BGIOSGA016952
| Gene Name |
BGIOSGA016952 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016952, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_17044 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA016952-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA016952-PA |
| Length |
17340 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:27642225..27659564 |
| Sequence Coding Region |
27642225..27642308,27642388..27642513,27642569..27642718,27643249..27643293,27643364..27643627 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:27642225..27659564 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:27642225..27659564 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGGAGCCAAGTCTTGAGGTGAATAATCCTGTGGCTGAGCTGAATGCCATCAAATTCAGCCTCATGACCAGTTCAGATATGGAAAAGTTAAGTAGTGCGACTATTATTGAAATGTGTGATGTGACTAACGCCAAGTTGGGATTACCAAATGGTGCACCACAGTGTGCAACCTGTGGATCGCGAAGCATACGTGACTGTGATGGTAAAAAGAAACTAACTGGTAAACTGTTAGGTCATTTTGGTGTTATTAAGCTAGCAGCAACCGTGCACAATTCATATTTTATCGAGGAAGTTGTCCAGTTGCTAAATCAGATATGTCCTGGCTGTCTCACTCTGAAGCAAAATGGGGACACAAAGAAGGCTGATGGGACAACAATTCAAGGAACTTGCAAGTATTGCTCAAAGGATGGATCAAAACTTTACCCTAGTATAATCTTTAAGATGCTAACAAGTCCAAGAGTAACACTATCCAGGAGTAAACTTCACCGTAACACTAGCGTGATGGACAAAATGTCAATTATTGCAGAAGTTGCTGGCGGGGTGGCACATAAGTCCAAGAACAAGGCTCCCCATGAAACCCTTCCCCAAGATTTCTGGGATTTCATACCTGATGATAACCAGCCACCTATATTCAATGTGACTAAGAAAATATTGTCGCCATATCAAGTCTTTCACATGCTAAAAAAGCTTGATCCTGAACTTATCAATCAGGATGACCGGACAAAAGCTTATAAGAGGATGGTTGATTTATACTCAAAAAAATCAGATGATGAATCTTCTGCATCTACAGATACATATGGAATCAAATGGTTAAAAGATATCATCCTCAGCAAAAGATCCGACAATGCATTTAGGAGTATAATGGTCGGGGACCCAAAAATTAATTTAAATGAAATCGGTATTCCTATGGGTTTAGCTTTGAACTTGGTTGTTTCTGAGCAAGTTAGTTCTTACAATTTCGAAACCATAAATTTGAAGTGCAACTTGCACCTTCTTACCAAGGAAGTACTGCTTGTCCGCCGAAATGGGAATCTTATTTTTGTTCGGAAGGCAAACCAGTTAGAAATTGGTGATATTGCTTATAGACTATTGCAGGATGGTGATCTTGTTTTGGTAAATAGGCCACCTTCAGTTCATCAACATTCTCTGATTGCCCTATCTGCAAAACTTCTGTCAACTCAGTCAGCTGTGTCAATTAATCCACTATGTTGTGATCCTTTCAAGGGAGACTTTGATGGGGACTGTTTGCATGGATATATTCCTCAATGTCTGCAATCAAGAATTGAGCTTGAAGAACTAGTTAGTTTAAGTGGCCAACTCTTGAATCAACAAGATGGGCGAAGTTTGGTGTCATTAACACATGACTCTCTAGCTGCTGCACATCAGTTAACAAATGCAGATGTTTTCTTGGAGAAAGCTGAATTTCAACAGCTTCAGATGTTATCCTCTTCCATCTCATTGACACCAATGCCATCAGTTTTTAAATCTACAAACTCTCAAGGTCCTCTTTGGACTGGTAAGCAACTGTTTGGAATGCTGCTACCTTATGGTATGAATATCAGTTTTGATCAGAAGTTACACATAAAAGACAGTGAAGTGCTTACCTGCTCATCAGGATCTTTTTGGTTACAGAATAACACATCCAGCCTTTTCTCTGTCATGTTCAAAGAGTATGGTTGTAAGGCTCTTGAGTTCCTTTCTTCCACCCAGGATGTACTATGTGAATTCTTAACCATGTGGGGTTTAAGTGTCTCCCTTTCAGATCTCTATCTGTTCTCAGACCATTACTCAAGGAGAAAACTGAGTGAGGAAGTTCATCTGGCATTGGATGAAGCGGAAGAGGCTTTTCAAATCAAGCAAATATTGCTAAATTCAGTATCTATACCAAATCTGAAGTATTATGATGGAGGTGATGATAGATCAAACACTGATGAACAATCTGGTTTTACTCAAGTCAGTCTGCCAATCATCAGATCTTCAATGACATCATTTAAGAGTGTCTTCAATGATCTGTTGAAGATGGTGCAGCAGTATGTGAGTAAAGATAATTCAATGATGACAATGATTAACTCTGGAAGTAAAGGTAGTGTTCTGAAGTTTGTTCAACAGACTGCATGTGTTGGTCTTCAACTACCAGCAAGTAAATTTCCCTTTAGAATTCCCTCACAACTATCATGTGTTTCCTGGAATAGACATAAATCTCTCAATTGTGAAATCACTGACGGCACCAGTGAATGTGTGGGAGGCCAAGACATGTATGCTGTTATTAGAAATTCTTTTCTTGATGGACTAAATCCGTTAGAATGTCTACTGCATGCCATATCTGGCAGGGCAAATTTCTTTAGCGAAAATGCTGACGTTCCTGGGACTTTGACAAGGAAACTAATGTATCACTTGAGAGATACATACGTTGCTTATGATGGGACTGTTAGAAGTTCTTATGGGCAGCAAATAGTGCGGTTTTCTTATGATACTGCTGATGGCATGTACAGTGATCATGATCTTGAAGGTGAACCTGGGGCCCCTGTTGGCTCTTGGGCTGCTTGTTCCATTTCAGAAGCTGCCTATGGAGCTTTGGATCACCCAGTTAACAGTTTAGAGGATTCCCCTCTTATGAACTTGCAGGAAGTTTTGAAGTGCCACAAGGGCACAAATTCTCTGGATCATACTGGTTTGCTTTTCCTGTCAAAGCATCTAAGGAAATATAGATATGGTTTTGAGTATGCATCACTAGAAGTTAAGGATCATCTAGAACGAGTGGACTTTTCTGATATGGTTGACACGGTCATTATTTTATATGGCGGCTCAGATATGCAGAAAACAAAAGGAAATCCTTGGATCACTCATTTTCATTTAAGCCAGGAAACAATGAAGATAAAAAGGTTAGGACTGGAATTTATTGTAAGAGAGATTATTGACCAATACAACACCTTAAGAAAACAGTTGAACAATGCGATCCCTTCAGTTTCTATTTCGAACAGTGAAACTCTTCACTTGAAGATGGAAAATAAATCTGGGAAGCTAGGGAAAAACCTGGGCACGGGCAATGAGTGTGTCAAGAATCAGACCTGTTGCGTCTCTATGGTAGTACAGGTGGAAATTAACTCCATGTCGCAATTGGACGTTATCAAGGAACGGGTGATTCCAAGCATCCTGGCCACACTGTTGAAAGGATTTTTGGAATTTAAGAATGTTAAGGTGCAATGTCAAGAGGATAATGAACTTGTTCTGAAAGTCGGTATGTCTGAGCATTGCAAGAGTGGGAAGTTCTGGGCTACCCTACAAAATGCTTGCATCCCAATAATGGAGTTGATTGATTGGGAGCGGAGCCGACCAGAGAGAGTATATGATAATTTCTGCTCATATGGCATAGACTCAGCATGGAAATTCTTTGTCGAATCTTTAAGATCCACAACAGATGCTATTGGAAGGAATATCCATCGACAGCACTTACTGGTTGTGGCAGACTGCCTATCTAGGCCTGCACACAGTTTTATAAATGCTGCAAAGCGAGATTCAGTGGACAATCTTTCTGGTACTCTAGATGCAATTGCCTGGGGCAAAGAACCTTGTACAGGGTCGTCAGGTCCTTTCAAGATTCTATATTCTGGGAAGTCACATGAGACAAAACAAAATGAGCACATATATGACTTTCTACATAACCCTGAAGTTCAGGCTCTTGAAAAGAATGTAATGGATACCTACAGAAAAAGGACTGAAAAAACTTCCAAGCGGAGATCAGCACTCAATTCTGAAGGCAATGCTACCATCAATGGTGGTGCCATATCTTTTAATCAGAAGTTTCTTAATTCTAAAGTTGGTATATGGGAGAACATCATTGACATGCGCACTTCCTTGCAAAACATGCTTCGGGAGTACACATTAAATGAAGTTGTCACAGAACAAGATAAATCATGCTTAATAGAGGCCTTGAAATTTCATCCCAGAGGGTATGACAAGATTGGTGTGGGAATAAGAGAAATCAAGATCGGAGTGAATCCTGGTCACCCGAGCTCAAGGTGCTTCATTGTACTAAGGAATGATGATACTACTGCAGACTTCTCTTACAACAACCGGTTCCCCTGCCGCTACCTCCACAGCGAACTCCCCGAGGCGCCTCCCGAGCGACTGCGACCAAGCCATAGACCCAGCGCGGCCGCTTGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAACTGCGTGGTGTCCAGTACCCGCGAGAAGCCCTGCAAGTTCTTCCTCTCCGGTGATTGCAGGTACGGCGACGAATGCCGCTGCTACCTCCACGCCGGCTCCATCAACGACGGGTTCTCGCTGCTCACCCCGCTCCGCGGACACCAGAAGGAGCCATTGCTATTTGTTGGAATTCCTGATGCTGTGAAGATCTGGGATACAGGAGCTGAGATGAGCCTAAGTGAGCCAACTGGCGAGTACATGCACTGGCGGTTGGCAATGGGATGCTCTTCGCTGCAATGCAACTATACAAGTCTGGGCTGCTATGGAAAGTTGGAAACTGGAAGCCTGGCAGTAACATATACACATAACGAAGATCATGGTGCACTTGCTCTTGCTGGTATGCAAGATGCACAATTAAACCCTATTCTGCTATGGTCAACGAATTACAACATAGTCCACCTCTATGAGCTCCCATCGTTTGCTGAGAGAGGTAAAATATCCTTTGAAGCGGAAGTTGGAGCAGTGAAAAATGGTCCTGGTGGATTAATATTTACTAGCGATGAAATTGGCAAACTAAAGTTGTGGAAATGGACAGCTGAACGAACTTCTGGAGTCTCAAACTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEEPSLEVNNPVAELNAIKFSLMTSSDMEKLSSATIIEMCDVTNAKLGLPNGAPQCATCGSRSIRDCDGKKKLTGKLLGHFGVIKLAATVHNSYFIEEVVQLLNQICPGCLTLKQNGDTKKADGTTIQGTCKYCSKDGSKLYPSIIFKMLTSPRVTLSRSKLHRNTSVMDKMSIIAEVAGGVAHKSKNKAPHETLPQDFWDFIPDDNQPPIFNVTKKILSPYQVFHMLKKLDPELINQDDRTKAYKRMVDLYSKKSDDESSASTDTYGIKWLKDIILSKRSDNAFRSIMVGDPKINLNEIGIPMGLALNLVVSEQVSSYNFETINLKCNLHLLTKEVLLVRRNGNLIFVRKANQLEIGDIAYRLLQDGDLVLVNRPPSVHQHSLIALSAKLLSTQSAVSINPLCCDPFKGDFDGDCLHGYIPQCLQSRIELEELVSLSGQLLNQQDGRSLVSLTHDSLAAAHQLTNADVFLEKAEFQQLQMLSSSISLTPMPSVFKSTNSQGPLWTGKQLFGMLLPYGMNISFDQKLHIKDSEVLTCSSGSFWLQNNTSSLFSVMFKEYGCKALEFLSSTQDVLCEFLTMWGLSVSLSDLYLFSDHYSRRKLSEEVHLALDEAEEAFQIKQILLNSVSIPNLKYYDGGDDRSNTDEQSGFTQVSLPIIRSSMTSFKSVFNDLLKMVQQYVSKDNSMMTMINSGSKGSVLKFVQQTACVGLQLPASKFPFRIPSQLSCVSWNRHKSLNCEITDGTSECVGGQDMYAVIRNSFLDGLNPLECLLHAISGRANFFSENADVPGTLTRKLMYHLRDTYVAYDGTVRSSYGQQIVRFSYDTADGMYSDHDLEGEPGAPVGSWAACSISEAAYGALDHPVNSLEDSPLMNLQEVLKCHKGTNSLDHTGLLFLSKHLRKYRYGFEYASLEVKDHLERVDFSDMVDTVIILYGGSDMQKTKGNPWITHFHLSQETMKIKRLGLEFIVREIIDQYNTLRKQLNNAIPSVSISNSETLHLKMENKSGKLGKNLGTGNECVKNQTCCVSMVVQVEINSMSQLDVIKERVIPSILATLLKGFLEFKNVKVQCQEDNELVLKVGMSEHCKSGKFWATLQNACIPIMELIDWERSRPERVYDNFCSYGIDSAWKFFVESLRSTTDAIGRNIHRQHLLVVADCLSRPAHSFINAAKRDSVDNLSGTLDAIAWGKEPCTGSSGPFKILYSGKSHETKQNEHIYDFLHNPEVQALEKNVMDTYRKRTEKTSKRRSALNSEGNATINGGAISFNQKFLNSKVGIWENIIDMRTSLQNMLREYTLNEVVTEQDKSCLIEALKFHPRGYDKIGVGIREIKIGVNPGHPSSRCFIVLRNDDTTADFSYNNRFPCRYLHSELPEAPPERLRPSHRPSAAACGGGGGGGGNCVVSSTREKPCKFFLSGDCRYGDECRCYLHAGSINDGFSLLTPLRGHQKEPLLFVGIPDAVKIWDTGAEMSLSEPTGEYMHWRLAMGCSSLQCNYTSLGCYGKLETGSLAVTYTHNEDHGALALAGMQDAQLNPILLWSTNYNIVHLYELPSFAERGKISFEAEVGAVKNGPGGLIFTSDEIGKLKLWKWTAERTSGVSN</aaseq> |
| Gene Sequence |
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