自2022年10月以来,中国大陆测序公开817个SARS-CoV-2序列,涵盖79个Pangolin谱系(https://ngdc.cncb.ac.cn/ncov/monitoring/country/China). 最大的谱系之一是BF.7(278,34%),其序列样本采自2022年10月至12月的北京(208,74.8%)、上海(30,10.8%)和福建(18,6.5%)。序列比较分析发现,中国主要传播流行的BF.7序列与国际BF.7及其18个亚系(截至2023年1月7日)完全不同,相较于国际BF.7序列增加了五个新突变,即ORF1a:V274L、ORF1b:L238F、S:C1243F、ORF7a:H47Y和ORF10:C29632T。这表明,在中国有一个独立的BF.7亚系在传播,近期也被国际科学家提出并命名为BF.7.14(https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/1470)。
更多信息新增新冠病毒基因组结构及注释、新冠病毒宿主分布、重要突变功能知识、新冠感染基因表达研究专题、主要株系序列变异比较、核酸引物区突变监测、和Omicron变异株监测7个功能模块。提供了新冠病毒基因组结构功能的最新认知,和当前主要流行株系的突变比较及时空监测。此外,基于生物审编技术还提供了重要序列突变对表型(包括感染力、传播力、免疫逃逸等)及核酸检测的可能影响,汇总了基于预测和多种实验手段验证的新冠潜在宿主,新冠感染人等宿主的表达谱研究,为开展动物-人-动物间新冠病毒传播的风险评估和疫情的精准防控提供了多维度信息知识。主要功能模块如下所示: