2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/USA/NY-NYULH-23040/2025
序列号	EPI_ISL_20048957
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2025-06-06
采样地点	United States / New York / New York City
相关ID
谱系	JN.1.13.1 (Version: 4.2)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/9/158/Yes
样本提供单位
数据递交单位
发布时间	2025-06-30 23:16:29

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/USA/NY-NYULH-23040/2025 (EPI_ISL_20048957)
SNP数目	149
Insertion数目	0
Deletion数目	10
Indel数目	1
相似度	99.46
质量评估分级	C
注释统计	160(intergenic_variant:2; inframe_insertion:1; synonymous_variant:32; downstream_gene_variant:3; missense_variant:111; upstream_gene_variant:3; stop_gained:1; inframe_deletion:7)
文件下载 (GFF3)