生物数据递交系统 (
BIG Sub)
是国家基因组科学数据中心生物数据统一汇交入口,为用户提供一站式数据递交服务。 您可以使用这项服务提交原始组学序列、基因组组装、核苷酸序列、目标基因组装和注释序列,和登记项目和样本元信息。GenBase数据库存储包括核酸、蛋白序列及其注释信息。点击 这里 查阅GenBase提交系统使用指南。GenBase仅供学术使用。任何商业用途,请联系我们获取商业许可条款。
图1. BIG Sub创建账户页面
图2. 从BIG Sub中进入GenBase提交系统
图3. 从GenBase数据库进入GenBase提交系统
点击相应按钮创建新的提交。常规序列提交:通用提交方式;SARS-CoV-2快速提交:针对新冠病毒基因组序列提交;受控序列提交:针对人类数据提交,用于人类遗传资源管理。
图6. 创建新的提交
此页面用于收集提交者信息。当您注册BIG Sub后,系统会自动填写您的姓名、组织机构、地址和电子邮件信息。如果有信息需要调整,您也可以在这里直接修改。
注意: 如果在数据审核和发布过程中出现任何问题,信息将反馈到您的注册电子邮件,而不是此处输入的提交者电子邮件地址。
图7. 填写提交者信息
此页面用于收集您(计划)发布序列相关的参考文献信息。
图8. 填写出版信息
如果您提交的序列超过500个,或者您的序列是使用下一代测序技术生成的,请您选择并填写正确的信息。填写完成后,您可以单击“保存并下一步”按钮。
图9. 填写测序技术信息
此页面用于收集您在上面准备的FASTA格式的序列及相关信息。
图10. 填写核酸序列信息
选择序列对应的集合或批次信息。
图11. 选择集合/批次信息
图12. 确定类别
图13. 上传元信息(Source Modifiers)文件
图14. 上传特征注释文件
图15. 预览提交结果
通过输入基因名称或accession编号来搜索核酸或蛋白质序列,例如:
通过输入一个或多个搜索项来搜索核酸或蛋白质序列,例如物种名称和/或特定分子类型:
1) 根据搜索结果下载单个核酸或蛋白质序列
2) 根据搜索结果下载多个核酸或蛋白质序列
3) 通过rest api下载序列 https://ngdc.cncb.ac.cn/genbase/api/file/fasta
例如: https://ngdc.cncb.ac.cn/genbase/api/file/fasta?acc=C_AA004835.1
名称 | 类型 | 描述 | 示例 |
acc | string | Accession | C_AA004835.1 |