2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/Germany/HH-RKI-I-175436/2021
序列号	EPI_ISL_2632160
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2021-05-31
采样地点	Germany / Hamburg
相关ID	OU324410.1
谱系	B.1.1.7 (Version: 4.0.6)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/3/40/Yes
样本提供单位	Labor Dr. Heidrich & Kollegen MVZ GmbH Hamburg
数据递交单位	Robert Koch Institute
发布时间	2021-06-24 18:49:42

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/Germany/HH-RKI-I-175436/2021 (EPI_ISL_2632160)
SNP数目	37
Insertion数目	0
Deletion数目	5
Indel数目	0
相似度	99.86
质量评估分级	C
注释统计	42(synonymous_variant:9; intergenic_variant:4; missense_variant:23; upstream_gene_variant:1; stop_gained:2; inframe_deletion:3)
文件下载 (GFF3)