EPI_ISL_1912836

基因组信息

病毒株名 hCoV-19/USA/NJ-NYGC-S-RM-3890-DATR889/2021
序列号 EPI_ISL_1912836
宿主 Homo sapiens
数据来源 GISAID
采样日期 2021-01-25
采样地点 United States / New Jersey
相关ID PV001799.1
谱系 B.1.2 (Version: 4.0.6)
序列完整度 Complete
质量评估 0/0/0/18/Yes
样本提供单位
数据递交单位
发布时间 2021-05-08 12:10:08

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 hCoV-19/USA/NJ-NYGC-S-RM-3890-DATR889/2021 (EPI_ISL_1912836)
SNP数目 18
Insertion数目 0
Deletion数目 2
Indel数目 0
相似度 99.93
质量评估分级 C
注释统计 20(synonymous_variant:2; intergenic_variant:2; missense_variant:15; upstream_gene_variant:1)
文件下载 (GFF3)
The variation information in this file was calculated based on sequence EPI_ISL_1912836.The original sequence can be obtained from GISAID's website.