进化树         结果示例

功能描述

使用最大似然法构建系统发育树。该工具可将用户提交的序列使用IQ-TREE或RAxML构建系统发育树。
默认工作流程为:① 输入序列:新冠病毒基因组序列;② 修剪方法:以新冠参考病毒基因组为基准去除5’和3’ UTR区域(refseq);③ 替代模型:IQ-TREE使用ModelFinder自动选择( RAxML使用GTRGAMMA );④ 不使用bootstrap评估。可自定义参数包括:输入序列类型、修剪模式(refseq、TrimAl、无操作)、建树软件(IQ-TREE和RAxML),替代模型、bootstrap(IQ-TREE可以选择UFBoot - Ultrafast Bootstrap Approximation)。

Fasta序列    Fasta示例
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提示:目前队列运行的任务有个,排队任务有个。