| Editing Factor: | REME2 |
| Synonym: | REQUIRED FOR EFFICIENCY OF MITOCHONDRIAL EDITING 2 |
| Description: | Encoding a PPR-DYW protein required for editing of specific C targets in Arabidopsis mitochondria. |
| Protein Family: | PPR |
| Subclass: | DYW |
| Construct Structure: | PLS-E-DYW |
| Gene ID & Species: | AT4G15720 (Arabidopsis thaliana) |
| Edited Gene(s): | rps3 rps4 |
| Editing Type(s): | C-to-U (20) |
| Publication(s): |
[1] The Analysis of the Editing Defects in the Mutant Provides New Clues for the Prediction of RNA Targets of Arabidopsis E+-Class PPR Proteins., Plants (Basel, Switzerland), 2020. [PMID=32098170] [2] Multiple PPR protein interactions are involved in the RNA editing system in mitochondria and plastids., Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2017. [PMID=28761003] [3] Quantitative trait locus mapping identifies REME2, a PPR-DYW protein required for editing of specific C targets in Arabidopsis mitochondria., RNA biology, 2013. [PMID=23807026] |
| Species | Gene ID | Organelle | Edited Gene | Position | Region | Editing Type | Codon | Amino Acid | Molecular Effect | Experiment Details | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Arabidopsis thaliana | AT4G15720 | Mitochondrion | rps3 | 1534 | CDS | C-to-U | CGU=>UGU NA=>NA |
R=>C NA=>NA |
Recoding NA |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Arabidopsis thaliana | AT4G15720 | Mitochondrion | rps4 | 175 | CDS | C-to-U | CCG=>UCG NA=>NA |
P=>S NA=>NA |
Recoding NA |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||