EPI_ISL_1173057

基因组信息

病毒株名 hCoV-19/USA/NY-PRL-2021_03_05_00C15/2021
序列号 EPI_ISL_1173057
宿主 Homo sapiens
数据来源 GISAID
采样日期 2021-03-03
采样地点 United States / New York / New York City
相关ID
谱系 B.1.1.101 (Version: 4.0.6)
序列完整度 Complete
质量评估 0/0/0/24/Yes
样本提供单位 Pandemic Response Lab - NYC
数据递交单位 Pandemic Response Lab, R&D
发布时间 2021-03-09 15:47:46

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 hCoV-19/USA/NY-PRL-2021_03_05_00C15/2021 (EPI_ISL_1173057)
SNP数目 24
Insertion数目 0
Deletion数目 2
Indel数目 0
相似度 99.91
质量评估分级 C
注释统计 26(downstream_gene_variant:1; synonymous_variant:7; intergenic_variant:2; missense_variant:13; upstream_gene_variant:3)
文件下载 (GFF3)
The variation information in this file was calculated based on sequence EPI_ISL_1173057.The original sequence can be obtained from GISAID's website.