EPI_ISL_20014719

基因组信息

病毒株名 hCoV-19/Canada/ON-HSC-23-97075-v1/2023
序列号 EPI_ISL_20014719
宿主 Homo sapiens
数据来源 GISAID
采样日期 2023-05-29
采样地点 Canada / Ontario
相关ID
谱系 XBB.1.16 (Version: PUSHER-v1.23.1)
序列完整度 Complete
质量评估 0/0/4/110/Yes
样本提供单位
数据递交单位
发布时间 2025-06-30 23:17:03

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 hCoV-19/Canada/ON-HSC-23-97075-v1/2023 (EPI_ISL_20014719)
SNP数目 106
Insertion数目 0
Deletion数目 6
Indel数目 0
相似度 99.62
质量评估分级 C
注释统计 112(downstream_gene_variant:2; synonymous_variant:31; intergenic_variant:1; missense_variant:71; upstream_gene_variant:2; stop_gained:1; inframe_deletion:4)
文件下载 (GFF3)
The variation information in this file was calculated based on sequence EPI_ISL_20014719.The original sequence can be obtained from GISAID's website.