Os08g0559300
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0559300 |
|---|---|
| Description |
Similar to Gibberellin action negative regulator SPY |
| Version |
NM_001069036.1 GI:115477810 GeneID:4346315 |
| Length |
7732 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0559300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:28079564..28087295 |
| Sequence Coding Region |
28080313..28080681,28081406..28081567,28081662..28081837,28081928..28082003,28082401..28082529 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:28079564..28087295 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggggcgaccggggatggactccagcgaagggagggagagcaatggcgttgttcctgaacgtaatggtggtgctgtccctgcaaaacagcagttggacgggaaggacaccttgcggtacgccaacatcctccgctcccgcaacaaatttgccgaagcactccagttgtacaataatgtccttgagaaggatgaagccaatgtggaggcccttattggcaaagggatttgcctccaggcacagagcctacctatgcaggccatcgagtgcttcaacgaggccgtcaggatcgacccagggaatgcatgtgctctcacttattgtgggatgatatacaaagatgagggtcacttagttgaagctgcagaggcttatcaaaaagctcgaaatgcagatccttcctacaaacctgctgcagagtttcttgctattgtgttgaccgatcttggaactagcttgaagcttgcaggtaatacagaggaggggattcaaaaatattgtgaagctttggaagttgacagccactatgcgcctgcttattacaaccttggtgtggtttactcggagatgatgcaatttgatttggctcttacttgttacgagaaagctgctttggagaggccattgtatgctgaagcttattgcaacatgggagttatttacaagaatcgtggagaattagaagcagcaattgcctgctacgagaggtgcttgactatttccccaaattttgagattgccaagaataacatggcaatagcactaaccgacttgggtacaaaggtaaaaattgagggtgacattaatcaaggtgtggcatattacaagaaagctctgttctacaattggcactacgctgatgccatgtataatcttggtgtcgcatatggtgaaatgttgaattttgagatggctattgttttttacgagcttgctctgcacttcaatcctcgctgtgcggaggcatgcaacaacctgggagtaatatacaaggacagggataatcttgacaaagctgttgaatgttatcaaatggccttgtcaattaagccaaatttctctcagtcattgaataaccttggagttgtctacactgtccagggaaagatggatgctgcttcaagcatgattcagaaggccatatttgcaaattccacgtatgctgaagcatataataacttgggtgttctttacagagatgcaggaagtattacttcagccgtacaagcttatgagaaatgccttcaaattgatcctgattcacgaaatgctggtcagaatcgtttgcttgcgttgaattatattgatgagggctttgacgacaagctttatcaagctcacagggagtggggaaaacgcttcctgaaattgtatccacagtatactagttgggataacccaaaagtcgctgatcgtcctctggtcattggctatgtgtctcctgattactttactcactctgtgtcatacttcattgaagctccccttgcacaccatgactactcaaattacaaggtggttgtgtattctggtgttgtgaaggcagatgccaagacccttcgattcaaggataaggtattaaaaaagggtgggttgtggagagatatatatggtattgatgaaaagaaggttgctagcttggtaagagaggacaaagtggatatacttgtggaacttactggtcatacggcaaataacaagttaggaacaatggcatgcaggcctgctcctattcaggttacatggattggctaccctaatacaacaggtctgccaacaattgactacagaataacagattcattggctgacccacctgatacaacccaaaagcatgttgaagagttggtgcgccttcctgaaagctttctttgttacagtccttccccagaagctgggccagtttgtcccactccagcaattttaaatggtttcatcacgtttgggagttttaataatctagcaaagattacaccaaaagtattgcaagtttgggccaaaattttgtgtgcagtccctaactcccgtcttgtggttaagtgtaagccattctgctgcgacagtattagacagaaattcctatcaacactagcagaattgggtttggagccgttacgagttgacttgctgccactcatccatctcaaccatgatcacatgcaagcatattccctaatggacataagcctggatacgtttccatatgctggaactactactacatgtgaatctctatacatgggggttccatgtgttactatggctggctcagtccatgctcataatgttggtgttagtctactcactaaagttgggctggggaggctggttgcgaagtctgagaatgaatatgttagcttagcattggatttagcggcagatgttactgccttgcaagaactgagaatgagcctccgagggctgatggcgaaatcaccagtgtgtgatggagagaatttcacacgtggtctggaatctgcatacagaaacatgtggcgcagatactgtgatggggatgcacctgccctcaggcggttggatctgttacaggaagagccatgctccaataacaataagcaagattttgatgacaatcaggtcgcaaagctcgcagatctgaaagcacagagagtggatgccgcggtagatggagacaagcaatcccagttaacagcgcatgctgcagtagtaggggaagttcagcaggccccaataatggtgaatggtgtgagttcacctgtctcttctgggaaagttgaagcaaatgggcacataagccggtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGRPGMDSSEGRESNGVVPERNGGAVPAKQQLDGKDTLRYANIL