EPI_ISL_684351

基因组信息

病毒株名 hCoV-19/Japan/PG-0741/2020
序列号 EPI_ISL_684351
宿主 Homo sapiens
数据来源 GISAID
采样日期 2020-04
采样地点 Japan / Ishikawa
相关ID
谱系 B.1.1 (Version: 4.0.6)
序列完整度 Complete
质量评估 0/0/0/9/Yes
样本提供单位
数据递交单位
发布时间 2022-06-04 08:57:34

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 hCoV-19/Japan/PG-0741/2020 (EPI_ISL_684351)
SNP数目 9
Insertion数目 0
Deletion数目 2
Indel数目 0
相似度 99.96
质量评估分级 B2
注释统计 11(downstream_gene_variant:1; synonymous_variant:4; intergenic_variant:1; missense_variant:4; upstream_gene_variant:1)
文件下载 (GFF3)
The variation information in this file was calculated based on sequence EPI_ISL_684351.The original sequence can be obtained from GISAID's website.