2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/France/ARA-HCL021029932001/2021
序列号	EPI_ISL_1265527
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2021-02-02
采样地点	France / Auvergne-Rhone-Alpes / Lyon
相关ID
谱系	B.1.1.7 (Version: 4.0.6)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/4/42/Yes
样本提供单位	BIOMNIS LYON
数据递交单位	CNR Virus des Infections Respiratoires - France SUD
发布时间	2021-08-11 21:34:43

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/France/ARA-HCL021029932001/2021 (EPI_ISL_1265527)
SNP数目	38
Insertion数目	0
Deletion数目	6
Indel数目	0
相似度	99.85
质量评估分级	C
注释统计	44(synonymous_variant:9; intergenic_variant:2; missense_variant:27; upstream_gene_variant:2; stop_gained:1; inframe_deletion:3)
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