RSRNKFAEALQLYNNVLEKDEANVEALIGKGICLQAQSLPMQAIECFNEAVRIDPGNA CALTYCGMIYKDEGHLVEAAEAYQKARNADPSYKPAAEFLAIVLTDLGTSLKLAGNTE EGIQKYCEALEVDSHYAPAYYNLGVVYSEMMQFDLALTCYEKAALERPLYAEAYCNMG VIYKNRGELEAAIACYERCLTISPNFEIAKNNMAIALTDLGTKVKIEGDINQGVAYYK KALFYNWHYADAMYNLGVAYGEMLNFEMAIVFYELALHFNPRCAEACNNLGVIYKDRD NLDKAVECYQMALSIKPNFSQSLNNLGVVYTVQGKMDAASSMIQKAIFANSTYAEAYN NLGVLYRDAGSITSAVQAYEKCLQIDPDSRNAGQNRLLALNYIDEGFDDKLYQAHREW GKRFLKLYPQYTSWDNPKVADRPLVIGYVSPDYFTHSVSYFIEAPLAHHDYSNYKVVV YSGVVKADAKTLRFKDKVLKKGGLWRDIYGIDEKKVASLVREDKVDILVELTGHTANN KLGTMACRPAPIQVTWIGYPNTTGLPTIDYRITDSLADPPDTTQKHVEELVRLPESFL CYSPSPEAGPVCPTPAILNGFITFGSFNNLAKITPKVLQVWAKILCAVPNSRLVVKCK PFCCDSIRQKFLSTLAELGLEPLRVDLLPLIHLNHDHMQAYSLMDISLDTFPYAGTTT TCESLYMGVPCVTMAGSVHAHNVGVSLLTKVGLGRLVAKSENEYVSLALDLAADVTAL QELRMSLRGLMAKSPVCDGENFTRGLESAYRNMWRRYCDGDAPALRRLDLLQEEPCSN NNKQDFDDNQVAKLADLKAQRVDAAVDGDKQSQLTAHAAVVGEVQQAPIMVNGVSSPV SSGKVEANGHISR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>750..1118#1843..2004#2099..2274#2365..2440#2838..2966#3047..3166#3256..3322#3416..3499#3700..3794#4111..4175#4288..4486#5110..5304#5550..5644#5743..5878#5949..6166#6413..6540#6832..7301#aaagaagggaaaaaaaatacgaaaagcaaaaaggaataaacggagggggctaaacaccaaaattccccctctccttctccttcccctcctcccgaaaccctcgccgccgtcgctgtcgaaaccctcgctgctgctgctgccgcacggcgcggcggggtaccgggtccccctccctgcggcggcgcggaggggtaggtctcccccccctcgctgcggcgtggcggtggggggtgcggtgccggctgccgcgccatgatcttgcgccggtggactgcgcctatccaatgtgagctctcctcctacttccgccgcggcattagggttcttgcttcttgagctggaagagttctcttgcgttgcgaacgcctactgtttcctgcgaattcttagtgcttgttcttggattctttccgggggtgttcttaatctgttgtttgcaaaagttctttttttctttttttggctagggttttgaaatttgcaatcttggtgttcttttccctgagtttttactaaaaagctgcggcttttacgcaattcggtggtagtccaaagccgcgtcctttttttctagtctttacgcgcatttggctccaatttttctcctttttttagacgcgttttcttcacgctaatattcgcaactgaaatcttagacctaacgaaccattctaaaattgatgatcgttacattctttctgcagaaaaaaaaaagataaagatagaacaagtaggttactttccgtaccatggggcgaccggggatggactccagcgaagggagggagagcaatggcgttgttcctgaacgtaatggtggtgctgtccctgcaaaacagcagttggacgggaaggacaccttgcggtacgccaacatcctccgctcccgcaacaaatttgccgaagcactccagttgtacaataatgtccttgagaaggatgaagccaatgtggaggcccttattggcaaagggatttgcctccaggcacagagcctacctatgcaggccatcgagtgcttcaacgaggccgtcaggatcgacccagggaatgcatgtgctctcacttattgtgggatgatatacaaagatgagggtcacttagttgaagctgcagaggtatgcgtaagattcttcatgtggattccctgttcttactgttagcttattcgttattgtgaaatctgatagtttttctttttagtttgttgtcataaacactagaagtctcaaatgttgtatatgtggttctctgaaagcaaaatactcaaatgctgaagtaagtgcctcgcacagtcgcactccccaaaataccaggcaatgagacttgggacttaactgccaatttctgacttctgagggtactgcagacctatttttagcaccaagttatatcttgagtggtttgtgtccaagaactgtaactagaaaccaaaacaactagtttgataagttcttgatcaagcatactatgcaagagataaaactgtcgagataatcactcaagaattttccagcagaagattttttattatctccatgacatacttattagcaccgtaaaattttgtgcgtagctggtggatagaatgacatgtgaatgagctaaggctcagctagagctgcaaaaagagtaatacttttgccccttggagaatagtggtccctattaattggcagggttgtaaaaatcctaagttcctaaccaatctaacatataagatcaaaacagttggtcagtccaaaaattctctcggaaaagcttggaatttcgacattgtttctgtatttattatgtgatatatttatccataaatgttctgatggagagaaattgtaacaggcttatcaaaaagctcgaaatgcagatccttcctacaaacctgctgcagagtttcttgctattgtgttgaccgatcttggaactagcttgaagcttgcaggtaatacagaggaggggattcaaaaatattgtgaagctttggaagttgacagccactatgcggtaccatcaccagctataatttatatctagatctctattattttgtttttgttatccatttaagttttttaatgtgttcatctgattaatgtagcctgcttattacaaccttggtgtggtttactcggagatgatgcaatttgatttggctcttacttgttacgagaaagctgctttggagaggccattgtatgctgaagcttattgcaacatgggagttatttacaagaatcgtggagaattagaagcagcaattgcctgctacgagaggtaagctttattttttctgctcatacaaattatgctgattcccaaagtactgttgaaaactaatgttgacttatctttactgtatcccaggtgcttgactatttccccaaattttgagattgccaagaataacatggcaatagcactaaccgacttgggtacaaaggtgtggtcttgctaccttttgtttcaaccaaatcaacacattgcttcttgtggtgtcctgcatgtcaatcataatggttgccatcacttgcccatcatattagcagtcatgcgtgacaggcttgaactaagactagtgttgatttgaaaattgtctcaatcatgtgggttaatgaggaaacatcatgataactctatgttttttcgttgcttgtccgctcactttttactctgagcatagcaactctggcaatataattaattttgactaaccttagaatgaatcatatgaaatagacctttttaatttatactttggtatacctttaagaattgttaactctggcatttggtggtgatttttgtatttttctcttatcaattgacatttttcacaggtaaaaattgagggtgacattaatcaaggtgtggcatattacaagaaagctctgttctacaattggcactacgctgatgccatgtataatcttggtgtcgcatatggtgaaatgttgaattttgagatggtcagtcataagaaaaaaatctttaatattctgtacataatgtcctctcttttgctgacactcttttctgttttccaaaggctattgttttttacgagcttgctctgcacttcaatcctcgctgtgcggaggcatgcaacaacctgggagtaatatacaaggacagggataatcttgacaaagctgttgaatgttatcaagtaagtggaactaattatgcagtatgcaatatctgcagatagtcacaagtatcacaacagattattcattatcttctattctgttgtagatggccttgtcaattaagccaaatttctctcagtcattgaataaccttggagttgtctacactgtccaggcatgctcctctgctagtcttgcacaatttctattgggattggatgattgtatcatgttttagcttattgaatatgttgttcttcatatatagggaaagatggatgctgcttcaagcatgattcagaaggccatatttgcaaattccacgtatgctgaagcatataataacttgggtaatgtttaaccaaccaacatcatgagagcctcttaaattctgccatgtaatttgaaacagcattttccagctgagactcataacaactatataagcactaatcagtaattcatttcattgctttgcataattctctttttgatagctggaatgagactttaatacgtaactgacaatccatcactgctttcaccataggtgttctttacagagatgcaggaagtattacttcagccgtacaagcttatgagaaatgccttcaaattgatcctgattcacgaaatgctggtcaggtactttctttgtcctaagcttgctaattaaaacttgtgtaatctttctgtgttgcatggagaattaaatttatttaagcaggtacagctaataattatacttatccatttagtagcaaactgggaagcatataaatgtttcttccttgtataaatagacaaatacttgtctattgcatgttcataatttgttccaaccttgatgttgcttgcccacggtatctgttttgctgctttttaaaaaaaaatatatatttgtggaatagctatggtttatatttgtaacattcaacttacgatatagcttgttctgcagaatcgtttgcttgcgttgaattatattgatgagggctttgacgacaagctttatcaagctcacaggtcatttagcactttttcacaatatacagtcatatttatgttagattgttttttctgtttttatgtgttagaaattctcaactatatattcactgtattttatattttgcagggagtggggaaaacgcttcctgaaattgtatccacagtatactagttgggataacccaaaagtcgctgatcgtcctctggtcattggctatgtgtctcctgattactttactcactctgtgtcatacttcattgaagctccccttgcacaccatgactactcaaattacaaggtggttgtgtattctggtgttgtgaaggtagatatagccgttccttttcttgtctctattttcctgcattttcacattgtgtcccaaaaaacttgtttagactgtcttgcctcattaagatttaaaatatatatggaaataatttatgcaaaaatattccttttgaaaacagaaatggtagttcaatggtcaataggatagtgaactgtaattatttttcaagataggcctctagactatgtccagtttcaggattaccactttattattgcctagactgaaatgttttaaatagtgggctaagacatttagtggttagccttctcaaacagctatagcta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|
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