NMDC60013021-01

基因组信息

病毒株名 hCoV-19/Guangdong/2020XN4475-P0042/2020
序列号 NMDC60013021-01
宿主 Homo sapiens
数据来源 NMDC
采样日期 2020-01-30
采样地点 China / Guangdong
相关ID EPI_ISL_413854
谱系 B (Version: 4.0.6)
序列完整度 Complete
质量评估 0/0/0/3/NO
样本提供单位 Guangdong Provincial Institution of Public Health
数据递交单位 Guangdong Provincial Institution of Public Health
发布时间 2020-03-11 08:44:37

临床信息

年龄
性别
职业
发作日期 2020-01-29
入院日期
旅行史/接触史 hubei
严重程度 moderate
病患状态
临床症状及潜伏天数
临床检测
基础病史
其他病原菌感染
合并症
临床用药和处理
生理生化指标追踪
出院日期
相关文献 Genomic Epidemiology of SARS-CoV-2 in Guangdong Province, China. [PMID: 32359424]

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 hCoV-19/Guangdong/2020XN4475-P0042/2020 (NMDC60013021-01)
SNP数目 3
Insertion数目 0
Deletion数目 0
Indel数目 0
相似度 99.99
质量评估分级 A
注释统计 3(synonymous_variant:1; missense_variant:2)
文件下载 (GFF3)
The variation information in this file was calculated based on sequence NMDC60013021-01.The original sequence can be obtained from GISAID's website.