2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/India/WB-1931503364304/2022
序列号	EPI_ISL_16182891
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2022-10-14
采样地点	India / West Bengal / Kolkata
相关ID
谱系	XBB.2.7 (Version: PUSHER-v1.17)
序列完整度	Complete
质量评估	10/0/5/94/Yes
样本提供单位
数据递交单位
发布时间	2022-12-26 08:49:38

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/India/WB-1931503364304/2022 (EPI_ISL_16182891)
SNP数目	89
Insertion数目	0
Deletion数目	7
Indel数目	0
相似度	99.68
质量评估分级	C
注释统计	96(downstream_gene_variant:2; synonymous_variant:21; intergenic_variant:2; missense_variant:65; upstream_gene_variant:2; inframe_deletion:4)
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