2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/France/ARA-700000225262/2021
序列号	EPI_ISL_1483787
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2021-03-28
采样地点	France / Auvergne-Rhone-Alpes / Clermont ferrand
相关ID
谱系	B.1.1.7 (Version: 4.0.6)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/4/38/Yes
样本提供单位	Centre Hospitalier Universitaire Clermont-Ferrand
数据递交单位	CHU Clermont-Ferrand, service de virologie
发布时间	2021-04-13 12:30:22

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/France/ARA-700000225262/2021 (EPI_ISL_1483787)
SNP数目	34
Insertion数目	0
Deletion数目	6
Indel数目	0
相似度	99.87
质量评估分级	C
注释统计	40(downstream_gene_variant:1; synonymous_variant:9; intergenic_variant:2; missense_variant:21; upstream_gene_variant:2; stop_gained:2; inframe_deletion:3)
文件下载 (GFF3)