2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/Japan/PG-21284/2021
序列号	EPI_ISL_1434573
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2021-01-23
采样地点	Japan
相关ID
谱系	B.1.1.214 (Version: 4.0.6)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/0/20/Yes
样本提供单位	Ibaraki Prefectural Institute of Public Health
数据递交单位	Ibaraki Prefectural Institute of Public Health
发布时间	2021-04-13 12:36:01

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/Japan/PG-21284/2021 (EPI_ISL_1434573)
SNP数目	20
Insertion数目	0
Deletion数目	2
Indel数目	0
相似度	99.93
质量评估分级	C
注释统计	22(synonymous_variant:6; intergenic_variant:2; missense_variant:12; upstream_gene_variant:1; stop_gained:1)
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