2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	SARS-CoV-2/human/USA/MN-CDC-IBX738168034198/2021
序列号	MZ055273.1
宿主	Homo sapiens
数据来源	GenBank
采样日期	2021-04-06
采样地点	United States / Minnesota
相关ID	EPI_ISL_1796033
谱系	B.1.1.7 (Version: 2022-01-05)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/4/42/Yes
样本提供单位
数据递交单位
发布时间	2021-05-01 17:38:24

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	SARS-CoV-2/human/USA/MN-CDC-IBX738168034198/2021 (MZ055273.1)
SNP数目	38
Insertion数目	0
Deletion数目	6
Indel数目	0
相似度	99.85
质量评估分级	C
注释统计	44(synonymous_variant:10; intergenic_variant:2; missense_variant:25; upstream_gene_variant:2; stop_gained:2; inframe_deletion:3)
文件下载 (GFF3)