Os05g0341600
| Gene Name |
Os05g0341600 |
|---|---|
| Description |
Similar to Ras-related protein Rab-21 |
| Version |
NM_001061782.1 GI:115463294 GeneID:4338469 |
| Length |
4497 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0341600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:15997018..16001514 |
| Sequence Coding Region |
15997421..15997539,15998086..15998174,15998470..15998635,15998717..15998777,15999640..15999776 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:15997018..16001514 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:15997018..16001514 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggctcgaagccgccgccgccgccgcagcccagcgtctccttcaagctcgtcctcctcggcgacgggagagtaggcaaaacatctcttgtgctgcggtatgtgaatgatgtcttctcagacaaacaggaagcaactgttcaagcttcatatttgacaaagcgccttgttgttgaaggtgtgcctattacgctctctatctgggatacagctggacaagagaagttccatgcactaggccctatatactatcgtgatgcagacgctgctcttttagtatatgacatcacagacaatgatacttttcttcgtgtcacaaagtgggtgaaagagcttaagcaaatggcaaataaagatattgttatggccattgcagcaaataaaagtgacctggttagatcaaaacacatagacactaatgaagcagcaagctatgcagaaagtattggggcaactctctttgttacttctgccaaagctggtactgggattgatgatatcttcagtgacatagccaagagattattagagagaagaaaaaacagctccgatggcttgtcactggctcatccaaagaaaggcattttaatcgtcgacgatgaacctgagaaagaacctccaccaaagtgctgctcatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGSKPPPPPQPSVSFKLVLLGDGRVGKTSLVLRYVNDVFSDKQE ATVQASYLTKRLVVEGVPITLSIWDTAGQEKFHALGPIYYRDADAALLVYDITDNDTF LRVTKWVKELKQMANKDIVMAIAANKSDLVRSKHIDTNEAASYAESIGATLFVTSAKA GTGIDDIFSDIAKRLLERRKNSSDGLSLAHPKKGILIVDDEPEKEPPPKCCS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3976..4094#3341..3429#2880..3045#2738..2798#1739..1875#129..195#tcccacacttctcctctctgaccacagcacacacgcaacaccgggacgggcgatccggaaggttctggaaccttctagaggctcgtaggagcctccggcggaacccctctcgcctcgcctcgcctccgatgggctcgaagccgccgccgccgccgcagcccagcgtctccttcaagctcgtcctcctcggcgacggtacggctatctccctctcccttccgatcccgcgaaccctcctcccccccttctcaacccccttttctgccgaattcccgatccttcagtttggggttggcgtgcgcaagaaaatagccacggaatctgggtgaattttggctgctcttgtggtgcgtgctgagccctagctagggttaggggaaagccgcagaatcatttgatctggtaccctgtgtaggtagctaaatctatagcttagacgagggagttgagcggttttgagctaagcttaccttttacttgattgccttcgaggcttagcggagtccaggagatgattagaccgagagggctactcatagaaacaatctaacaagtagaagcatattcgttcttatatagaagatttgtctagtgctagctgcagcggggactgctgcaaattcatgtggacacaaagtggcagctgaagggtggccatggagctggtggcagggaattcgtcttatgcaataggggtggataatatttcattttgatccgtgctctctgtccgcttttaagcttggattgtaatgtccagctgatctagttctatattaattggtggttttacttttcttgtcattaccttaaccaacccttgaaggcagggtcctagaaaaaaaaaattcagtatgactcagctttttggtcatctgtgtatgatgccatgggtcttacccatgttcctctagagaaagtgatgtgtgcctttttggaaaaatgatacagtatgtagtttgggaggagggggttttgatgggaaagtactacagtctttatttgggcatgcttcttagcaagtgcatgtaagtcatacatgggaatgtcaagagaatttttcttgaaaccaggcacgggtgggcattgatctaacatggtacacttgcttttcctagcattgttgaacattgactcattttgatttaggatcagcttacttatagcttagaagcaagcttggaaatcagtttgtgcattgccaaagcggaatcacgtttcatttgaagttggctaatttcaattttggaaaagaaaaaagttggagtagttttgaactgaggcaatgagcacaatgaaagaattttttaccacagtagacagtacttgataagtgatagcgccagcataatcaattgctgaaactctttaaccatgccttagtacttggctttacattttttgaatgaagatatatatgtgtttccatgcataaaagcattgttgatagtcttgtgggcatgtatcttataggttgggtcattagggtttgcttattgttataactttctgtcattgatttcagatttttaatggaagaggtgtttaggctgtcttgtaaccagtcctctgttggcccagcctatcaatgtgaaaactgataaacctaagtttaacttaggatgaattgatcataattatatgctccattttttcaatttcattgaaaagacatgtgattgaatacatttcatatttattaacacaaacaataacttttacttttctcttggcacagggagagtaggcaaaacatctcttgtgctgcggtatgtgaatgatgtcttctcagacaaacaggaagcaactgttcaagcttcatatttgacaaagcgccttgttgttgaaggtgtgcctattacgctctctatctgggtgcgttgtcatctctttgatttgcgataatttgttcaacattttttacctctttcattttctcttatgtcagttgcacacacttgtttgaagtaattgtttactaattttgctgttgggatgatattcaattatggtttcaaatcccacttatatgtgcccttgtatcagaaatcctagtaggagtcagaaaaggtgaaaccaacccaattttgttggattataatacgagattgggaatatttagagatatgtggacttagttcttcattaaaaaaggagtaaatttcatagaactacggatattttgacaaaactatcacagaactacagatttaaggtcaaatttatcccaaaactacagatttaaataaaactgttacatggtttgcttccattatagctaaagtccgagactctgtgtacttgaactcatgaagccaaacattagattgcttggacatgttcagctggcatacaacttgtctacaggtttcacggaaatgggaatgattaggtttattactctcctgttgattgatttgactctcattttgttgattgcctttttaatttaagtaagattttatcagtatggttgtgttcagttttttactgatgtgacggtatccttcatggaaatcttaaatctttaccagaatactgaaactagactttggtcctccttttggttagtttgtaggctttgcttgttctatcaacaaaagtatatttgctaccagtgactgccttctataactgagtaataacttatttccacgcgctggtcacttggttgtctcctttactttaagttcttcctgcaagatttttttagtatttaatttttcttggtttgcaggatacagctggacaagagaagttccatgcactaggccctatatactatcgtgatgcagacggtaatattcgtcttcttgttttgaattaaatatatcgaggtggatcactaaattcttttttatatcttttgatgactgcagctgctcttttagtatatgacatcacagacaatgatacttttcttcgtgtcacaaagtgggtgaaagagcttaagcaaatggcaaataaagatattgttatggccattgcagcaaataaaagtgacctggttagatcaaaacacatagacactaatgaagcagcaaggtattcttctttgttatcagttacaaatactacacagccaaaatatgtaatattgccctggtacttgagttagcaacttagcatcgttagtctttgagtagaacaaaagaaatatatgtgatatatactttatctgttgattaaactatttagatatatcagcatagtttcaacatataatctgcaatccttttatgattgtacagtttcttgaaaatgcgttcttttagttccatatttcctcttctctatctatttcatctaagtaatattgttactacatgtacatctccagctatgcagaaagtattggggcaactctctttgttacttctgccaaagctggtactgggattgatgatatcttcagtgacatagccaagagtaagtcttattgtgttagctattgctttcaattcatctccacatttttgccactttaacaaatactgctttgccaaaacttataagttgtaacattcagctattccattagaatgcggggtcatcaacgatagcatatagtttagttaacaatttcatgtttcactctattgagcagatttcgtttatcaaactcaattgttattcctcagattaatccattgtataacactcaatatttgcgaattccctcttcatctcaataacaaggtgggtatggacccacatgtcattggtatagaatgctgtattcgaagtggctatgttgtatgtagtttgtctagagctattcttgcaatgacataacttgcaataaatggatatgtatgcattcttaatcctactgattttctggacttgtcaccagggaattcaaacactgctaacatggaactatttatttccttttaagctgttgaaaatcgtatgtccctaactgattggtggttttcttaattgctatgccctcactaccgtttgttgtaggattattagagagaagaaaaaacagctccgatggcttgtcactggctcatccaaagaaaggcattttaatcgtcgacgatgaacctgagaaagaacctccaccaaagtgctgctcatagcgagattccaatgcaaatcacgtgggcataatgtcatagaaacctgcaattgatatgtgaaggatcaaatccttgcattaactttgctcatgctcttttggagctcaggagcaatgcaagtgtatactggttgattatttttagcttgtgtaaatactaaactcagttcatgaaattgttgtcaaatatagttgttcgatgatgacgattcgatatgccgaagaagttcatggccctttgtatatctgtaactcacaggttgcttatttactagctgttgttttgagggggttattttgatcatgtgcgtcgaaataattgtgtcgtgttgactgctgagtgtacatgtatcgtggttattccatctgaacctgcaatgtaaagcttccgtcccaattcccaa</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
