2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/Denmark/DCGC-5197/2020
序列号	EPI_ISL_621735
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2020-09-21
采样地点	Denmark / Syddanmark
相关ID
谱系	B.1.221.3 (Version: 4.0.6)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/0/17/NO
样本提供单位	Department of Virus and Microbiological Special Diagnostics, Statens Serum Institut, Denmark
数据递交单位	Albertsen lab, Department of Chemistry and Bioscience, Aalborg University, Denmark
发布时间	2020-11-07 15:54:00

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/Denmark/DCGC-5197/2020 (EPI_ISL_621735)
SNP数目	17
Insertion数目	0
Deletion数目	2
Indel数目	0
相似度	99.94
质量评估分级	C
注释统计	19(synonymous_variant:6; intergenic_variant:2; missense_variant:10; upstream_gene_variant:1)
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