EPI_ISL_2672690

基因组信息

病毒株名 hCoV-19/Netherlands/GE-RIVM-39959/2021
序列号 EPI_ISL_2672690
宿主 Homo sapiens
数据来源 GISAID
采样日期 2021-06-07
采样地点 Netherlands / Gelderland
相关ID
谱系 Q.7 (Version: 4.0.6)
序列完整度 Complete
质量评估 0/0/4/43/Yes
样本提供单位 Dutch COVID-19 response team
数据递交单位 National Institute for Public Health and the Environment (RIVM)
发布时间 2021-06-26 18:50:32

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 hCoV-19/Netherlands/GE-RIVM-39959/2021 (EPI_ISL_2672690)
SNP数目 39
Insertion数目 0
Deletion数目 6
Indel数目 0
相似度 99.85
质量评估分级 C
注释统计 45(downstream_gene_variant:1; synonymous_variant:13; intergenic_variant:2; missense_variant:22; upstream_gene_variant:2; stop_gained:2; inframe_deletion:3)
文件下载 (GFF3)
The variation information in this file was calculated based on sequence EPI_ISL_2672690.The original sequence can be obtained from GISAID's website.