Os06g0625400

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Structured Information

Gene Name	Os06g0625400
Description	Similar to Metalloendopeptidase
Version	NM_001064647.1 GI:115469025 GeneID:4341569
Length	10260 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os06g0625400, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 6
Location	Chromosome 6:26077334..26087593
Sequence Coding Region	26077923..26078005,26078202..26078352,26079096..26079197,26079377..26079457,26079555..26079675 ,26079939..26080056,26080169..26080292,26080466..26080618,26080772..26080999 ,26081110..26081247,26081622..26081771,26081895..26082065,26082198..26082401 ,26082535..26082759,26083116..26083250,26083650..26083751,26084241..26084481 ,26086331..26086344
Expression	GEO Profiles:Os06g0625400
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008399:26077334..26087593 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008399:26077334..26087593 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>accacatgttgcaatccatttggtgctatggcaagcctttttgcaccaaagctacctggtggcttggctgcaagcctaactggtgaaagatcacctgctgcggataaaataaagcctgtgaaaagggaaagacaggcaattaggccacctgtagaacataagtggtctcttcctggagttgcccaggatgccaagcctccagcaatttttcaacatgaattgatccagagtttctcaatcaacatgttctgtaagatacctgttaaccaagttcagacatataaagacctgcgaagtgtcctgatgaagcggatatttttatctgctctgcattttcgaatcaatacaagatataagagctcaaatcctccttttacatccgtcgagctggatcatagtgactctggaagggaaggttgcactgtcactactcttacagtaacagctgaaccccagaattggaggagtgccatcaaagttgccgttcatgaggttaggagactcaaagagtttggtgtcacaatgggggaaatgacccgctacatggatgcactgataaaagatagcgagcaactggctatgatgattgatagtgttccctcagttgacaacttggacttcattatggagagtgatgcacttcgccatactgttatggatcaattgcaggggcatgaaagtttgcttgctgttgctgaaaccgtcacccttgaggaggtcaacactgttggtgcagaagttctggaatttatttcagattatggaaagcctgatgcaccgcttcctgctgctattgtggcctgtgtacccaaaaaggtccacatggatggagtaggtgaaactgattttgagatacatccggaagaaataactgattccatcaaggcgggtcttgaggaacctatttacccagagcctgagctcgaggtgccaaaagaactgattactcggtctgagcttgaggacttgaaattgcaacgcaaaccatcatttgcttctctgagtaaagaggagaatgttgtgaaaatatttgacgatgaaactggtatagcacagcgccgcctttctaatggaatttccatcaattataagatcacacaaaatgaggcaagggttggtgttatgcgactgatagtaggtggtgggagggcaacagaagattctgaatctaagggatctgttattgttggtgttcgtactttgagtgaaggtggctgtgttggcaacttttcaagggaacaggttgaacttttctgtgtgaataatctcataaactgctcattagaatccaatgaggagttcatttttatggagttcagatttgctttaagagacaatggcatgcgcgctgctttccaactcctccatatggtccttgagcataatgtgtggctagaagatgcatttgatagagcaactcagctatacctgtcttactatcgctccattcccaaaagtttggagcgctctacagcccacaagcttatgttagccatgttgaaccatgatgaaaggtttgtagagccatcaccacattcattgcagaaattgactctccaatcagtcaaagatgctgttatgaaccagtttgttggtgacaacatggaggtcagtattgttggtgatttcactgaagaagaggtcgaatcttgtgttcttgactatcttgggactgtgagtgctccaaaatcttcaaaaacacaggagcatattgagaagatttccttcctgccgtttccttcggacttgcattttcagcaagtatacataaaggatactgatgagagagcttgtgcctacattgctggccctgcacctaatcgctgggggtttgcaactgaagggaatgatctattcaatgtcatccggagttctagtggagatgctcaagtttctgaatcagcaaacacagatcttacggagaggaaacataatgacgttcgcagccattctctgttctttggcatcactttgagtttgttggctgaaattattaattctaggctattcacaacagttcgagattccatgggattaacctacgatgtttcttttgaactaaacctttttgacaaattggaccttggttggtatgtgattgcagtaacatcaaccccgagcaaggttcataaagctgttgatgcatgcaaaggtgttctcagaggattacatagtaacaaaattgttgaaagggagctggaccgggcaaagaggacgttattgatgaaacatgaggctgagacaaagacaaatgcctattggcttggtttactagcccatctgcagtcttcatctgtgcctagaaaggaaatatcctgcatcaaggaattgacgatgttgtatgaaagtgccacgattgaggacttgtatcttgcatatgagcacctaaaagttgatgaatcttctttgtttgcttgcattgggattgctggtgctgaatctggcgaagagacgactgatgatgagctcgatatgggcctgcatggcatgggtcctattggaggccgtggtctatcaacaatgaccagaccaaccacatga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>TTCCNPFGAMASLFAPKLPGGLAASLTGERSPAADKIKPVKRER