTTCTGCTATTTATACTACAGTGAACCAGCTTGGAGCAAAGGCTTCTGCATTACAAGGCCGTGATGTTACAAAACACCTAACAGAAATATGGTTATGTCTGATGAGGTCTATGATGATCGAAGCTGAATGGCAGAGGACAAAATATGTGCCGACAATGGAAGAATATATGGCAAATGCTGTTGTCTCATTTGCACTGGGACCTATTGTGCTCCCGACTCTGTATTTCGTAGGACCGAAGCTCCAAGAGGATGTCGTCAGGGATCATGAGTACAATGAATTATTTAGACTGATGAGCACTTGTGGGCGTCTCCTGAATGACAGCCAAGGCTTTGAGAGGGAGAGCCTGGAGGGAAAGCTGAACAGTGTCTCACTGCTTGTTCATCACAGTGGTGGTTCTATCTCCATAGACGAGGCTAAAATGAAAGCCCAGAAATCCATAGACACTTCCAGGAGGAACTTGTTAAGATTGGTCCTTGGAGAACAGGGTGCTGTTCCTAGGCCATGCAAGCAGCTGTTCTGGAAGATGTGCAAGATTGTTCACATGTTCTACTCTCGGACTGATGGGTTTAGCTCGCCGAAGGAAATGGTTAGTGCAGTGAATGCAGTCGTCAAGGAGCCACTTAAACTCAAAGTGAGTGATCCATATGGCTCTATTTTGTCGGGCAATTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MMMLLLPSSSSSCCCRCPGGQFHGAPPRVMAPRRGVTRVYIEKRLGVGGGNASSLQDMHRKELQARTRDQLQTLELSTSLYDTAWVAMVPLLGSRQHPCFPQCVEWILQNQQDDGSWGTRGFGVAVTRDVLSSTLACVLALKRWNVGQEHIRRGLDFIGRNFSIAMDEQIAAPVGFNITFPGMLSLAMGMDLEFPVRQTDVDRLLHLREIELEREAGDHSYGRKAYMAYVTEGLGNLLEWDEIMMFQRKNGSFFNCPSTTAATLVNHYNDKALQYLNCLLVCSSWLERDEEIMLDITTCAMAFRLLRMNGYHVSSVELSPVAEASSFRESLQGYLNDKKSLLELYKASKMKYALKFPFYTTLDRLDHKRNIERFDAKDSQMLKTEYLLPHANQDILALAVEDFSSSQSIYQDELNYLECWVKENRLHELKFARQKSAYFYLSAAGTVFDPEMSDARIWWDEHHKEELYSEQVEIVFFAIFNSVNQLGAKVSAVQGRDVTKHLIEIDDGSWGTRGFGVAVTRDVLSSTLACVLALKRWNVGQEHIRRGLDFIGRNFSIAMDEQIAAPVGFNITFPGMLSLAMGMDLEFPVRQTDVDRLLHLREIELEREAGDHSYGRKAYMAYVTEGLGNLLEWDEIMMFQRKNGSFFNCPSTTAATLVNHYNDKALQYLNCLLVCSSWLERDEEIMLDITTCAMAFRLLRMNGYHVSSVELSPVAEASSFHNSLQGYLNDTRSLLELYKASKVSIAEKEMKYALKFPFYTTLDRLDHKRNIERFDAKDSQMLKTEYLLPHANQDILALAVEDFSSSQSIYQDELNYLECWVKDEKLDQLPFARQKLTYCYLSAAATIFPRELSEARIAWAKNGVLTTVVDDFFDLGGSKEELENLIALVEKWDGHQEEFYSEQVRIVFSAIYTTVNQLGAKASALQGRDVTKHLTEIWLCLMRSMMIEAEWQRTKYVPTMEEYMANAVVSFALGPIVLPTLYFVGPKLQEDVVRDHEYNELFRLMSTCGRLLNDSQGFERESLEGKLNSVSLLVHHSGGSISIDEAKMKAQKSIDTSRRNLLRLVLGEQGAVPRPCKQLFWKMCKIVHMFYSRTDGFSSPKEMVSAVNAVVKEPLKLKVSDPYGSILSGN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..115#300..358#471..756#866..1046#1354..1549#1835..1943#2066..2166#2360..2472#2552..2647#2753..2869#3066..3207#3395..3518#3628..3808#4116..4311#4597..4705#4828..4949#5122..5234#5314..5409#5498..5713#5824..5962#6054..6299#6572..6907#ATGATGATGCTGCTGCTGCCGAGTTCCTCCTCCTCCTGCTGCTGTCGCTGCCCCGGCGGGCAGTTCCACGGAGCTCCACCCCGCGTGATGGCGCCTCGTCGTGGGGTCACCAGAGGTACAGTATGCTCGATTACTCGCGTGTTCTTGGTGCCTCGTGTCTTTTTTTGTTATCAAAGGGATATCTGAAATTGCAGCCATGGTCGACACTGTTCAATTCTACAGAGAAATGTGTTTACTGTTTATTGTATTTTTATATCTTATCGATCTCTCTCACTGACATTCTTTTCTTTACCAATCAGTATATATCGAGAAGAGATTGGGAGTAGGAGGGGGAAATGCATCAAGCCTGCAAGACATGGTAGTAATAATATGAACCAATGTGACAGTGTGCTGATTATTATTATTATTATTATATCTGAAACCTGATGCTCTGTGTCCCTGATTGAGTTAATTATTGTGATGAAATGCAGCACAGGAAGGAGCTCCAGGCAAGGACAAGGGACCAGCTCCAGACATTGGAGTTATCTACGTCTTTGTACGACACGGCGTGGGTGGCCATGGTGCCACTGCTGGGTTCCCGTCAGCATCCGTGTTTCCCACAATGCGTGGAGTGGATATTACAAAACCAGCAGGATGATGGATCTTGGGGTACAAGAGGATTCGGCGTGGCGGTCACAAGAGATGTTCTGTCGTCTACGTTGGCGTGTGTTCTTGCACTCAAGAGATGGAATGTTGGGCAGGAGCACATCAGGAGAGGTACAAACGACTGTGCATTTACCTGTCGATGTTTGTTTTAATTGACTCTGTATGTATCTACACATTTAAGGCTTGGAATGTCTTAACGCTATGAAAATGGTACTGTCAGGACTAGATTTTATTGGAAGGAATTTCTCCATTGCCATGGATGAGCAGATTGCTGCTCCTGTTGGTTTCAACATCACTTTTCCTGGTATGCTTAGCCTTGCCATGGGGATGGATTTAGAATTCCCTGTCAGACAGACAGATGTTGATAGACTTCTTCACCTCCGGGAGATAGAACTCGAAAGGTCTGTTAGTTCTAACACGAACATGGATATTGTATGTCATTAGTATTTGTATTACTGTTGTTACGAGTATGTAAAGTTAGTATGCAAGGGTTGATTGTGTGGATGAAGTTTTACCATCAGGCGTTCTAAAAATAACTGTCAGCTTAGTTTTATTCCCTAGTTCCCCCTGCATTCTTTTTGAAGGAAGGAATATAATGACCTTCTCCTCTCTTTTTTTCCAAGATCCTATATTTGGAGGAAATGATCAATCTCGGTTTTAATAGTGCCTATGAGTAACGCACTGAAAATCTGATATGATTAAATGCAGAGAGGCTGGAGACCATTCTTATGGAAGAAAGGCATATATGGCTTATGTCACAGAAGGATTAGGAAACCTGTTGGAGTGGGATGAGATTATGATGTTCCAGAGGAAGAATGGATCATTTTTCAACTGTCCTTCCACAACTGCTGCCACATTAGTCAACCACTATAACGATAAAGCCCTCCAGTACTTAAATTGTCTGGTTAGTAAATTTGGCAGTGCAGGTGAGTCTGCACGCATTTTCCTGTCAAGAACTTTCTACAGTGTAGACTGCTCCTAAATACATAGTAATACATTTGGTCCATTGCAGTACCAACAGTGTATCCACTAAACATATATTGTCAGCTTTCATGGGTGGATGCACTTGAAAAGATGGGAATTTCTCAGTATTTTGTCAGTGAGATAAAGAGCATCCTAGACACAACATACGTGTAATGACTTTGAGTAAGTATTTTATCTATCTTTAATAGTTCAAACTTAATTTTAGCTAGTTTGCAGTTCATGGTTAGAAAGAGATGAGGAAATTATGCTGGACATAACAACATGTGCAATGGCTTTTCGCCTGTTAAGGATGAATGGGTATCATGTTTCCTCAGGTGTGTTCTAAGGCTTGAAAGGAATATTTTTTTTGTTGGTTTCGAACTATATTCTACCTTTGGTTTTCATTTAACATGCTGAATTATTTTTTATTTAACATGCTAATTTAAATGCGGTGCAGTCGAGTTATCTCCTGTTGCTGAAGCTTCCAGTTTCCGTGAATCACTTCAAGGATATTTAAATGATAAGAAATCTCTACTCGAATTATACAAGGCTTCAAAAGTCAGTATATCAGAAAATGAATCAATCTTAGATAGCATAGGCTCTTGGTCAGGTAGCTTATTGAAGGAAAGTGTGTGCTCTAATGGGGTGAAAAAAGCTCCAATCTTTGAAGAGGTGCTTGCATGAAGTTTTGAATTTCCATTTCATTCGGAAGTTCACTTTGTGTTTAAGTATATGCCTTTTGTGATTTCAGATGAAGTATGCTCTTAAGTTTCCCTTCTACACCACACTGGACCGTCTAGATCACAAGAGGAACATTGAACGTTTTGATGCAAAGGATTCCCAGATGTTAAAGACGGAATACTTGTAAGGTTTTCATTGAAAAGGTCTGCCAATCTGAGTAATATATATGTTAGGCACCAATTCCACTATGTTGCTTACTCAGGCTTCCTCATGCCAATCAAGATATTCTAGCTTTGGCTGTTGAAGATTTCAGTAGTTCTCAATCTATATACCAGGATGAACTTAATTATCTTGAGTGGTAGGTAATCCAGCCTGCTGTTATGCTCCTTTATTGTACTACCTTGGATTGTACAAACAGTAACATTCAGCTTATTTCTGCAAATTTCAAATTTTGATGCAACAGTTGGGTGAAAGAGAACAGACTTCATGAGCTGAAGTTTGCACGGCAGAAATCTGCTTATTTCTATCTCTCTGCTGCTGGAACGGTTTTTGATCCAGAAATGTCTGATGCTCGCATTTGGTGGGCTATAAACGGGGTGCTTACAACTGTCGTCGACGATTTCTTTGACGTTGGAGGATCAAGAGAAGAATTGGAAAACCTCATTTCACTAGTAGAGATGTACAATCCTTTACATCCATGATTTTAGCTTACTTTTTAAATACCATTTTCTTAGGCTTAATTCAATTTTTGCCCATTTTGCCAATGGTTGTCACAGGTGGGATGAGCATCACAAAGAGGAGCTCTACTCTGAACAAGTAGAGATTGTATTTTTTGCCATATTCAATTCAGTTAATCAGCTTGGAGCAAAGGTTTCTGCTGTACAAGGCCGTGATGTGACCAAACACCTAATAGAAATAGTAAGTTTTTGTCTGCAATTTCTTTTGCCAAAATTTTCAGTTTGTAGTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGTGGGTGGCCATGGTGCCACTGCGGGGTTCCCGTCAGCATCCGTGTTTCCCACAATGCGTGGAGTGGATATTACAAAACCAGCAGGATGATGGATCTTGGGGTACAAGAGGATTCGGCGTGGCGGTCACAAGAGATGTTCTGTCGTCTACGTTGGCGTGTGTTCTTGCACTCAAGAGATGGAATGTTGGGCAGGAGCACATCAGGAGAGGTACAAACGACTGTGCATTTACCTGTCGATGTTTGTTTTAATTGACTCTGTATGTATCTACACATTTAAGGCTTGGAATGTCTTAACGCTATGAAAATGGTACTGTCAGGACTAGATTTTATTGGAAGGAATTTCTCCATTGCCATGGATGAGCAGATTGCTGCTCCTGTTGGTTTCAACATCACTTTTCCTGGTATGCTTAGCCTTGCCATGGGGATGGATTTAGAATTCCCTGTCAGACAGACAGATGTTGATAGACTTCTTCACCTCCGGGAGATAGAACTCGAAAGGTCTGTTAGTTCTAACACGAACATGGATATTGTATGTCATTAGTATTTGTATTACTGTTGTTACGAGTATGTAAAGTTAGTATGCAAGGGTTGATTGTGTGGATGAAGTTTTACCATCAGGCGTTCTAAAAATAACTGTCAGCTTAGTTTTATTCCCTAGTTCCCCCTGCATTCTTTTTGAAGGAAGGAATATAATGACCTTCTCCTCTCTTTTTTTCCAAGATCCTATATTTGGAGGAAATGATCAATCTCGGTTTTAATAGTGCCTATGAGTAACGCACTGAAAATCTGATATGATTAAATGCAGAGAGGCTGGAGACCATTCTTATGGAAGAAAGGCATATATGGCTTATGTCACAGAAGGATTAGGAAACCTGTTGGAGTGGGATGAGATTATGATGTTCCAGAGGAAGAATGGATCATTTTTCAACTGTCCTTCCACAACTGCTGCCACATTAGTCAACCACTATAACGATAAAGCCCTCCAGTACTTAAATTGTCTGGTTAGTAAATTTGGCAGTGCAGGTGAGTCTGCACGCATTTTCTTGTCAAGAACTTTCTACAGTGTAGACTGCTCCTAAATACATAGTAATACATTTGGTCCATTGCAGTACCAACAGTGTATCCACTAAACATATATTGTCAGCTTTCATGGGTGGATGCACTTGAAAAGATGGGAATTTCTCAGTATTTTGTCAGTGAGATAAAGAGCATCCTAGACACAACATACGTGTAATGACTTTGAGTAAGTATTTTATCTATCTTTAATAGTTCAAACTTAATTTTAGCTAGTTTGCAGTTCATGGTTAGAAAGAGATGAGGAAATTATGCTGGACATAACAACATGTGCAATGGCTTTTCGCCTGTTAAGGATGAATGGGTATCATGTTTCCTCAGGTGTGTTCTAAGGCTTGAAAGGAATATTTTTTTTGTTGGTTTCGAACT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|
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