BGIOSGA016808

From RiceWiki
Revision as of 04:35, 28 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA016808| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016808, complete gene.| tag = OSJNBA0...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA016808

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016808, complete gene.

LocusTag

OSJNBA0074L08.13

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA016808-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA016808-PA

Length

4122

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:25240326..25244447

Sequence Coding Region

25240326..25240514,25240602..25240801,25240905..25241016,25243454..25243570,25243689..25244000
,25244109..25244447

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:25240326..25244447 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:25240326..25244447 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCTGATCGCTTCTTCCCCAACAATATGCCGGGCTATGCCGACGAAGGCGCGCCGCCGCCACCGGCGGCAGCGGCGGCGGCGGCGATCCCCTCCACCTACTCCTCCTCTCTCCACCACCTCCTCTCCCTCCCCTACCCCGACCTCGCCGATCGCTTCCTCCACGCGGCGCTTCACCTGAAGCAGAAGGTGGTGCACGAGACGTGGGATAAGAGGCGGCGCGCCGCCGCGGCAGCGGGGGAGGCAGTGGGCGACTTCACCCTCTACACCGGCGCGCTCGGCACGGCGCTCCTGCTCTTCAGGGCCTACCTGGTCACCGGCGACCGCGCGGACCTCGCCACGTGCGCGGAGATCGTGGCCGCCTGCGACGCCGCATCCATGGGGGCCGAGATCGCCACGTTCATCTGTGGGCGAGCTGGAGTCTGCGCCCTCGGTGCGGTGGTGGCCAAACACGCCGGAGATGAAGCTGGCGTTGCTCATTACCTGAGCGCGTTTAAGGAGATCAAAATTCATAGTAAATCACCTGATGAGCTTCTATATGGAAGAGCTGGATACCTATGGGCATGCACCTTCCTAAACAAGCACCTTGGAGATAATACTATACCGCCAACCACTACAGACACTGTCATGAGAGATATTATCAGAGATGGTAGAACACTGTCCACGATAGGCTGCCCATTGATGTATGAATGGTATGGTGAGAAGTATTGGGGTGCTGCTCATGGACTTTCTGGGATCATGCATGTTTTGCTGGACATGGACTTGACTAAAGATGACACGGAATGCGTAAAGGGAACCTTGCGCTACATGATTCAGAACCGGTTCCCTAGTGGTAATTACCCTGTTACTGAGGAGGATAAGCATGATCGATTTGTGCACTGGTGCCATGGGGCTCCTGGCATTTCCCTCACCTTAGCAAAGGCTTCACAGGTGTTCCCAGAAGAACGATTCCTTGAGGCAATTGCAGAGGCGGCAGAGGTTGTTTGGAATAGAGGGCTGCTCAAAAGAGTTGGAATATGCCATGGAGTAAGTGGGAACGCCTATACATTTCTAGCACTTTTCCGCCTAACGAAAAAGAAGGAACACCTCTACCGTGCTAAAGCTTTCGCTTGCTTTCTCCTTGACCGAGCTAAACAACTGATTGCGGATGGCATCATGCACAGTGGTGATGAGCCGTATTCCTTGTTTGAAGGACAAGTTGGAATGGCTTACCTGTTTCTGGACATGATTAACCCCCTTGATTCTAGGTTTCCAGGTTATGAACTTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MADRFFPNNMPGYADEGAPPPPAAAAAAAIPSTYSSSLHHLLSLPYPDLADRFLHAALHLKQKVVHETWDKRRRAAAAAGEAVGDFTLYTGALGTALLLFRAYLVTGDRADLATCAEIVAACDAASMGAEIATFICGRAGVCALGAVVAKHAGDEAGVAHYLSAFKEIKIHSKSPDELLYGRAGYLWACTFLNKHLGDNTIPPTTTDTVMRDIIRDGRTLSTIGCPLMYEWYGEKYWGAAHGLSGIMHVLLDMDLTKDDTECVKGTLRYMIQNRFPSGNYPVTEEDKHDRFVHWCHGAPGISLTLAKASQVFPEERFLEAIAEAAEVVWNRGLLKRVGICHGVSGNAYTFLALFRLTKKKEHLYRAKAFACFLLDRAKQLIADGIMHSGDEPYSLFEGQVGMAYLFLDMINPLDSRFPGYEL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..189#277..476#580..691#3129..3245#3364..3675#3784..4122#ATGGCTGATCGCTTCTTCCCCAACAATATGCCGGGCTATGCCGACGAAGGCGCGCCGCCGCCACCGGCGGCAGCGGCGGCGGCGGCGATCCCCTCCACCTACTCCTCCTCTCTCCACCACCTCCTCTCCCTCCCCTACCCCGACCTCGCCGATCGCTTCCTCCACGCGGCGCTTCACCTGAAGCAGAAGGTTAACTCGTCCACCACCGTATCGCTAGTTCGTCACCTCATGCGCTGATTGAGTGATTGATATTCTGGTGTGCTCCTCGTCGATCAGGTGGTGCACGAGACGTGGGATAAGAGGCGGCGCGCCGCCGCGGCAGCGGGGGAGGCAGTGGGCGACTTCACCCTCTACACCGGCGCGCTCGGCACGGCGCTCCTGCTCTTCAGGGCCTACCTGGTCACCGGCGACCGCGCGGACCTCGCCACGTGCGCGGAGATCGTGGCCGCCTGCGACGCCGCATCCATGGGGGCCGAGTAATCTGCGCGTTCCTCAGCCGCTTCGTCGGGCGCAGCAGCGTTTTGATTTGGTTTGGTTTGGTAAGGTGGTGACTCGGTGGGGTTTGGGGGATTTGTGCAGGATCGCCACGTTCATCTGTGGGCGAGCTGGAGTCTGCGCCCTCGGTGCGGTGGTGGCCAAACACGCCGGAGATGAAGCTGGCGTTGCTCATTACCTGAGCGCGTTTAAGGAGGTGATTAAGCGTAAAATGCTGCTGCTGATGATGCCTATAACGTGATTGTGATGATTAGCCTTCTGAACTCGATAAATTTGTAGTTTGACTTGGATGATGCTATAGGTGCAGGTTCATCTCAGTTAAAACTGGAATGGCAATAGAAATGAGCATTGGCTATTTTGGCTTATTATAAACTAGCTGGGTAGCCCGCGCAATTACGCGGCTAGCAGAAAAAAATAATATTTTTTTAAGTATAATCTTACTTAAAATTTATTAAAGAGCTATCTCAATGTTAAGACTTTAAAAGACCAAACCTTATCATCCTCGTGTTTCTAATTACATAGTTTTTAAAATCACACCAGTTGCTACCTCTTATGTCATCTCCTTCTTTATTTGCTTGCTCAATCTATCACTATTTCTATTTATTATTCTTGGAGCCTTTAAAAATTGGATTTTATAGTTTTTAGAGTTTATTGTCACGTTGGGTTTCGTTTTTATAATTTCTAGATGTCCCATCAAACGTTGCCATTATACTCCCGTCCACTATCTCTTCTCTTTATTGTCATTGAGATTTTAAAAATCGAACATAATTATAGTTTGGGTTCATTTTTACTTTCTAGAAGTCCCGCCAAACCGTCAGCGGTTTTGCCATTATGCTCCTCTACGGCTCGCCCGCTGCCTCCCTTCTTTATTGTCATTAAGATTTTAAAATCGAACATGATTATCATTGTTTTTTTTTTACTTTTTAGAAGTTCCGAACCTTTAAAAATTGGACTTGTAGTTTTATTTTTTATAATTTTTAGAAGTCCCATCAAACGATGCCACTATGCCCCTCTGCAGCTCTCGTCCGCCGCCTACTCTTTATTTTCATTGTGATTCTAAAAATCGAACATAACTATTATTGCAATTTATTTTTTATTTTCTAGAAGTTCCGTCAACCGTCGGAGGCTCTGCAACTATACTCTTATACACCCCGCCCACTGCTTCTCCTTTTTATTGTCATTAAGATTTTAAAAATCGAAAATAATTATCAATGTGGTTTTTTTTTTCTTTTTACTTTCTAGAAGTCTAGGCAACCGCTTTACTTGTTTGCTTCACATCCTACCTGACATCCCTCCTTTTAATCGTCATTAGGATTCTATTTGGTGTTTCATTAACAATTTTTATATACCATATCAACCACCACCAACTCTACTTATTTATAGGCCTGTTACTTAATTTATCTCGTTGTGTGTTTTAGATGGTCTTTTCTTTCAATAGTCTTTATTTTTATCACAAATTTTAGTTATTTATAAATTTTATTCCTAATTGAAATCTTTTTTTTCTAATTTCAGAATTTATTTTTTCTAAAAAAATTAGTTAATACCATATTGTGTTCTTTTAATGTTTTTATTTCTTATTTTCAACTTTAGTTGTTTCAAAATTGTATTTCTAATTGAACTCTCTTTTAATTTTTCTAATTTTGGATATTATTATATTTTTATTCGAAATTTTAATTAATCTCGTATTGGGTCCTTATATGGATTCTTCTTTCAATATTGCTTATTTTTAATTCCGAATTTCAGCTAATTTTAAATTGTATTCCTACTTGAACTCTTCTTTATTTTCTTTTTCCTTAATTTCGGATTTATTTTTCTTTTTATTCTGAATTTTAATTAATCTCATATTGGGTTCTTATATGGACTGTTTTTTTAATATTCCTTATTTTTAATTCCGAATTTCAGCTATTTTTAAATTGTATTCCTACTTGGACTCATGTTTCCTTTTCTAATTTTGGCTTTTAATTTATTTTTATTTCGAATTTTGATTAATCTCGTATTGGGTTCTTATATGGAAACTTCTTTCAATATTGCTAATTTTTAATTCCGAATTTCAGCTATTTTTAAATTGTATTTCTACTTGGACTCTTCTTTCCTTTTTCTAATTTTGGATTTGATTTTATTTTTATTTTGAATTTTGATAAATCTCGTATTGGGTTCTTATATGAAAACTTCTTTCAATATTGCTTATTTTTAATTCCGAATTTCAGCTATTTTTAGATTGTATTTCTACTTGGACTCTCCTTTTCTTTTTTTTTTCTTTTTCTCCGATTAATGTGAGAATTTCTAGCCCTCACAGCGAACGTGGTGCCTCCTTTCAAAGCTTTTTTAATAATATAATAGATAGATTAATTATCAGGACTTGGCTTGAGCTCCTAAGAAATGAAATTGCTGTTTCTAAATAAGAAGCCACATATCAAACAACACTGAACCATAGAAATTTTACTGCTGTTTTATTACAGTATGCAATAACAATTTTACGTTTGATCGGTTGCACTGTTTTATAGAAAAAAAATGTTAGTCCCAAGTATGTCTCTTTACTCACTTGAAAGTTCATCCATCTAAACAAAGCAATATGTTATCTATGGTAGTATGGCCCATGTTCATGTGACATAACATGTATTATCCTGGTATAGATCAAAATTCATAGTAAATCACCTGATGAGCTTCTATATGGAAGAGCTGGATACCTATGGGCATGCACCTTCCTAAACAAGCACCTTGGAGATAATACTATACCGCCAACCACTACAGTAAGTACACAGTTCAATCTTTAGTGCCTTCATTTGTCATTCTTCCATTCATACTTGTTGGATGATCGCTGGGCACATGCGATGGATGATCATCATCATTCTATTGAACTATTTGTAGGACACTGTCATGAGAGATATTATCAGAGATGGTAGAACACTGTCCACGATAGGCTGCCCATTGATGTATGAATGGTATGGTGAGAAGTATTGGGGTGCTGCTCATGGACTTTCTGGGATCATGCATGTTTTGCTGGACATGGACTTGACTAAAGATGACACGGAATGCGTAAAGGGAACCTTGCGCTACATGATTCAGAACCGGTTCCCTAGTGGTAATTACCCTGTTACTGAGGAGGATAAGCATGATCGATTTGTGCACTGGTGCCATGGGGCTCCTGGCATTTCCCTCACCTTAGCAAAGGCTTCACAGGTTTGTTTTCTATTCTCAGATCATCTCATCTCAACCACCTGCTTTGGCTGCATGTTTCGTTCTGGCAATCTGTTACATTCTGCATATACTATGTCATATCCTTACCAGGTGTTCCCAGAAGAACGATTCCTTGAGGCAATTGCAGAGGCGGCAGAGGTTGTTTGGAATAGAGGGCTGCTCAAAAGAGTTGGAATATGCCATGGAGTAAGTGGGAACGCCTATACATTTCTAGCACTTTTCCGCCTAACGAAAAAGAAGGAACACCTCTACCGTGCTAAAGCTTTCGCTTGCTTTCTCCTTGACCGAGCTAAACAACTGATTGCGGATGGCATCATGCACAGTGGTGATGAGCCGTATTCCTTGTTTGAAGGACAAGTTGGAATGGCTTACCTGTTTCTGGACATGATTAACCCCCTTGATTCTAGGTTTCCAGGTTATGAACTTTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA016808