EPI_ISL_902368

基因组信息

病毒株名 hCoV-19/Japan/PG-9656/2020
序列号 EPI_ISL_902368
宿主 Homo sapiens
数据来源 GISAID
采样日期 2020-08-30
采样地点 Japan / Hokkaido
相关ID
谱系 B.1.1.284 (Version: 4.0.6)
序列完整度 Complete
质量评估 0/0/0/20/Yes
样本提供单位
数据递交单位
发布时间 2022-06-04 08:57:28

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 hCoV-19/Japan/PG-9656/2020 (EPI_ISL_902368)
SNP数目 20
Insertion数目 0
Deletion数目 2
Indel数目 0
相似度 99.93
质量评估分级 C
注释统计 22(downstream_gene_variant:1; synonymous_variant:7; intergenic_variant:2; missense_variant:11; upstream_gene_variant:1)
文件下载 (GFF3)
The variation information in this file was calculated based on sequence EPI_ISL_902368.The original sequence can be obtained from GISAID's website.