2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/USA/NY-NYGC-4021-VTM3-IDWV192/2021
序列号	EPI_ISL_5365756
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2021-09-24
采样地点	United States / New York
相关ID	PQ967158.1
谱系	B.1.617.2 (Version: 4.0.6)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/3/49/NO
样本提供单位
数据递交单位
发布时间	2021-10-23 03:39:35

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/USA/NY-NYGC-4021-VTM3-IDWV192/2021 (EPI_ISL_5365756)
SNP数目	46
Insertion数目	0
Deletion数目	5
Indel数目	0
相似度	99.83
质量评估分级	C
注释统计	51(downstream_gene_variant:1; synonymous_variant:9; intergenic_variant:2; missense_variant:32; upstream_gene_variant:4; stop_gained:1; inframe_deletion:2)
文件下载 (GFF3)