QAIRPPVEHKWSLPGVAQDAKPPAIFQHELIQSFSINMFCKIPVNQVQTYKDLRSVLM KRIFLSALHFRINTRYKSSNPPFTSVELDHSDSGREGCTVTTLTVTAEPQNWRSAIKV AVHEVRRLKEFGVTMGEMTRYMDALIKDSEQLAMMIDSVPSVDNLDFIMESDALRHTV MDQLQGHESLLAVAETVTLEEVNTVGAEVLEFISDYGKPDAPLPAAIVACVPKKVHMD GVGETDFEIHPEEITDSIKAGLEEPIYPEPELEVPKELITRSELEDLKLQRKPSFASL SKEENVVKIFDDETGIAQRRLSNGISINYKITQNEARVGVMRLIVGGGRATEDSESKG SVIVGVRTLSEGGCVGNFSREQVELFCVNNLINCSLESNEEFIFMEFRFALRDNGMRA AFQLLHMVLEHNVWLEDAFDRATQLYLSYYRSIPKSLERSTAHKLMLAMLNHDERFVE PSPHSLQKLTLQSVKDAVMNQFVGDNMEVSIVGDFTEEEVESCVLDYLGTVSAPKSSK TQEHIEKISFLPFPSDLHFQQVYIKDTDERACAYIAGPAPNRWGFATEGNDLFNVIRS SSGDAQVSESANTDLTERKHNDVRSHSLFFGITLSLLAEIINSRLFTTVRDSMGLTYD VSFELNLFDKLDLGWYVIAVTSTPSKVHKAVDACKGVLRGLHSNKIVERELDRAKRTL LMKHEAETKTNAYWLGLLAHLQSSSVPRKEISCIKELTMLYESATIEDLYLAYEHLKV DESSLFACIGIAGAESGEETTDDELDMGLHGMGPIGGRGLSTMTRPTT</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>9589..9671#9242..9392#8397..8498#8137..8217#7919..8039#7538..7655#7302..7425#6976..7128#6595..6822#6347..6484#5823..5972#5529..5699#5193..5396#4835..5059#4344..4478#3843..3944#3113..3353#1250..1263#atctcttcttcctcccttcccctcgggccaagggccatctcacccccaccaccgcgatggcctccttcccctcccctccgctcgccgcggcggcggccgcagcgccgccccgcctcgccccgggcctccccctggccgccgccgccgtgcgcaggccctcctccctcgcgcgccggtcctccatcgccctcgccgccccggccaaccccctccgctgcatccaccgccgcgccgtgtcgcccaggtgagcccgaagaggagtttggttacctctgtcccgcccccgcccccactcgtctagggttccagcggaattggccgcccgcgagactctgattttcagcgtggattgttgtgtgttgccctgcaggttgaggaggcggacggaagctgtcggcgcggcctcggcggcgattgggagcctcggcgaggagagggaagggtgcctctcgtgcttccccaggggccggaggcgggggaggccggggctcgcgaggttcgcgccgtgcgcgctcccgcacacctatgggctatcgtcgctccacagcgggttgactggcgctaaggttcgtgtcatccgtaatgcgtctgaattgatagattaggaaaatccggttcagttaattggggatcattggatgagtgttgtggacaaaagtggccagttcccttgcttgcgatgctgtgtcctcctcggttgctttttaatggtgcgtgtggtttattgggaataggatcggtacaacaaatgtggatatcgctatcagtaaagcattgagtgcgcctgtatgtatttctccgacttatacagaaatcttaaacatgggataggtccgcatgttttaatttacagcacaaatggcaagctaattgttgaattaacatcaaagttgaagctagaaagaagtactgtactgcaaatcatcgcttaaagcaccattcttcagggctggttctcaacggcatgtgaacagtgaacacactcgagaattaggaacacgtcttttcatatgtttgttttgatgcatttacttgtatttattcaaagaatccagcttcaattatgttataaaacaggaaataataaattaataaaggttatatggcactacagagtataacatgatcccatagttccccttcttgattaaagtggttcaatggaataaaattcatgaattctgaccacgatgtttgatgattttcagatcaggcgtcgccatgtattacatgctgctggacctgatgaaccacatgttgcaagtccaacttggtctgaaactgctctggataaacattatgtagatcagccaattgggaaggaggaacttgaaggttttcttaacacaccgcttccttctcatccaaagctagtccgaggacaattgaagaatggcctccgatatcttattctaccaaacaaagttccagcaaacaggtgaagaaacttgtttcatttccacctataaacccttcttttgcagcagtaccaacataaccttcagctgctataacaaaagtatttacatgatttgggatgccgtgagttgtatttcctagcagtgtgggggcctacagttttgacttttgacaagttgttatgttaatttcgttgcaacataactatttggattttggaccctttaaacattcaatatactttagtgttgattcctggacatcaaaattgtttcagtatattgatatattgacaaatattatacggtggcttggggcctagttcatgccagtaaattacactacaaacttgtgctaaatgtagagcatatacacaatgttctaatatgcttgtcaaccggtgattaggtgcaatgctgatgcaagattctaactaatcttttttgcaggtttgaggctcacatggaagttcatgttggatcaattgatgaggaagaagatgagcagggaattgcacatatgattgagcatgttgcatttcttggcagtaaaaagcgtgaaaaacttttggggacaggtgcaaggtctaatgcatatacagatttccaccataccgtgttccatatacattctccaactaaaacaaaggtatgtacttttgcagtcatcggttgtttctttaagtctatctctgttttctattgctttgaatattttctttgacaagaatatatatgaaaatcaactgggaaactgttgactgccatattatgtgcataacatgtcttcaacgcttaacatatgtaggtatttcaatctggtggtccaaatttgatgtcttctcttgtttatttaagggtttaacatattagcttgtcttttatgtggcaggaatatggtgaagacttgctcccttctgtgttggatgcattgaatgaggtgggatgttacgtataggctatatgcgcagcttttgctaccattttatttctttttggttaagggcctttcaaataacaattatctttcatttggcgataaaagttttacatgcatttgggtagcctgtttaacaaattctctttctgccaaatttttgttctcccagatagcttttcatccaaaattttcttcttctcgtgttgagaaagagagaagagcaattctttcagagctccagatgatgaacacaatcgagtatcgtgttgattgtcaggcaagtaattattttactctgtaccactttttagggcatcctctgagaagggattgttcctcttgggacacatgctaaatcaattcatatttaagggtactatctttctatactaattgcaattcatttggtgtagttattgcaacatttgcactcagaaaacaaactgagcgaaagattccctattggacttgaagagcagatacataaatgggatcctgataagatccgcagatttcatgagcgttggtattaccctgctaatgctactttatatctggtaggagagatcgatgatattcccagagcaatacgagaaatagaggtaactagaattacaacctcctaactgttgttttttcttatatttctgctgatctgttttttggattaatcgtaaactgactcatatgcaatgcaggctgtgtttgaacatacacttccagaaggtgaagcagcccctatgtcaactgcaagtccatttggtgctatggcaagcctttttgcaccaaagctacctggtggcttggctgcaagcctaactggtgaaagatcacctgctgcggataaaataaagcctgtgaaaagggaaagacaggcaattaggccacctgtagaacataagtggtctcttcctggagttgcccaggatgccaagcctccagcaatttttcaacatgaattgatccagagtttctcaatcaacatgttctgtaaggtatgattgtttgctatctgctgaattttactctttagggcttgttctgttaatcctcatgaggaaggggttgagagggattaattccacacctcaatagatgtggaataaatccccctcaatccctttgggggagggattaactgaacaatgcatttgggttgcgctttgtgcctctacagcttagtgttagcttagtttaacaccagatgtttccatagtggtttctgttataatatatagtagatgggaaccagtattttgttgtaatcagcgaaaagtttgatagccctttcttccctccctctctgtgcacatgcacacatattccgcctgtgcctaactattcattttctcttctcagatatgattctattttatgattcaaatgagaacagtctttagctttaagcttactcttctctttgaactttcttaaaaatgcatcatttgtatatgcctaactaattgatttctttttgtggacagatacctgttaaccaagttcagacatataaagacctgcgaagtgtcctgatgaagcggatatttttatctgctctgcattttcgaatcaatacaagatataaggttcgtgatatttaatcaacgtgaattttgaatcactctaattttttcacttatgctgagactttctttggtttatctctctaaagaatgcagataagttcatatgatttgcattcttttatatctatatctagcacatgtttttttctttttgtagattgtttgtacatgtttaacagatagacataagacatgcattttactggacattagacttgctgcataagtctgtaggaggcctgaggtctttccagtgaagtatttacatttgtttggaatcatctcttttttttttgcttggaattaggtttaagtaattaatagttccatgtttcttgtttctagtttttagtgataaaaacatctttcctgtatatgaatgctgtattttttatacagagctcaaatcctccttttacatccgtcgagctggatcatagtgactctggaagggaaggttgcactgtcactactcttacagtaacagctgaaccccagaattggaggagtgccatcaaagttgccgttcatgaggtttgtatagtatactcatgaccagtttatctgttttacatgacttgttctagctcacactcaatttaatcaatggaattatatatagacagtcatagataatttcaggaaatgtaattgttggaaggaacaaatagaaaaaagaaacagttcaatggaagttattgaagcaagattttattagcacaagacccgcataaagcaaaacttgcctatgtcctgtgtaacgctgctagccaaagcctaatctgacctgatcttcatccaacctggtcccaacacaacccaagcattctttaaa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External Link(s)	NCBI Gene:Os06g0625400, RefSeq:Os06g0625400