EPI_ISL_20237995

基因组信息

病毒株名 hCoV-19/Japan/EIS13-888/2025
序列号 EPI_ISL_20237995
宿主 Homo sapiens
数据来源 GISAID
采样日期 2025-10-02
采样地点 Japan
相关ID
谱系 BA.2 (Version: PUSHER-v1.23.1)
序列完整度 Complete
质量评估 0/2/9/154/Yes
样本提供单位
数据递交单位
发布时间 2025-11-17 12:13:18

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 hCoV-19/Japan/EIS13-888/2025 (EPI_ISL_20237995)
SNP数目 145
Insertion数目 1
Deletion数目 10
Indel数目 0
相似度 99.48
质量评估分级 C
注释统计 156(intergenic_variant:2; inframe_insertion:1; synonymous_variant:41; downstream_gene_variant:3; missense_variant:98; coding_sequence_variant:2; upstream_gene_variant:2; inframe_deletion:7)
文件下载 (GFF3)
The variation information in this file was calculated based on sequence EPI_ISL_20237995.The original sequence can be obtained from GISAID's website.