2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/USA/CA-HLX-STM-4DF6HDE7Z/2023
序列号	EPI_ISL_18328665
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2023-09-11
采样地点	United States / California
相关ID
谱系	XCH (Version: PUSHER-v1.22)
序列完整度	Complete
质量评估	1/0/5/112/Yes
样本提供单位
数据递交单位
发布时间	2023-10-15 00:04:00

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/USA/CA-HLX-STM-4DF6HDE7Z/2023 (EPI_ISL_18328665)
SNP数目	107
Insertion数目	0
Deletion数目	7
Indel数目	0
相似度	99.62
质量评估分级	C
注释统计	114(downstream_gene_variant:2; synonymous_variant:28; intergenic_variant:3; missense_variant:74; upstream_gene_variant:2; stop_gained:1; inframe_deletion:4)
文件下载 (GFF3)