EPI_ISL_1740277

基因组信息

病毒株名 hCoV-19/Canada/ON-SC4875/2021
序列号 EPI_ISL_1740277
宿主 Homo sapiens
数据来源 GISAID
采样日期 2021-01-19
采样地点 Canada / Ontario
相关ID
谱系 B.1.36.31 (Version: 4.0.6)
序列完整度 Complete
质量评估 0/0/0/25/NO
样本提供单位 Ontario's COVID-19 Genomics Rapid Response Coalition
数据递交单位 McMaster University
发布时间 2021-04-30 21:55:36

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 hCoV-19/Canada/ON-SC4875/2021 (EPI_ISL_1740277)
SNP数目 25
Insertion数目 0
Deletion数目 2
Indel数目 0
相似度 99.91
质量评估分级 C
注释统计 27(synonymous_variant:12; intergenic_variant:2; missense_variant:12; upstream_gene_variant:1)
文件下载 (GFF3)
The variation information in this file was calculated based on sequence EPI_ISL_1740277.The original sequence can be obtained from GISAID's website.