基因组序列
语言 / Language
| 病毒株名 | SARS-CoV-2/human/CHN/LNCDC-072-1/2023 |
| 序列号 | C_AA002537.1 |
| 宿主 | Homo sapiens |
| 数据来源 | GenBase |
| 采样日期 | 2023-03-13 |
| 采样地点 | China / Liaoning |
| 相关ID | EPI_ISL_17495358 |
| 谱系 | BA.5.2.1 (Version: PUSHER-v1.18.1.1) |
| 序列完整度 | Complete |
| 质量评估 | 0/0/5/95/Yes |
| 样本提供单位 | |
| 数据递交单位 | Liaoning Center for Disease Control and Prevention |
| 发布时间 | 2023-04-04 12:16:01 |
| 参考序列 | 2019-nCoV (MN908947.3) |
| 病毒株名 | SARS-CoV-2/human/CHN/LNCDC-072-1/2023 (C_AA002537.1) |
| SNP数目 | 90 |
| Insertion数目 | 0 |
| Deletion数目 | 7 |
| Indel数目 | 0 |
| 相似度 | 99.67 |
| 质量评估分级 | C |
| 注释统计 | 97(downstream_gene_variant:2; synonymous_variant:24; intergenic_variant:2; missense_variant:62; upstream_gene_variant:3; inframe_deletion:4) |
| 文件下载 (GFF3) |
| 变异位点 | 参考碱基 | 碱基变化 | 基因位置密码子 | 蛋白质氨基酸变化 |
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