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多物种标准化转录组图谱综合数据库

多物种转录图谱整合数据库

基因表达库（GEN）是一个转录组数据平台，收录了多物种 bulk RNA-seq、单细胞 RNA-seq 和空间 RNA-seq 数据分析获得的不同条件下的转录组表达谱。

343 数据集 8899 个Bulk样本 13097867 个细胞

45 数据集 585 个Bulk样本 2015634 个细胞

16 数据集 472 个Bulk样本 89492 个细胞

11 数据集 248 个Bulk样本 41141 个细胞

8 数据集 67 个Bulk样本 94814 个细胞

8 数据集 73 个Bulk样本 196 个细胞

7 数据集 18 个Bulk样本 3837235 个细胞

6 数据集 86 个Bulk样本

5 数据集 86 个Bulk样本 18403 个细胞

5 数据集 72 个Bulk样本

4 数据集 117 个Bulk样本 42129 个细胞

4 数据集 30 个Bulk样本 149269 个细胞

4 数据集 272 个Bulk样本

3 数据集 360 个Bulk样本 28773 个细胞

3 数据集 20 个Bulk样本 77760 个细胞

3 数据集 21 个Bulk样本 659751 个细胞

2 数据集 54 个Bulk样本

2 数据集 3 个Bulk样本 101551 个细胞

2 数据集 50 个Bulk样本

2 数据集 5 个Bulk样本 130713 个细胞

2 数据集 42 个Bulk样本 100 个细胞

2 数据集 40 个Bulk样本 2520906 个细胞

2 数据集 18 个Bulk样本 62419 个细胞

2 数据集 6 个Bulk样本 55930 个细胞

2 数据集 20 个Bulk样本 11380 个细胞

1 数据集 24 个Bulk样本

1 数据集 1 个Bulk样本

1 数据集 14 个Bulk样本

1 数据集 4 个Bulk样本

1 数据集 22 个Bulk样本

1 数据集 1 个Bulk样本

1 数据集 8 个Bulk样本

1 数据集 18 个Bulk样本

1 数据集 4 个Bulk样本

1 数据集 5 个Bulk样本

1 数据集 29711 个细胞

1 数据集 42153 个细胞

1 数据集 2744 个细胞

1 数据集 1558 个细胞

1 数据集 20268 个细胞

1 数据集 97335 个细胞

1 数据集 27 个Bulk样本

68 数据集 2248 个Bulk样本 27 细胞

16 数据集 499 个Bulk样本

8 数据集 216 个Bulk样本 220188 细胞

5 数据集 462 个Bulk样本

3 数据集 78 个Bulk样本

2 数据集 34 个Bulk样本

2 数据集 480 个Bulk样本

1 数据集 18 个Bulk样本

1 数据集 4 个Bulk样本

1 数据集 8 个Bulk样本

1 数据集 12 个Bulk样本

1 数据集 6 个Bulk样本

1 数据集 18 个Bulk样本

1 数据集 12 个Bulk样本

1 数据集 4 个Bulk样本

1 数据集 4 个Bulk样本

1 数据集 6 个Bulk样本

1 数据集 32 个Bulk样本

1 数据集 12 个Bulk样本

1 数据集 4 个Bulk样本

1 数据集 5 个Bulk样本

1 数据集 30 个Bulk样本

1 数据集 1 个Bulk样本

1 数据集 6 个Bulk样本

1 数据集 7 个Bulk样本

1 数据集 16 个Bulk样本

1 数据集 6 个Bulk样本

1 数据集 12 个Bulk样本

1 数据集 12 个Bulk样本

1 数据集 44 个Bulk样本

1 数据集 14 个Bulk样本

1 数据集 6 个Bulk样本

1 数据集 12 个Bulk样本

1 数据集 12 个Bulk样本

1 数据集 2 个Bulk样本

1 数据集 6 个Bulk样本

1 数据集 6 个Bulk样本

1 数据集 9 个Bulk样本

1 数据集 16 个Bulk样本

1 数据集 12 个Bulk样本

1 数据集 7 个Bulk样本

1 数据集 12 个Bulk样本

1 数据集 6 个Bulk样本

1 数据集 9 个Bulk样本

1 数据集 6 个Bulk样本

1 数据集 4 个Bulk样本

1 数据集 6 个Bulk样本

1 数据集 6 个Bulk样本

1 数据集 6 个Bulk样本

1 数据集 6 个Bulk样本

2 数据集 12 个Bulk样本 6637 细胞

Dictyostelium discoideum
-

2 数据集 8 个Bulk样本 4988 细胞

Plasmodium falciparum
Malaria parasite

2 数据集 28 个Bulk样本 180 细胞

Chlamydomonas reinhardtii
-

1 数据集 5 个Bulk样本

Chlorella variabilis
-

1 数据集 6 个Bulk样本

Chlorella vulgaris
-

1 数据集 6 个Bulk样本

Cyanidioschyzon merolae
-

1 数据集 8 个Bulk样本

Volvox carteri
-

1 数据集 4 个Bulk样本

Gene Expression Nebulas (GEN): a comprehensive data portal integrating transcriptomic profiles across multiple species at both bulk and single-cell levels. Nucleic Acids Res, 2022, 50(D1):D1016-D1024.

Plant Editosome Database

Rice Expression Database

CROST

Cancer Single-cell Expression Map

Gene Expression Omnibus

Expression Atlas

GTEx

GeneCards

Disease Ontology

REDIportal

请按如下方式引用登录号 GENA000001（建议将以下段落写入论文的材料与方法部分）：

本文报道的批量、单细胞和空间转录组数据已提交至国家基因组科学数据中心（National Genomics Data Center，中国科学院北京基因组研究所/中国国家生物信息中心）的基因表达星云数据库（Gene Expression Nebulas, GEN），登录号为 GENA000001，可通过 https://ngdc.cncb.ac.cn/gen 公开获取。

GEN仅供学术使用。任何商业用途，请联系我们获取商业许可条款。