| Editing Factor: | CREF7 |
| Synonym: | CHLOROPLAST RNA EDITING FACTOR 7 |
| Description: | Encodes a pentatricopeptide repeat protein involved in chloroplast mRNA editing. |
| Protein Family: | PPR |
| Subclass: | DYW |
| Construct Structure: | PLS-DYW |
| Gene ID & Species: | AT5G66520 (Arabidopsis thaliana) |
| Edited Gene(s): | ndhB rpoA |
| Editing Type(s): | C-to-U (15) |
| Publication(s): |
[1] The Analysis of the Editing Defects in the dyw2 Mutant Provides New Clues for the Prediction of RNA Targets of Arabidopsis E+-Class PPR Proteins, Plants (Basel), 2020. [PMID=32098170] [2] Multiple PPR Protein Interactions Are Involved in the RNA Editing System in Arabidopsis Mitochondria and Plastids, Proc Natl Acad Sci U S A, 2017. [PMID=28761003] [3] A Conserved Glutamate Residue in the C-terminal Deaminase Domain of Pentatricopeptide Repeat Proteins Is Required for RNA Editing Activity, The Journal of Biological Chemistry, 2015. [PMID=25739442] [4] Pentatricopeptide repeat proteins involved in plant organellar RNA editing, RNA Biol, 2013. [PMID=23669716] |
| Species | Gene ID | Organelle | Edited Gene | Position | Region | Editing Type | Codon | Amino Acid | Molecular Effect | Experiment Details | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Arabidopsis thaliana | AT5G66520 | Chloroplast Plastid |
ndhB | 1255 | CDS | C-to-U | CAU=>UAU NA=>NA |
H=>Y NA=>NA |
Recoding NA |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Arabidopsis thaliana | AT5G66520 | Chloroplast | ndhB | 95225 | NA | C-to-U | NA=>NA | NA=>NA | NA |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Arabidopsis thaliana | AT5G66520 | Chloroplast | rpoA | 200 | CDS | C-to-U | UCU=>UUU | S=>F | Recoding |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||