2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/France/OCC-SC574/2020
序列号	EPI_ISL_645215
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2020-06-05
采样地点	France / Occitanie / Nîmes
相关ID
谱系	B.1.529 (Version: 4.0.6)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/0/12/NO
样本提供单位	CHU Nîmes
数据递交单位	CNR Virus des Infections Respiratoires - France SUD
发布时间	2020-11-21 21:37:38

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/France/OCC-SC574/2020 (EPI_ISL_645215)
SNP数目	12
Insertion数目	0
Deletion数目	2
Indel数目	0
相似度	99.95
质量评估分级	A
注释统计	14(downstream_gene_variant:1; synonymous_variant:4; intergenic_variant:3; missense_variant:5; upstream_gene_variant:1)
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