2019新型冠状病毒信息库 - 基因组信息

基因组信息

病毒株名	hCoV-19/India/CH-NCDC-INSACOG-2209161/2020
序列号	EPI_ISL_1970195
宿主	Homo sapiens
数据来源	GISAID
采样日期	2020-12-11
采样地点	India / Chandigarh
相关ID
谱系	B.1.1.101 (Version: 4.0.6)
序列完整度	Complete
质量评估	0/0/0/29/Yes
样本提供单位
数据递交单位	NCDC Delhi, Biotechnology Division
发布时间	2021-05-11 23:13:55

基因组变异统计

参考序列	2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名	hCoV-19/India/CH-NCDC-INSACOG-2209161/2020 (EPI_ISL_1970195)
SNP数目	29
Insertion数目	0
Deletion数目	2
Indel数目	0
相似度	99.90
质量评估分级	C
注释统计	31(synonymous_variant:12; intergenic_variant:2; missense_variant:16; upstream_gene_variant:1)
文件下载 (GFF3)