首页
基因组序列
2019新型冠状病毒序列
冠状病毒序列
基因组数据提交
FTP下载
原始序列
基因组变异
基因组变异可视化
变异数据统计
变异注释
变异时空变化
系统演化树
病毒基因组单倍型网络
在线工具
基因组溯源
基因组组装
变异鉴定
变异注释
基因组注释
BLAST比对
SeqQC
智能诊断
文献情报
关于
2019新型冠状病毒信息库
如何引用
数据来源
联系我们
联系我们
语言 / Language
English
简体中文
首页
基因组序列
2019新型冠状病毒序列
冠状病毒序列
基因组数据提交
FTP下载
原始序列
监控预警
基因组变异
谱系浏览
基因组变异可视化
变异数据统计
变异注释
变异时空变化
系统演化树
病毒基因组单倍型网络
临床信息
在线工具
基因组溯源
基因组组装
变异鉴定
变异注释
基因组注释
BLAST比对
SeqQC
单体型分析
进化树
谱系和进化分析
智能诊断
文献情报
关于
2019新型冠状病毒信息库
如何引用
数据来源
联系我们
语言 / Language
English
简体中文
在线工具
首页
在线工具
BLAST比对
BLASTN
结果示例
病毒DNA比对工具。可以粘贴序列文本或者上传序列文件(文件后缀.fa或.fasta或.tar.gz)。
输入查询序列
查询序列或上传查询序列文件
或者选择本地序列文件
工具类型
Mega BLAST
BLASTN
Discontiguous Mega BLAST
序列方向
both
minus
plus
选择数据库
选择数据库
SARS-CoV-2 参照基因组(NC_045512.2)
SARS-CoV-2 新冠病毒基因组数据库
SARS-CoV-2 新冠病毒PANGO谱系参考基因组数据库(谱系版本 2022-04-09 )
Coronaviridae 冠状病毒基因组数据库(包含alpha/beta/delta/gamma属)
参数设置
最大目标序列数 (Max target sequences)
5
10
50
100
250
500
1000
5000
10000
期望值 (Expect threshold)
字长 (Word size)
16
20
24
28
32
48
64
128
256
最大HSP数 (Max HSPs)
Please select
1
5
10
100
1000
一致性比例 (Percent identity)
结果通知邮箱
邮箱
运行