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元信息/特征注释/序列更新帮助文档

1、标识词含义
修改核酸序列标识词含义
not_changed无更新
update_meta元信息更新
update_seq序列更新
修改蛋白质序列标识词含义
not_changed无更新
update_meta元信息更新
update_seq序列更新
new新增蛋白质序列
delete删除蛋白质序列
2、填写须知
1) 更新时需要上传*_result_assign.txt文件,*_result_assign.txt文件已经在数据审核成功后发送至您的数据提交者邮箱。
2) 更新元信息(例如提交者信息,出版信息,测序技术信息,物种信息,元信息文件),更改基因名、产物名等,即序列本身没有发生变化,均属于“update_meta”。
3) 核酸序列必须是原有序列,不能新增也不能删除,例如从10条序列新增为11条,不能通过此方式修改,应将新增序列以新的批次进行提交。删除则需邮件联系我们(genbase@big.ac.cn)。
4) 未更新的核酸序列,在原始上传的序列文件中,仍使用原来的SeqId号,并且在Accession.Index文件中标注not_changed。
5) 如果既修改了元数据信息,又修改了序列,请使用update_seq进行更新。
6) 蛋白质序列一旦标delete,相当于suppress,即原先的数据通过Accession编号仍可查找的到。
3、填写示例
请按照如下要求修改以result_assign为结尾的文件。
原始文件:
情况1:更新source modifier信息
以result_assign为结尾的文件修改示例1:
情况2:更新feature文件中除坐标和完整度以外的特征信息
序列内容、长度、链类型不做任何修改。例如更改了蛋白质产物的名称、基因名称等。
以result_assign为结尾的文件修改示例2:
情况3:更新/删除氨基酸序列注释信息,核酸序列不变
以result_assign为结尾的文件修改示例3:
情况4:更新/删除氨基酸序列注释信息,且核酸序列改变
以result_assign为结尾的文件修改示例4:
情况5:增加新的序列注释信息,核酸序列未变
以result_assign为结尾的文件修改示例5:
情况6:同时更新source modifier信息及特征信息
以result_assign为结尾的文件修改示例6:
4、更新流程
1. 准备上述result_assign文件。
2. 进入GenBase系统,点击modify按钮进入修改。
3. 根据情况逐次修改序列,元信息,特征注释等文件,每操作一步点击“保存&下一步”,不要从上方跳过步骤直接到最后一项。
4. 在最后一步预览页面的第三步点击Browse并上传修改后的result_assign文件。