2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/Indonesia/JK-BIOKES-W00188/2024
序列号	EPI_ISL_18809513
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2024-01-06
采样地点	Indonesia / Jakarta / Jakarta Utara
相关ID
谱系	XDQ.3 (Version: PUSHER-v1.23.1)
序列完整度	Complete
质量评估	1/0/7/119/Yes
样本提供单位
数据递交单位
发布时间	2024-01-26 08:20:53

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/Indonesia/JK-BIOKES-W00188/2024 (EPI_ISL_18809513)
SNP数目	112
Insertion数目	0
Deletion数目	9
Indel数目	0
相似度	99.59
质量评估分级	C
注释统计	121(downstream_gene_variant:1; synonymous_variant:28; intergenic_variant:2; missense_variant:80; upstream_gene_variant:2; stop_gained:1; inframe_deletion:7)
文件下载 (GFF3)