简介

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香蕉，芭蕉科芭蕉属一年生草本植物，植株丛生，有匐匍茎。香蕉为世界四大水果之一，产量高分布广、果肉营养丰富、香甜软糯。香蕉也是第四大粮食作物，仅次于水稻、小麦和玉米。野生香蕉是二倍体，含有大颗粒种子，但带有微小种子的二倍体或多倍体栽培品种（有些是杂交品种）或没有种子的三倍体杂交品种更适合人类食用生果。

地理分布

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香蕉原产印度，在中国有2000多年的历史，19世纪初传入中美洲，中美洲是当今世界主要的香蕉产区，南美洲的厄瓜多尔有“香蕉国”之称。

中国香蕉的主产地分布在两广、福建、台湾等地，优良品种有广东和福建的“龙牙蕉”“香牙蕉”以及台湾的“北蕉”等。

应用

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• 食用：香蕉为世界四大水果之一，产量高分布广、果肉营养丰富、香甜软糯。
• 药用：《日用本草》中记载了香蕉具有治疗热病烦渴、肺燥咳嗽、便秘、痔疮的药用价值。
• 贸易：除了供应中国国内市场外，香蕉在国际水果进出口贸易中占据重要地位。
• 保健：营养价值很高，富含维生素A、C和B6。它还含有大量的钙、钾和磷。
• 观赏：植株丛生，具匍匐茎，叶片长圆形，穗状花序下垂，香蕉树也具有极好的观赏价值。
• 其他工业原料：香蕉可以用于制造纤维、香蕉酒和香蕉啤酒。

基因组测序

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DH-Pahang是属于malaccensis亚种的M. acuminata的二倍体基因型。香蕉参考基因组序列的资金由ANR提供，与Genoscope和CIRAD（UMR AGAP）合作完成。Global Musa Genomics Consortium（GMGC）内的几个团队利用Roche/45和Sanger等技术获得了24,425个contig和7,513个scaffold，基因组总长度为472.2 Mb。其中，大约90%的组装是在647个scaffold中进行的，scaffold N50为1.3 Mb。基因组中鉴定出了36,542个蛋白编码基因。

2016 年，来自CIRAD的Martin等人开发了一套模块化生物信息学流程，以改善基因组序列的组装结果。这种方法带来了显著改进，将scaffold总数从7,513个减少到1,532个（即减少80%），scaffold N50从1.3 Mb（65个scaffold）增加到3.0 Mb（26个scaffold）。最终，89.5%的组装结果被锚定到11条染色体上，而之前只有70%。

来自巴黎索克莱大学的Belser等人利用牛津纳米孔长读长测序技术对Musa acuminata香蕉基因组进行了染色体尺度的组装。研究人员使用PromethION R9.4.1流式细胞获得了约93 Gb的测序数据集。得到的组装结果包括124个长度超过50 kbp的contig，累计大小为485 Mbp，contig N50为32 Mbp。

DH-PKW基因型属于Musa balbisiana，为种植的异型三倍体香蕉贡献了B-亚基因组。该项目由CATAS和BGI与CIRAD合作完成，采用了PacBio、Illumina和HI-C测序技术。使用了58.99 Gb（113×）的PacBio单分子长读长和86.34 Gb（166×）的Illumina 双端和配对读长进行组装，生成了492.77 Mb的scaffolds。最终组装的contig N50为1.83 Mb，scaffold N50为5.05 Mb。此外，还为DH-PKW构建了Hi-C文库，产生了72 Gb（138×）的Hi-C配对末端读长。最终，大小为430 Mb的组装结果和94.0%的基因被映射到11个染色体组上，基因注释鉴定了B基因组中的35,148个蛋白编码基因，其中33,137个位于11条拟染色体上。

Musa schizocarpa是一种原产于新几内亚岛的野生香蕉物种，在一些香蕉栽培品种中发现了该物种的遗传特征。该物种的基因组测序由法国测序中心Genoscope和CIRAD合作完成，得到了法国公司Génomique在Dynamo项目中的财务支持。通过Nanopore和光学图谱技术获得了Musa schizocarpa染色体规模的基因组序列，具有高等位基因N50值（>5Mb），预测到总共有32,809个蛋白编码基因。

参考文献

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