2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/Guangdong/2020XN4243-P0035/2020
序列号	NMDC60013020-01
宿主	Homo sapiens
数据来源	NMDC
采样日期	2020-01-30
采样地点	China / Guangdong
相关ID	EPI_ISL_413853
谱系	A (Version: 4.0.6)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/0/4/NO
样本提供单位	Guangdong Provincial Institution of Public Health
数据递交单位	Guangdong Provincial Institution of Public Health
发布时间	2020-03-11 08:44:37

临床信息

年龄
性别
职业
发作日期	2020-01-25
入院日期
旅行史/接触史	hubei
严重程度	severe
病患状态
临床症状及潜伏天数
临床检测
基础病史
其他病原菌感染
合并症
临床用药和处理
生理生化指标追踪
出院日期
相关文献	Genomic Epidemiology of SARS-CoV-2 in Guangdong Province, China. [PMID: 32359424]

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/Guangdong/2020XN4243-P0035/2020 (NMDC60013020-01)
SNP数目	4
Insertion数目	0
Deletion数目	0
Indel数目	0
相似度	99.99
质量评估分级	A
注释统计	4(downstream_gene_variant:1; synonymous_variant:1; missense_variant:2)
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