2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/England/ALDP-1BD6F9F/2021
序列号	EPI_ISL_3638886
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2021-08-15
采样地点	United Kingdom / England
相关ID	OU589470.1
谱系	AY.4 (Version: 4.0.6)
序列完整度	Complete
质量评估	0/1/3/43/NO
样本提供单位	Lighthouse Lab in Alderley Park
数据递交单位	Wellcome Sanger Institute for the COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium
发布时间	2021-09-03 02:39:47

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/England/ALDP-1BD6F9F/2021 (EPI_ISL_3638886)
SNP数目	40
Insertion数目	0
Deletion数目	5
Indel数目	0
相似度	99.85
质量评估分级	C
注释统计	45(downstream_gene_variant:1; synonymous_variant:5; intergenic_variant:2; missense_variant:30; upstream_gene_variant:4; coding_sequence_variant:1; inframe_deletion:2)
文件下载 (GFF3)