EPI_ISL_19508726

基因组信息

病毒株名 hCoV-19/Australia/VIC-VIDRL-00015236/2024
序列号 EPI_ISL_19508726
宿主 Homo sapiens
数据来源 GISAID
采样日期 2024-10-09
采样地点 Australia / Victoria
相关ID
谱系 KP.3.1.1 (Version: 4.2)
序列完整度 Complete
质量评估 0/0/10/143/Yes
样本提供单位
数据递交单位
发布时间 2024-11-02 05:31:00

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 hCoV-19/Australia/VIC-VIDRL-00015236/2024 (EPI_ISL_19508726)
SNP数目 133
Insertion数目 1
Deletion数目 11
Indel数目 0
相似度 99.51
质量评估分级 C
注释统计 145(downstream_gene_variant:3; synonymous_variant:33; intergenic_variant:2; missense_variant:96; upstream_gene_variant:2; inframe_insertion:1; inframe_deletion:8)
文件下载 (GFF3)
The variation information in this file was calculated based on sequence EPI_ISL_19508726.The original sequence can be obtained from GISAID's website.